Seicheamhú Bisulfíte Laghdaithe Ionadaíochta (RRBS)
Braitheann seicheamhú bisulfít ionadaíochta laghdaithe (RRBS) ar shaibhriú réigiún saibhir in oileáin CpG trí scoilteadh MspI agus ansin roghnú méide blúirí 200-500/600 bps. Dá bhrí sin, ní dhéantar ach réigiúin atá gar do na hoileáin CpG a sheicheamhú, agus eisiamh ón anailís iad siúd a bhfuil oileáin CpG i bhfad i gcéin acu. Ligeann an próiseas seo, in éineacht le seicheamhú bisulfít, braiteadh ardtaifigh ar mheitileáil DNA, agus díríonn an cur chuige seicheamhaithe, PE150, go sonrach ar fhoircinn na n-ionchur seachas an lár, rud a mhéadaíonn éifeachtúlacht phróifíliú meitileála.
Tá an teicníc seo tagtha chun cinn mar rogha eile cost-éifeachtach agus éifeachtúil in ionad Seicheamhú Bisulfíte an Ghéanóim Iomláin (WGBS) i dtaighde meitiliúcháin DNA. Cé go soláthraíonn WGBS léargas cuimsitheach tríd an ngéanóm iomlán a scrúdú ag taifeach bonn aonair, is féidir lena chostas ard a bheith ina fhachtóir teorannaitheach, agus maolaíonn RRBS an dúshlán seo go straitéiseach trí chuid ionadaíoch den ghéanóm a anailísiú go roghnach. Is uirlis luachmhar í an mhodheolaíocht seo a chuireann ar chumas taighde meitiliúcháin DNA cost-éifeachtach agus a chuireann eolas ar mheicníochtaí eipiginéiteacha chun cinn.
Gnéithe Seirbhíse
● Seicheamhú ar Illumina NovaSeq.
● Éilíonn sé géanóm tagartha.
● Úsáidtear DNA Lambda chun éifeachtúlacht chomhshó bisulfite a mhonatóiriú.
● Déantar monatóireacht freisin ar éifeachtúlacht dhíleá MspI.
● Díleá dúbailte einsímí do shamplaí plandaí.
Buntáistí Seirbhíse
●Rogha eile cost-éifeachtach agus éifeachtúil in ionad WGBSCuireann sé ar chumas an anailís a dhéanamh ar chostas níos ísle agus le riachtanais shamplacha níos ísle.
●Ardán Iomlán:Cuirimid seirbhís den scoth aon-stad ar fáil ó phróiseáil samplaí, tógáil leabharlainne, agus seicheamhú go hanailís bithfhaisnéise.
●Saineolas fairsingTá rath orainn i raon éagsúil speiceas. Tugann BMKGENE breis agus deich mbliana de thaithí, foireann anailíse ard-oilte, ábhar cuimsitheach, agus tacaíocht iar-díolacháin den scoth.
Sonraíochtaí Seirbhíse
| Leabharlann | Straitéis Seicheamhúcháin | Aschur sonraí molta | Rialú cáilíochta |
| Leabharlann díleáite MspI agus cóireáilte le Bisulfite | Illumina PE150 | 8 GB | Q30 ≥ 85% Comhshó bisulfít > 99% Éifeachtúlacht gearrtha MspI > 95% |
Riachtanais Shamplacha
| Tiúchan (ng/µL) | Méid iomlán (µg) |
| |
| DNA geanómach | ≥ 30 | ≥ 1 | Díghrádú nó éilliú teoranta |
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Seachadadh samplach
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seirbhísí iar-díola
Áirítear leis an anailís BI:
● Rialú cáilíochta seicheamhaithe amh;
● Mapáil chuig an ngéanóm tagartha;
● Brath ar bhunanna meitilithe 5mC agus sainaithint móitífe;
● Anailís ar dháileadh meitiliúcháin agus comparáid samplach;
● Anailís ar Réigiúin Mheitileáilte go Difreálach (DMRanna);
● Anótáil fheidhmiúil ar ghéinte a bhaineann le DMRanna.
Rialú cáilíochta: éifeachtúlacht díleá (i mapáil an ghéanóim)
Rialú cáilíochta: comhshó bisulfíte (in eastóscadh eolais meitiliúcháin)
Léarscáil meitiliúcháin: dáileadh ar fud an ghéanóim meitiliúcháin 5mC
Comparáid shamplach: Anailís ar Phríomhchodanna
Anailís ar Réigiúin Mheitileáilte go Difreálach (DMRanna): léarscáil teasa
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn taighde a éascaítear le seirbhísí seicheamhú bisulfít géanóim iomláin BMKGene trí bhailiúchán coimeádta foilseachán.
Li, Z. et al. (2022) 'Athchlárú ard-dhílseachta i gcealla cosúil le Leydig trí ghníomhachtú CRISPR agus fachtóirí paracrine',PNAS Nexus, 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
Tian, H. et al. (2023) 'Anailís meitiliúcháin DNA ar fud an ghéanóim ar chomhdhéanamh coirp i gcúplaí monaisigíteacha na Síne',Iris Eorpach um Imscrúdú Cliniciúil, 53(11), lch. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
Wu, Y. et al. (2022) 'Meitileáil DNA agus cóimheas coime-go-cromáin: staidéar comhlachais ar fud an eipigéanóim i gcúplaí monaisigíteacha na Síne',Iris um Imscrúdú Inchríneolaíoch, 45(12), lgh. 2365–2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.
