Long Neo-chòdachadh Sequencing-Illumina
Buannachdan seirbheis
●Co-sgrùdadh air mRNA agus lncRNA: le bhith a’ cothlamadh àireamhachadh ath-sgrìobhaidhean mRNA le sgrùdadh lncRNA agus na targaidean aca, tha e comasach sealladh farsaing fhaighinn air an uidheamachd riaghlaidh a tha mar bhunait don fhreagairt cealla.
●Eòlas farsaing: Bidh an sgioba againn a’ toirt beairteas de eòlas do gach pròiseact, le eachdraidh air a bhith a’ giullachd còrr air 23,000 sampall aig BMK a’ spangachadh diofar sheòrsaichean sampall agus pròiseactan lncRNA.
●Smachd càileachd teann: Bidh sinn a’ buileachadh prìomh phuingean-smachd thar gach ìre, bho ullachadh sampall is leabharlainn gu sreath agus bioinformatics. Tha an sgrùdadh mionaideach seo a’ dèanamh cinnteach gun tèid toraidhean àrd-inbhe a lìbhrigeadh gu cunbhalach.
●Taic Post-reic: Tha ar dealas a’ leudachadh nas fhaide na crìoch a’ phròiseict le ùine seirbheis 3-mìosan às deidh reic. Rè na h-ùine seo, bidh sinn a’ tabhann seiseanan leanmhainn pròiseict, cuideachadh fuasgladh cheistean, agus seiseanan Q&A gus dèiligeadh ri ceistean sam bith co-cheangailte ris na toraidhean.
Sampall riatanasan agus lìbhrigeadh
| Leabharlann | Àrd-ùrlar | Dàta air a mholadh | QC dàta |
| rRNA crìonadh leabharlann stiùiridh | Illumina airson PE 150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Nucleotides:
| Conc.(ng/μl) | Suim (μg) | Purity | Ionracas |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Pròtain cuibhrichte no gun truailleadh DNA air a nochdadh air gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; àrdachadh bun-loidhne cuingealaichte no gun a bhith ann |
● Lusan:
Root, gas no peatal: 450 mg
Duilleag no sìol: 300 mg
Toradh: 1,2 g
● beathach:
Cridhe no intestinal: 450 mg
Viscera no Brain: 240 mg
Meud: 600 mg
Cnàmhan, falt no craiceann: 1.5g
● Artrapod:
biastagan: 9g
Crustacea: 450 mg
● Fuil slàn:2 phìob
● Ceallan: 106 ceallan
● Serum agus Plasma: 6 ml
Lìbhrigeadh sampall air a mholadh
Container: tiùb centrifuge 2 ml (chan eilear a’ moladh foil staoin)
Bileag sampaill: Buidheann + ath-riochdachadh me A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Gluasad:
1. Dry-deigh: Feumaidh sampaill a bhith air am pacadh ann am pocannan agus air an tiodhlacadh ann an deigh tioram.
2. Tiùban RNAstable: Faodar sampallan RNA a thiormachadh ann an tiùb seasmhach RNA (me RNAstable®) agus a chuir a-steach aig teòthachd an t-seòmair.
Sruth Obrach Seirbheis
Dealbhadh deuchainn
Eisimpleir lìbhrigeadh
às-tharraing RNA
Togalach leabharlainn
Seicheamh
Mion-sgrùdadh dàta
Seirbheisean às deidh reic
Bith-fiosrachadh
Mion-sgrùdadh eadar-dhealaichte air abairt gine (DEGs).
Meudachadh abairt lncRNA - cruinneachadh
Saibhreachadh de ghinean targaid lncRNA
Mion-sgrùdadh suidheachadh co-mRNA agus lncRNA - Cuilbheart Circos (is e mRNA an cearcall meadhan agus is e lncRNA an cearcall a-staigh)
Dèan sgrùdadh air na h-adhartasan a tha air an cuideachadh le seirbheisean co-òrdanachaidh lncRNA BMKGene tro chruinneachadh de fhoillseachaidhean curanta.
Ji, H. et al. (2020) ‘Aithneachadh, ro-innse gnìomh, agus prìomh dhearbhadh lncRNA de lncRNAn co-cheangailte ri cuideam fuar ann an grùthan radain’, Aithisgean Saidheansail 2020 10: 1, 10(1), pp. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) ‘Mion-sgrùdadh tar-sgrìobhaidh aonaichte a’ nochdadh an uidheamachd dìonachd airson strain carp cumanta CyHV-3-Resistant’, Crìochan ann an Imdhun-eòlas, 12, td. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) ‘Prìomhachas Ioma-Omics stèidhichte air Amalachadh air Lìonraidhean Riaghlaidh RNA Endogenous farpaiseach ann an aillse sgamhain cealla beaga: feartan moileciuil agus tagraichean dhrogaichean’, Crìochan ann an Oncology, 12, td. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Sgaradh ginteil den lìonra co-èigneachadh gine a tha mar bhunait air photoynthesis ann am Populus', Plant Biotechnology Journal, 18(4), td. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Lìonra Riaghlaidh Cruinneil airson Briseadh Gine Neo-riaghlaichte agus Comharradh Metabolach Neo-àbhaisteach ann an Ceallan Dìth ann am Mion-àrainneachd Galar Uaighean agus Thyroiditis Hashimoto', Crìochan ann an Imdhun-eòlas, 13, td. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
