Tras-scríbhinn lánfhaid Nanopore

Is modh cumhachtach é seicheamhú trascríbhinní Nanopore chun cDNAanna lánfhaid a sheicheamhú, ag sainaithint agus ag cainníochtú isoform trascríbhinní go cruinn. Tá Píblíne Trascríbhinní Lánfhaid BMKCloud Nanopore deartha chun sonraí RNA-Seq a ghintear ar ardán Nanopore a anailísiú i gcoinne géanóm tagartha ardchaighdeáin atá dea-anótáilte, ag soláthar anailís cháilíochtúil agus chainníochtúil ag leibhéal an ghéin agus an trascríbhinne araon. Tar éis rialú cáilíochta, faightear seichimh neamh-chiméireacha lánfhaid (FLNC) agus mapáiltear seichimh chomhthola chuig an ngéanóm tagartha chun trascríbhinní iomarcacha a bhaint. Ón tacar trascríbhinní seo, déantar an léiriú a chainníochtú agus déantar géinte agus trascríbhinní a chuirtear in iúl go difriúil a shainaithint agus a anótáil go feidhmiúil. Cuimsíonn an phíblíne freisin anailís pholaidéinilithe malartach (APA), anailís splaisithe malartach, anailís athrá seicheamh simplí (SSR), tuar lncRNA agus spriocanna comhfhreagracha, tuar seichimh chódaithe (CDS), anailís teaghlaigh géine, anailís fachtóra trascríbhinne, tuar géinte nua agus anótáil fheidhmiúil trascríbhinní.