Log a-steach BMKCloud

Toraidhean

Seicheamhachadh DNA/RNA – Seicheamhair Nanopore

Seicheamhachadh DNA/RNA – Dealbh Sònraichte de Sheicheamhair Nanopore

'S e teicneòlas sreath chomharran dealain fìor-ùine aon-mhóileciuil stèidhichte air nano-phores a th' ann an sreath ONT, agus tha prionnsapal sreath gach àrd-ùrlair mar an ceudna. Ceanglaicheas DNA/RNA dà-shreath ri pròtain nano-phorach a tha freumhaichte anns a' biofilm agus a' sgaoileadh fo stiùireadh pròtain motair. Fo ghnìomhachd eadar-dhealachaidh bholtaids bho gach taobh den biofilm, bidh snàithleanan DNA/RNA a' dol tron phròtain seanail nanopore aig ìre sònraichte. Air sgàth nan eadar-dhealachaidhean ann an feartan ceimigeach nan diofar bhunaitean air an t-snàth DNA/RNA, nuair a thèid aon bhunait no moileciuil DNA tron t-sianal nanopore, bidh sin ag adhbhrachadh atharrachadh ann an diofar chomharran dealain. Le bhith a' lorg agus a' co-fhreagarrachd ris na comharran sin, faodar na seòrsaichean bunait co-fhreagarrach obrachadh a-mach, agus faodar lorg fìor-ùine an t-sreath a chrìochnachadh.

Cuir fios thugainn

Mion-fhiosrachadh Seirbheis

Toradh Taisbeanaidh

Mion-fhiosrachadh Seirbheis Feartan

Àrd-ùrlar	Meud na Leabharlainn	Toradh Dàta Teòiridheach (Gach Cealla)	Cruinneas aon-bhunait	Iarrtasan
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultra-fhada, cDNA-PCR	70-90Gb/Cealla	85-92%	Gairm SV, De novo, Sreathachadh làn-fhaid, Iso-Seq, Anotachadh gine, Lorg methylation DNA

Buannachdan Seirbheis

● Còrr is 5 bliadhna de eòlas air àrd-ùrlar sreath-sgrùdaidh PacBio le mìltean de phròiseactan dùinte le diofar ghnèithean.
● ’S e com-pàirtiche oifigeil Oxford Nanopore a th’ ann am BMKGENE, le teisteanas RNA/DNA dà-àrd-ùrlar.
● Tha modailean prìomh-shruthach de shreathairean ann le uidheamachd iomlan agus toradh sreathachaidh gu leòr.
● Stèidhichte air àrd-ùrlar Nanopore, chaidh còrr is 10 rannsachadh Denovo air beathaichean is lusan fhoillseachadh ann an irisean ainmeil gu h-eadar-nàiseanta.

Riatanasan Sampall

Seòrsa Sampall

Suim

Dùmhlachd (Qubit ®)

Meud

Purrachd

Feadhainn eile

DNA genomic

An urra ri riatanas dàta

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

Beinn shoilleir aig 260 nm, gun truailleadh

Feumar dùmhlachd a thomhas le Qubit agus Qubit/Nanopore ≤ 2

RNA iomlan

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; gun truailleadh

Luach RIN ≥7.5

Sruth-obrach Seirbheis

Ullachadh sampall

Togail leabharlainn

Seicheamhachadh

Mion-sgrùdadh dàta

Lìbhrigeadh pròiseict

Roimhe: Leabharlannan ro-dhèanta Illumina

Air adhart: Seicheamhachadh Briosgaidean Meudaichte-Locus Sònraichte (SLAF-Seq)

Measadh Càileachd Dàta air Sampall DNA

Clàr 1. Staitistig air dàta glan.

BMKID	amhSeqNum	Bun-SumAmh	glanSeqNum	glanSumBase	glanN50Len	glanN90Len	glanMeanLen	glanMaxLen	glanMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9

Measadh Càileachd Dàta air Sampall RNA

Clàr 1. Staitistig air dàta glan.

Ainm-fhaidhle	ID Luchd-dèiligidh	LeughÀireamh	Bun-Àireamh	N50	Fad Meadhanach	Fad as motha	Sgòr MeadhanachQ
RNA_BMK001	C2	8,947,708	4,047,230,083	398	452	129,227	C12