BMKCloud Log in
条形 bratach-03

Bathar

Bacteria Genome coileanta

Bidh Biomarker Technologies a’ toirt seachad seirbheis sreathachaidh mu bhith a’ togail genoma iomlan de bacteria le beàrn neoni.Tha prìomh shruth-obrach de thogail genome iomlan bacteria a’ toirt a-steach sreath treas ginealach, co-chruinneachadh, comharrachadh gnìomh agus mion-sgrùdadh bioinformatic adhartach a’ coileanadh amasan rannsachaidh sònraichte.Tha ìomhaigh nas coileanta de genoma bacteria a’ toirt cumhachd do bhith a’ nochdadh uidheamachdan bunaiteach a tha mar bhunait air na pròiseasan bith-eòlasach aca, a dh’ fhaodadh cuideachd iomradh luachmhor a thoirt airson rannsachaidhean genomic ann an gnèithean eucaryotic nas àirde.

Àrd-ùrlar:Àrd-ùrlar Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq

PacBio Sequel II


Mion-fhiosrachadh seirbheis

Toraidhean Demo

Buannachdan seirbheis

● Iomadh ro-innleachdan sreathachaidh rim faighinn airson diofar amasan rannsachaidh

● Bacteria genome iomlan le 0 Gap cinnteach.

● Eòlas fìor mhath ann an co-chruinneachadh genome bacteria le còrr air 10,000 genome iomlan air a chruinneachadh.

● Sgioba taic theicnigeach às dèidh reic proifeasanta a 'coileanadh feumalachdan rannsachaidh nas sònraichte.

Sònrachaidhean seirbheis

SeicheamhRo-innleachd

Leabharlann

Càileachd cinnteach

An ùine tionndaidh tuairmseach

Nanopore 100X + Illumina 50X

Nanopore 20K

PE150

0 Beàrn

30 Làithean

PacBio HiFi 30X

PacBio 10K

Mion-sgrùdadh bioinformatics

● Raw dàta smachd càileachd

● Co-chruinneachadh genome

● Mion-sgrùdadh co-phàirtean genome

● Nota gnìomh gine

● Mion-sgrùdadh genomic coimeasach

2

Sampall riatanasan agus lìbhrigeadh

Sampall Riatanasan:

AirsonDNA earrannan:

Seòrsa Sampall

Suim

dùmhlachd

Purity

DNA earrannan

> 2 g

> 20 ng/μl

OD260/280= 1.6-2.5

Airson sampallan clò:

Seòrsa sampall Làimhseachadh sampall air a mholadh Eisimpleirean de stòradh agus lìbhrigeadh
Bacteria Thoir sùil air bacteria fo mhiocroscop agus cruinnich bacteria anns an ìre eas-chruthach aca

Cuir a-mach cultar bacteria (anns a bheil timcheall air 3-4.5e9 ceallan) gu eppendorf 1.5 no 2 ml.(Cum air deigh)

Centrifuge an tiùb airson 1 min aig 14000 g gus bacteria a chruinneachadh agus an supernatant a thoirt air falbh gu faiceallach

Ròin an tiùb agus reothadh na bacteria ann an nitrigin leaghaidh airson co-dhiù 30 mionaid.Stèidhich an tiùb ann am frids -80 ℃.

Reothaich na sampallan ann an nitrigin leaghaidh airson 3-4 uairean agus stòr ann an nitrigin leaghaidh no -80 ceum gu glèidheadh ​​​​fad-ùine.Tha feum air lìbhrigeadh sampall le deigh tioram.

Sruth Obrach Seirbheis

lìbhrigeadh sampall

Lìbhrigeadh sampall

Ag ullachadh leabharlainn

Togalach leabharlainn

Seicheamh

Seicheamh

Mion-sgrùdadh dàta

Mion-sgrùdadh dàta

Seirbheisean às deidh reic

Seirbheisean às deidh reic


  • Roimhe:
  • Air adhart:

  • 1.Circos de genome bacteria

    3

    2.Coding gine ro-innse

    4

    Mion-sgrùdadh genomics 3.Comparative: craobh phylogenetic

    5

    faigh cuòt

    Sgrìobh do theachdaireachd an seo agus cuir thugainn e

    Cuir do theachdaireachd thugainn: