BMKCloud Log in
条形meirge-03

Nuacht

Éabhlóid GENOME

Genome De nua
Tionól|Cinneadh gnéis Chuir Biomarker Techonologies na hoibreacha seicheamhaithe iomlána agus na seirbhísí bithfhaisnéise páirteacha ar fáil.

Teibí

Áirítear le feinitíopa íocónach na maradragáin aguisíní cosúil le duilleog, béal feadánach gan fiacail, agus toircheas fireann a bhaineann le gor uibheacha toirchithe ar “phaiste goir” oscailte.Rinneamar géanóim fireann agus baineann a sheicheamhú den choiteann seadragon (Phyllopteryx taeniolatus) agus na speicis a bhfuil dlúthbhaint acu leis, an píbiasc ailigéadar (Syngnathoides biaculeatus).Léiríonn próifílí trascríobh ó úrscéal éabhlóideach, na haguisíní cosúil le duilleoga, go bhfuil sraith géinte a bhfuil baint acu go hiondúil le forbairt eití comhthofa chomh maith le saibhriú tras-scripteanna le haghaidh deisiú fíocháin fhéideartha agus géinte cosanta imdhíonachta.Fuarthas amach go raibh na mutants zebrafish le haghaidh scpp5, a chailltear i ngach syngnathids, in easnamh nó go raibh fiacla pharyngeal dífhoirmithe acu, ag tacú leis an hipitéis gur chuir cailliúint scpp5 le caillteanas fiacla i syngnathids.Aithníodh lócas toimhdiúil a chinneann inscne a ionchódaíonn géine amhr2y a bhaineann go sonrach le fir a roinntear le seadragon coiteann agus iasc píb ailigéadar. 

Abhair agus modhanna:

Ábhair

Fár seadragon coitianta (P. taeniolatus) agus dhá phíbiasc ailigéadar (S. biaculeatus) eiseamail.Baineadh úsáid as dhá mhara-dragon coitianta (duine amháin fireann agus baineann) agus dhá phíbiasc ailigéadar (duine amháin fireann agus baineann amháin) le haghaidh seicheamhú genome uile, agus úsáideadh dhá dhuine aonair seadragon coitianta fireann le haghaidh seicheamhú genome.

Straitéis Seicheamhaithe Géanóim

2Leabharlann 70/350 bp (Hiseq 2500) + Pacbio 20Kb (Sequel) nó Nanopore 30 Kb (MinION)+ Hi-C (NovaSeq 6000). seicheamhú, agus úsáideadh dhá dhuine aonair seadragon coitianta fireann eile le haghaidh seicheamhú genome.

Seicheamh Trascriptome

Fnó bailíodh seadragon coitianta, inchinn, súl, geolbhaigh, ae, croí, duáin, mesentery, stéig, matán, eite, craiceann, aguisíní cosúil le duilleog, magairlí, agus ubhagán.

Straitéis tionóil genome de novo

Canu (Cheartú) + WTDBG2 (Tionól) + Pilon (Polainnis) + Lachesis (Hi-C).

Príomhthorthaí

Fíor.-1.-Eochair-gnéithe-an-choitianta-seadragon-P.-taeniolatus-agus-an-ailigéadar-píb-iasc-S

Fíor 1. Príomhghnéithe an choiteann seadragon (P. taeniolatus) agus an phíbiasc ailigéadar (S. biaculeatus) agus a suíomhanna fíolaigineacha.

Fig.-2.-Moirfeolaíocht-agus-géiniteach-makeup-de-an-duilleog-cosúil-aguisíní-i-an-coitianta-seadragon-P

Fíor 2. Moirfeolaíocht agus comhdhéanamh géiniteach na n-aguisíní cosúil le duilleoga sa seadragon coitianta (P. taeniolatus).

Fig.-3.-Putative-gnéas-chinneadh-géine-sa-choitianta-seadragon-P.-taeniolatus-agus-an-ailigéadar-píb-iasc-S.-biaculeatus

Fíor 3. géine um chinneadh gnéis toimhdí sa seadragon coiteann (P. taeniolatus) agus an píbiasc ailigéadar (S. biaculeatus).

Fíor.-4

Fíor 4. feinitíopaí fiacail pharyngeal i mutants homozygous zebrafish scpp5.


Am postála: Jan-08-2022

Seol do theachtaireacht chugainn: