Seicheamhú Metatranscriptome
Gnéithe Seirbhíse
● ídiú rRNA agus ullmhúchán treorach leabharlainne mRNA ina dhiaidh sin.
● Seicheamhú ar Illumina NovaSeq.
Buntáistí Seirbhíse
●Déan staidéar ar Athruithe ar Phobail Mhiocróbacha Choimpléascacha:Tarlaíonn sé seo ag an leibhéal tras-scríobhach agus déantar iniúchadh ar ghéinte nua féideartha.
●Idirghníomhaíochtaí Miocróbacha Pobail leis an Ósta nó leis an Timpeallacht a Mhíniú.
●Anailís Bhithfhaisnéiseach Chuimsitheach: Soláthraíonn sé seo léargais ar chomhdhéanamh tacsanomaíoch agus feidhmiúla pobail, chomh maith le hanailís dhifreálach ar léiriú géine.
●Anótáil Fhairsing Géine:Ag baint úsáide as bunachair shonraí feidhm ghéine cothrom le dáta le haghaidh faisnéise léiritheach géine na bpobal miocróbach.
●Tacaíocht Iar-Dhíolacháin:Síneann ár dtiomantas níos faide ná críochnú an tionscadail le tréimhse seirbhíse 3 mhí tar éis an díola. Le linn an ama seo, cuirimid gníomhaíochtaí leantacha tionscadail, cúnamh fabhtcheartaithe, agus seisiúin ceisteanna agus freagraí ar fáil chun dul i ngleic le haon cheisteanna a bhaineann leis na torthaí.
Sonraíochtaí Seirbhíse
| Ardán seicheamhaithe | Straitéis Seicheamhaithe | Sonraí molta | Rialú Cáilíochta Sonraí |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12Gb | Q30≥85% |
Riachtanais Shamplacha
| Tiúchan (ng/µL) | Méid iomlán (µg) | Toirt (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Seachadadh samplach
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seirbhísí iar-díola
Áirítear leis an anailís seo a leanas:
● Rialú Cáilíochta Sonraí a Sheicheamhú
● Tionól Trascríbhinní
● Anótáil agus Aimhreas Tacsanomaíoch
● Anótáil Fheidhmeach agus Flúirse
● Cainníochtú Slonn agus Anailís Difreálach
Dáileadh tacsanomaíoch gach sampla:
Anailís éagsúlachta béite: UPGMA
Nóta feidhmiúil – GO raidhse
Flúirse tacsanomaíochta difreálach – LEFSE
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn atá éascaithe ag seirbhísí seicheamhaithe meite-tras-trascríobhaíochta BMKGene trí bhailiúchán coimeádaithe foilseachán.
Lu, Z. et al. (2023) 'Caoinfhulaingt aigéadach ar bhaictéir den ord lachtáit a úsáideann baictéir den sórt sin rannchuidíonn Bacteroidales le haigéadóis cogansaí a chosc i ngabhar atá oiriúnaithe d'aiste bia ard-tiúchan',Cothú Ainmhithe, 14, lgh 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Amhrán, Z. et al. (2017) 'Micribiota croí-fheidhmiúil a réiteach i gcoipeadh soladstaide traidisiúnta trí aimplicain ard-thréchuir agus seicheamh meite-trascriptómaíochta',Teorainneacha i Micribhitheolaíocht, 8(JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. et al. (2022) 'Mícivíris Úrscéalta a Fuarthas amach ó Shuirbhé Meite-thrascriptomics ar an bhFungas Alternaria Phytopathogenic',Víris, 14(11), lch. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) 'Nochtann anailís mheite-trascriptome comhthreomhar díghrádú meitibilítí tánaisteacha plandaí ag ciaróga agus a gcuid siombóisí gut',Mhóilíneach Éiceolaíocht, 31(15), lgh. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
