-
Seicheamhú Metagenomic (NGS)
Tagraíonn Metagenome do bhailiúchán d'ábhar géiniteach iomlán de phobal measctha orgánach, mar mheitigenome comhshaoil, metagenome daonna, etc. Tá géanóim ann de mhiocrorgánaigh inshaothraithe agus neamhshaothraithe araon.Is uirlis mhóilíneach é seicheamhú metagenomic a úsáidtear chun anailís a dhéanamh ar na hábhair ghéanómacha mheasctha a bhaintear as samplaí comhshaoil, a sholáthraíonn faisnéis mhionsonraithe ar éagsúlacht agus ar líon na speiceas, struchtúr an daonra, caidreamh fíogéiniteach, géinte feidhmiúla agus líonra comhghaoil le fachtóirí comhshaoil.
Ardán:Illumina NovaSeq6000
-
Seicheamhú Metagenomic-Nanópóir
Is uirlis mhóilíneach é Metagenomics a úsáidtear chun anailís a dhéanamh ar na hábhair ghéanómacha measctha a bhaintear as samplaí comhshaoil, a sholáthraíonn faisnéis mhionsonraithe maidir le héagsúlacht agus raidhse speiceas, struchtúr daonra, caidreamh phylogenetic, géinte feidhmiúla agus líonra comhghaoil le fachtóirí comhshaoil, etc. le staidéir mheitigenomic.Chuir a fheidhmíocht den scoth maidir le fad léite go mór le hanailís mheitigenómach síos-srutha, go háirithe cóimeáil meitigenóim.Ag baint leasa as fad léimh, tá staidéar meitigenómach bunaithe ar Nana-póir in ann cóimeáil níos leanúnaí a bhaint amach i gcomparáid le meiteiginómaíocht gunna gráin.Foilsíodh gur éirigh le meitigenomics bunaithe ar Nanópóir géanóim iomlána agus dúnta baictéaracha a ghiniúint ó mhicribhithóim (Moss, EL, et. al,Biotech Dúlra, 2020)
Ardán:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Seicheamhú Amplicon-PacBio
Is méarlorg móilíneach foirfe é an fo-aonad ar rRNA 16S agus 18S, ina bhfuil réigiúin an-chaomhnaithe agus hipear-athróg, chun orgánaigh prócarótacha agus eocaryotic a shainaithint.Agus leas á bhaint as seicheamhú, is féidir díriú ar na hamplicons seo bunaithe ar na codanna caomhnaithe agus is féidir na réigiúin hipear-athróg a shainiú go hiomlán maidir le sainaithint mhiocróbach a chuireann le staidéir a chlúdaíonn anailís ar éagsúlacht mhiocróbach, tacsanomaíocht, fíolaigine, etc. Fíor-ama aon-mhóilín (SMRT ) cuireann seicheamhú ardán PacBio ar chumas léite fada an-chruinn a fháil, a d’fhéadfadh aimpliáin lánfhad a chlúdach (thart ar 1.5 Kb).Chuir an dearcadh leathnaithe ar an réimse géiniteach go mór le réiteach anótála speiceas i bpobal baictéir nó fungais.
Ardán:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Seicheamhú Amplicon-NGS
16S/18S/ITS is é is aidhm do sheicheamhú aimpliónna fíolaigine, tacsanomaíocht agus flúirse speiceas a nochtadh i bpobal miocróbach trí imscrúdú a dhéanamh ar tháirgí PCR de mharcóirí géiniteacha coimeádta ina bhfuil codanna an-chomhtháite agus hipear-inathraithe araon.Cumasaíonn tabhairt isteach na méarloirg mhóilíneach foirfe seo le Woeses et al,(1977) próifíliú micribhithóim gan aonrú.Ligeann seicheamhú 16S (baictéar), 18S (fungais) agus spásaire tras-scríofa Inmheánach (ITS, fungais) speicis fhlúirseacha chomh maith le speicis neamhchoitianta agus neamhaitheanta a shainaithint.Tá an teicneolaíocht seo tar éis éirí ina uirlis mhór i bhfeidhm go forleathan chun comhdhéanamh miocróbach difreálach a aithint i dtimpeallachtaí éagsúla, mar shampla béal an duine, intestines, feces, etc.
Ardán:Illumina NovaSeq6000
-
Athsheicheamhú Géanóim Iomlán Baictéarach agus Fungal
Uirlis ríthábhachtach is ea athsheicheamhú géanóim iomláin bhaictéarach agus fhungach chun géanóim na mbaictéar agus na bhfungas aitheanta a chomhlánú, chomh maith le géanóim iolracha a chur i gcomparáid nó le géanóim orgánach nua a mhapáil.Tá sé ríthábhachtach géanóim iomlána na mbaictéar agus na bhfungas a sheicheamhú chun géineomaí tagartha cruinne a ghiniúint, sainaithint mhiocróbach agus staidéir chomparáideacha eile ar ghéanóim a dhéanamh.
Ardán: Illumina NovaSeq 6000
-
Géanóm Fungal
Soláthraíonn Biomarker Technologies suirbhé ar ghéanóim, géanóm mín agus géanóm lánchríochnaithe fungasach ag brath ar shainsprioc taighde.Is féidir seicheamhú genome, cóimeáil agus anótáil feidhme a bhaint amach trí sheicheamhú den chéad ghlúin eile + seicheamhú tríú glúin a chomhcheangal chun cóimeáil genome ardleibhéil a bhaint amach.Is féidir teicneolaíocht Hi-C a úsáid freisin chun cóimeáil genome a éascú ag leibhéal crómasóim.
Ardán:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Tiománaí Illumina NovaSeq 6000
-
Géanóm Iomlán na baictéir
Soláthraíonn Biomarker Technologies seirbhís seicheamhaithe maidir le géanóm iomlán na mbaictéar a thógáil gan aon bhearna ar bith.Áirítear le príomh-sreabhadh oibre na mbaictéar tógáil genome iomlán seicheamhú tríú glúin, cóimeáil, anótáil fheidhmiúil agus anailís bithfhaisnéise chun cinn a chomhlíonann spriocanna taighde sonracha.Trí phróifíliú níos cuimsithí ar ghéanóm na mbaictéar, is féidir meicníochtaí bunúsacha a bhaineann lena bpróisis bhitheolaíocha a nochtadh, rud a d’fhéadfadh tagairt luachmhar a sholáthar do thaighde géanómaíochta ar speicis eocaryotic níos airde.
Ardán:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
