Seicheamhú déshulfít an ghéanóim iomláin (WGBS)
Seasann an teicníc seo, atá bunaithe ar chóireáil bisulfite ar DNA chun tiontú cítosíní neamhmeitilithe go úracil (C go U) a spreagadh, agus cítosíní meitilithe á bhfágáil gan athrú, mar an modheolaíocht óirchaighdeánach chun iniúchadh domhain a dhéanamh ar mheitileáil DNA, go sonrach an cúigiú suíomh i gcítosín (5-mC), rialtóir lárnach ar léiriú géine agus ar ghníomhaíocht cheallach.
Cuireann an teicníc seo réiteach aonbhonn ar fáil, rud a ligeann do thaighdeoirí imscrúdú cuimsitheach a dhéanamh ar an meitilóm agus patrúin neamhghnácha meitiliúcháin a nochtadh laistigh de na samplaí. Trí úsáid a bhaint as WGBS, is féidir le heolaithe léargas gan sárú a fháil ar thírdhreacha meitiliúcháin ar fud an ghéanóim, rud a thugann tuiscint níos casta ar na meicníochtaí eipiginéiteacha atá mar bhunús le próisis agus galair bhitheolaíocha éagsúla.
Gnéithe Seirbhíse
● Seicheamhú ar Illumina NovaSeq.
● Éilíonn sé géanóm tagartha.
● Cuirtear DNA Lambda leis chun éifeachtúlacht chomhshó bisulfite a mhonatóiriú.
Buntáistí Seirbhíse
●Caighdeán Óir le haghaidh Taighde Meitileála DNATá cruinneas ard agus dea-in-atáirgtheacht ag an teicneolaíocht aibí seo.
●Clúdach Leathan agus Rún Aonair-Bhonn:Déantar braiteadh suíomhanna meitiliúcháin ar leibhéal an ghéanóim uile.
●Ardán Iomlán:Cuirimid seirbhís aon-stad ar fáil ó phróiseáil samplaí, tógáil leabharlainne, seicheamhú go hanailís bithfhaisnéise.
●Saineolas fairsingTá réimse leathan tionscadal críochnaithe againn ar fud raon éagsúil speiceas. Tugann BMKGENE breis agus deich mbliana de thaithí, foireann anailíse ard-oilte, ábhar cuimsitheach, agus tacaíocht iar-díolacháin den scoth.
●Deis chun Páirt a Bhaint Amach le hAnailís Transcriptomics: Ag ceadú anailís chomhtháite ar WGBS le sonraí omics eile amhail RNA-seq.
Sonraíochtaí Samplacha
| Leabharlann | Straitéis Seicheamhúcháin | Aschur sonraí molta | Rialú cáilíochta |
| Bisulfít cóireáilte | Illumina PE150 | Doimhneacht 30x | Q30 ≥ 85% Comhshó bisulfít > 99% |
Riachtanais Shamplacha
| Tiúchan (ng/µL) | Méid iomlán (µg) | Ceanglais bhreise | |
| DNA geanómach | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Díghrádú nó éilliú teoranta |
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Seachadadh samplach
Eastóscadh DNA
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seachadadh sonraí
Áirítear leis an tseirbhís an anailís seo a leanas:
● Rialú cáilíochta seicheamhaithe amh;
● Mapáil chuig an ngéanóm tagartha;
● Brath ar bhunanna meitilithe 5mC;
● Anailís ar dháileadh meitiliúcháin agus ar anótáil;
● Anailís ar Réigiúin Mheitileáilte go Difreálach (DMRanna);
● Anótáil fheidhmiúil ar ghéinte a bhaineann le DMRanna.
Brath meitiliúcháin 5mC: cineálacha suíomhanna meitiliúcháin
Léarscáil meitiliúcháin. Dáileadh ar fud an ghéanóim de mheitileáil 5mC
Anótáil ar réigiúin ard-mheitiléite
Réigiúin Mheitileáilte go Difreálach: géinte gaolmhara
Réigiúin Mheitileáilte go Difreálach: anótáil géinte gaolmhara (Ontology Géine)
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn taighde a éascaítear le seirbhísí seicheamhú bisulfít géanóim iomláin BMKGene trí bhailiúchán coimeádta foilseachán.
Fan, Y. et al. (2020) 'Anailís ar phróifílí meitiliúcháin DNA le linn forbairt matáin chnámharlaigh caorach ag baint úsáide as seicheamhú bisulfít an ghéanóim iomláin',Géanómaíocht BMC, 21(1), lgh 1–15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) 'Suaitheadh níos nua i meitiliú aigéid dí-ocsairibonúicléasaigh in oibrithe atá nochtaithe do chlóiríd vinile',Tocsaineolaíocht agus Sláinte Thionsclaíoch, 38(7), lgh. 377–388. do: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'Caidrimh idir meitiliú géanóim, leibhéil RNA neamhchódaithe, mRNA agus meitibilítí i dtorthaí trátaí atá ag aibiú',An Irisleabhar Plandaí, 103(3), lgh. 980–994. do: 10.1111/TPJ.14778.
