Seicheamhú Déshulfite Léirithe Laghdaithe (RRBS)
Sonraíochtaí Seirbhíse
Ardán: ardán NovaSeq, PE150
Cineál leabharlainne: 200-400bp cuir isteach leabharlann DNA cóireáilte le bisulfite
Straitéis seicheamhaithe: Deireadh Péireáilte 150 bp
Aschur sonraí a mholadh: 10 Gb sonraí/sampla amh
Riachtanais Shamplacha
Cainníocht DNA: ≥ 2ug
Tiúchan DNA: ≥ 20ng/μl.
Íonacht: OD260/280 = 1.8 go 2.0 gan díghrádú nó éilliú RNA
Anailís bithfhaisnéisíochta
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Seachadadh samplach
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seirbhísí iar-díola
a.Staitisticí ailínithe genome tagartha
Léann staitisticí na léarscáilíochta
Stasistic na seicheamhaithe doimhneacht agus clúdach shuíomh C
Aclúdach carntha
Déifeachtacht igest de gach sampla
b.Brath láithreáin meitileúcháin
Liosta de na leibhéil meitilation ag suíomh C
BS comhshó
Mcytosine eitile
Dáileadh leibhéal meitileacháin
c.Léarscáil meitile
Gar fud an enome
Geilimint enome
d.Comparáid a dhéanamh idir leibhéil meitilation idir samplaí
Paeir Comhghaolú de mheitiliú CG
PMeitilation CA-CG
Clustering de mheitilation CG
d.Anailís meitiolaithe difreálach
Stáitistic an DMR
Dáileadh fad DMR
Hithe léarscáil
DDáileadh MR sa réigiún spriocdhírithe
