Bathar

Genome fungach

Bidh Biomarker Technologies a’ toirt seachad sgrùdadh genome, genome grinn agus genome làn-chrìochnaichte de fhungasan a rèir amas rannsachaidh sònraichte.Faodar seicheamh genome, co-chruinneachadh agus notaichean gnìomh a choileanadh le bhith a’ cothlamadh sreath an ath ghinealach + sreath treas ginealach gus co-chruinneachadh genome àrd-ìre a choileanadh.Faodar teicneòlas Hi-C a chleachdadh cuideachd gus co-chruinneachadh genome a dhèanamh aig ìre chromosome.

Àrd-ùrlar:PacBio Sequel II

Nanopore PromethION P48

Àrd-ùrlar Illumina NovaSeq

Cuir fios thugainn

Mion-fhiosrachadh seirbheis

Toraidhean Demo

Buannachdan seirbheis

● Iomadh ro-innleachdan sreathachaidh rim faighinn airson diofar amasan rannsachaidh

● Eòlas fìor mhath ann an co-chruinneachadh genome fungas le còrr air 10,000 genome làn-choileanta air a chruinneachadh.

● Sgioba taic theicnigeach às dèidh reic proifeasanta a 'coileanadh feumalachdan rannsachaidh nas sònraichte.

Sònrachaidhean seirbheis

Seirbheis	Ro-innleachd sreathachaidh	Càileachd cinnteach	An ùine tionndaidh tuairmseach
Mapa math fungas	Illumina 50X+Nanopore 100X	Contig N50≥2 Mb	35 làithean obrach
Mapa math fungas	PacBio HiFi 30X	Contig N50≥2 Mb	35 làithean obrach
Mapa làn-chrìochnaichte le pene fungach	Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	Co-mheas acair chromosome> 90%	45 làithean-obrach

Mion-sgrùdadh bioinformatics

● Raw dàta smachd càileachd

● Co-chruinneachadh genome

● Mion-sgrùdadh co-phàirtean genome

● Nota gnìomh gine

● Mion-sgrùdadh genomic coimeasach

Sampall riatanasan agus lìbhrigeadh

Sampall Riatanasan:

AirsonDNA earrannan:

Seòrsa Sampall	Suim	dùmhlachd	Purity
DNA earrannan	＞ 1.2 g	＞ 20 ng/μl	OD260/280= 1.6-2.5

Airson sampallan clò:

Seòrsa sampall

Làimhseachadh sampall air a mholadh

Eisimpleirean de stòradh agus lìbhrigeadh

Unicellular Fungas

Coimhead beirm fo mhiocroscop agus cruinnich iad aig an ìre eas-chruthach aca

Cuir thairis a’ chultar (anns a bheil timcheall air. 3-4.5e9 ceallan) gu eppendorf 1.5 no 2 ml.(Cum air deigh)

Centrifuge an tiùb airson 1 min aig 14000 g gus bacteria a chruinneachadh agus an supernatant a thoirt air falbh gu faiceallach

Ròin an tiùb agus reothadh na bacteria ann an nitrigin leaghaidh airson co-dhiù 1-3 h.Stèidhich an tiùb ann am frids -80 ℃.

Reothaich na sampallan ann an nitrigin leaghaidh airson 3-4 uairean agus stòr ann an nitrigin leaghaidh no -80 ceum gu glèidheadh fad-ùine.Tha feum air lìbhrigeadh sampall le deigh tioram.

Fungas Macro

Thathas a 'moladh feòil anns an ìre a tha a' fàs gu gnìomhach.

Nigh an stuth le uisge gun endotoxin, an uairsin 70% ethonal.

Sàbhail an sampall ann an cryo-tubes.