条形 bratach-03

Toraidhean

Leabharlannan ro-dhèanta Illumina

Tha teicneòlas sreath-chàraidh Illumina, stèidhichte air Seicheamhachadh le Co-chur (SBS), na ùr-ghnàthachadh NGS a tha air a ghabhail os làimh air feadh an t-saoghail, agus tha e an urra ri còrr air 90% de dhàta sreath-chàraidh an t-saoghail a chruthachadh. Tha prionnsapal SBS a’ toirt a-steach ìomhaighean de chrìochnaichean ath-chuairteach le bileagan fluorescent fhad ‘s a thèid gach dNTP a chur ris, agus an uairsin air an sgoltadh gus leigeil le bhith a’ toirt a-steach an ath bhunait. Leis na ceithir dNTPan ath-chuairteach ceangailte ri crìochnaiche an làthair anns gach cearcall sreath-chàraidh, bidh farpais nàdarrach a’ lughdachadh claonadh cuir a-steach. Tha an teicneòlas ioma-chruthach seo a’ toirt taic do leabharlannan leughaidh singilte agus le ceann paidhir, a’ frithealadh raon de thagraidhean genomic. Tha comasan àrd-toraidh agus mionaideachd sreath-chàraidh Illumina ga shuidheachadh mar chlach-oisinn ann an rannsachadh genomic, a’ toirt cumhachd do luchd-saidheans iom-fhillteachd genomics fhuasgladh le mion-fhiosrachadh agus èifeachdas gun choimeas.

Leigidh an t-seirbheis sreath-sgrìobhaidh leabharlainn ro-dhèanta againn le luchd-ceannach leabharlannan sreath-sgrìobhaidh ullachadh bho dhiofar thùsan (mRNA, genome slàn, amplicon, leabharlannan 10x, am measg feadhainn eile). Às dèidh sin, faodar na leabharlannan seo a chuir chun ionadan sreath-sgrìobhaidh againn airson smachd càileachd agus sreath-sgrìobhaidh ann an àrd-ùrlaran Illumina.


Mion-fhiosrachadh Seirbheis

Toradh Taisbeanaidh

Feartan

Àrd-ùrlaran:Illumina NovaSeq 6000 agus NovaSeq X Plus

Modhan sreathachaidh:PE150 agus PE250

Smachd càileachd leabharlannan mus tèid sreath a dhèanamh

Dàta sreathachaidh QC agus lìbhrigeadh:lìbhrigeadh aithisg QC agus dàta amh ann an cruth fastq às dèidh dì-iomadachadh agus sìoladh leughaidhean Q30

 

 

Buannachdan Seirbheis

Iomadachd sheirbheisean Seicheamhachaidh:faodaidh an neach-ceannach roghnachadh sreath a rèir làn, cealla sruthadh, no a rèir na tha de dhàta a dhìth (sreath làn pàirt).

Eòlas farsaing air àrd-ùrlar sreathachaidh Illumina:le mìltean de phròiseactan dùinte le diofar ghnèithean. 

Lìbhrigeadh aithisg QC sreathachaidh:le meatairean càileachd, cruinneas dàta agus coileanadh iomlan a’ phròiseict sreathachaidh.

Pròiseas sreath-chàraidh aibidh:le ùine tionndaidh ghoirid.

Smachd Càileachd TeannBidh sinn a’ cur riatanasan teann càileachd càileachd an sàs gus dèanamh cinnteach gum bi toraidhean àrd-inbhe air an lìbhrigeadh gu cunbhalach.

 

 

Àrd-ùrlaran Eisimpleir

Àrd-ùrlar

Cealla Sruthaidh

Modh sreathachaidh

Aonad

Toradh tuairmseach

NovaSeq X

10B (8 sreathan)

PE150

Singilte Làn

Làn Pàirteach

375Gb / Làn

25B (8 sreathan)

PE150

Singilte Làn

Làn Pàirteach

1000 Gb/Làn

NovaSeq 6000

Cealla Sruthadh SP (2 shreath)

PE250

Cealla Sruthaidh

Singilte Làn

Làn Pàirteach

325-400 M leughaidhean / Làn

Cealla sruthadh S4 (4 sreathan)

PE150

Cealla Sruthaidh

Singilte Làn

Làn Pàirteach

~800 Gb / Làn

Riatanasan Sampall

 

Meud Dàta (X)

Dùmhlachd (qPCR/nM)

Meud

Seicheamh Làn Pàirteach

 

 

X ≤ 10 Gb

≥ 1 nM

≥ 25 μl

10 Gb < X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 25 μl

50 Gb < X ≤ 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 25 μl

X > 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 25 μl

Seicheamh Làn

Gach Làn

≥ 1.5 nM / Linn leabharlainn

≥ 25 μl / Linn leabharlainn

A bharrachd air dùmhlachd agus meud iomlan, tha feum air pàtran mullaich iomchaidh cuideachd.

Nota: Feumaidh sreath-loidhne sreathan leabharlannan iomadachd ìosal spìce-a-steach PhiX gus dèanamh cinnteach à gairm bunaiteach làidir.

Tha sinn a’ moladh leabharlannan ro-chruinnichte a chur a-steach mar shamhlaichean. Ma tha feum agad air BMKGENE gus leabharlannan a chruinneachadh, thoir sùil air

riatanasan na leabharlainn airson sreath sreathan pàirteach.

Meud na Leabharlainn (Mapa nam Beann)

Bu chòir am prìomh mhullach a bhith taobh a-staigh 300-450 bp.
Bu chòir gum biodh aon phrìomh mhullach ann an leabharlannan, gun truailleadh adapter agus gun primer dimensions.

Cuir fios thugainn mura h-eil na sampallan agad a’ coinneachadh ri riatanasan an stuth tòiseachaidh.

Sruth-obrach Seirbheis

ullachadh sampall

Smachd càileachd leabharlainn

Seicheamhachadh

Seicheamhachadh

Mion-sgrùdadh dàta

Smachd càileachd dàta

QC Sampall

Lìbhrigeadh pròiseict


  • Roimhe:
  • Air adhart:

  • Aithisg QC na Leabharlainn

    Thèid aithisg a thoirt seachad air càileachd na leabharlainn mus tèid sreath a chur ann an òrdugh, meud na leabharlainn a mheasadh, agus briseadh sìos.

     

    Aithisg QC sreathachaidh

     

    Clàr 1. Staitistig air dàta sreathachaidh.

    ID Sampall

    BMKID

    Leughaidhean amh

    Dàta Amh (bp)

    Leughaidhean glan (%)

    C20(%)

    C30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6,861,036,000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4,415,360,100

    96.00

    98.95

    93.89

    37.08

    Figear 1. Sgaoileadh càileachd air feadh leughaidhean anns gach sampall

    A9

    Figear 2. Sgaoileadh susbaint bunaiteach

    A10

    Figear 3. Sgaoileadh susbaint leughaidh ann an dàta sreathachaidh

    A11

     

    faigh luachan

    Sgrìobh do theachdaireachd an seo agus cuir thugainn i

    Cuir do theachdaireachd thugainn: