mRNA-seq (NGS) – De novo

Ceadaíonn seicheamhú mRNA próifíliú a dhéanamh ar gach trascríbhinn mRNA i gcealla faoi choinníollacha sonracha agus is teicneolaíocht í a úsáidtear go forleathan i réimsí taighde éagsúla. Tá an phíblíne mRNA-seq De novo BMKCloud deartha chun leabharlanna seicheamhaithe saibhrithe poly-A a anailísiú nuair nach bhfuil aon ghéanóm tagartha ar fáil. Tosaíonn an phíblíne le rialú cáilíochta, agus ina dhiaidh sin...de novotionól trascríbhinne agus roghnú tacair aonghéine. Réamhaisnéisíonn an anailís struchtúir aonghéine seicheamh códaithe (CDS) agus athrá seicheamh simplí (SSR). Ina dhiaidh sin, aimsíonn an anailís léirithe difreálach géinte a léirítear go difriúil (DEGanna) i measc na gcoinníollacha tástála, agus ina dhiaidh sin déantar anótáil fheidhmiúil agus saibhriú DEGanna chun léargais bhitheolaíocha a bhaint amach.