Sreathachadh Fada Neo-chòdaidh - Illumina
Buannachdan Seirbheis
●Mion-sgrùdadh co-cheangailte air mRNA agus lncRNALe bhith a’ cothlamadh tomhas tar-sgrìobhaidhean mRNA le sgrùdadh lncRNA agus na targaidean aca, tha e comasach sealladh farsaing fhaighinn air an dòigh riaghlaidh a tha aig bonn na freagairt cealla.
●Eòlas farsaingTha sinn air còrr is 230,000 sampall a phròiseasadh, a’ còmhdach amasan eadar-mheasgte nan sampallan agus nam pròiseactan. Bidh sinn a’ toirt ar pailteas eòlais gu gach pròiseact.
●Mion-sgrùdadh co-cheangailte air mRNA agus lncRNABidh sinn a’ cothlamadh tomhas tar-sgrìobhaidhean mRNA le sgrùdadh lncRNA agus na targaidean aca, agus mar sin bidh e comasach sealladh farsaing fhaighinn air a’ mheacanism riaghlaidh a tha aig bonn na freagairt cealla.
●Smachd Càileachd TeannBidh sinn a’ cur prìomh phuingean smachd an gnìomh thar gach ìre, bho ullachadh shampaill gu ullachadh leabharlainn, sreath-sgrùdadh agus bith-fhiosrachadh. Bidh ar sgrùdadh mionaideach a’ dèanamh cinnteach gu bheil toraidhean àrd-inbhe air an lìbhrigeadh gu cunbhalach.
●Notaichean CoileantaBidh sinn a’ cleachdadh iomadh stòr-dàta gus na Ginean a tha air an Cur an cèill gu Eadar-dhealaichte (DEGan) a chomharrachadh gu gnìomhach agus gus mion-sgrùdaidhean beairteachaidh co-fhreagarrach a dhèanamh. Tha an dòigh-obrach fharsaing seo a’ toirt sealladh dhuinn air na pròiseasan ceallach is moileciuil a tha aig bonn freagairt an transcriptome, a’ dèanamh cinnteach gum faigh thu a h-uile fiosrachadh a tha comasach mu dhàta an deuchainn agad.
●Taic às dèidh reicTha sinn a’ tuigsinn cho cudromach ’s a tha e a bhith an làthair, agus is e sin as coireach gu bheil ar dealas a’ dol nas fhaide na crìochnachadh a’ phròiseict le ùine seirbheis às dèidh reic 3 mìosan. Rè na h-ùine seo, bidh sinn a’ tabhann obair leanmhainn air a’ phròiseact, cuideachadh le fuasgladh dhuilgheadasan, agus seiseanan C&A gus dèiligeadh ri ceistean sam bith co-cheangailte ris na toraidhean.
Riatanasan Sampall agus Lìbhrigeadh
| Leabharlann | Àrd-ùrlar | Dàta a thathar a’ moladh | Càradh-cheartachaidh dàta |
| Leabharlann stiùiridh air a lughdachadh le rRNA | Illumina PE150 | 10-16 GB | Q30≥85% |
Niùclasaidean:
| Dùmhlachd (ng/μl) | Meud (μg) | Purrachd | Ionracas |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Truailleadh pròtain no DNA cuibhrichte no gun truailleadh idir air a shealltainn air a’ ghel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; àrdachadh bun-loidhne cuibhrichte no gun àrdachadh sam bith |
● Lusan:
Freumh, Gas no Peatal: 450 mg
Duilleag no sìol: 300 mg
Measan: 1.2 g
● Beathach:
Cridhe no Innidh: 450 mg
Innidh no Eanchainn: 240 mg
Fèithean: 600 mg
Cnàmhan, falt no craiceann: 1.5g
● Artrapòdan:
Biastagan: 9g
Crùbagan: 450 mg
● Fuil slàn:2 phìob
● Ceallan: 106 ceallan
● Seireamh agus Plasma: 6 ml
Lìbhrigeadh Sampall a thathar a’ moladh
Soitheach: tiùb centrifuge 2 ml (Chan eilear a’ moladh foil staoin)
Bileagan sampall: Buidheann+ath-aithris m.e. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Luingearachd:
1. Deigh thioram: Feumar sampallan a phacaigeadh ann am pocannan agus an tiodhlacadh ann an deigh thioram.
2. Tiùban RNAstable: Faodar sampallan RNA a thiormachadh ann an tiùb seasmhachd RNA (me RNAstable®) agus an cur aig teòthachd an t-seòmair.
Sruth-obrach Seirbheis
Dealbhadh deuchainn
Lìbhrigeadh sampall
às-tharraing RNA
Togail leabharlainn
Seicheamhachadh
Mion-sgrùdadh dàta
Seirbheisean às dèidh reic
Bith-fhiosrachadh
- Dàta amh
- Càradh-cheartachaidh dàta
- Co-thaobhadh genome
- Structar gine (Splicing eile, leasachadh structar gine agus ro-innse gine ùr)
- Meudachadh abairt gine
- Mion-sgrùdadh abairtean eadar-dhealaichte
- Anotachadh agus beairteachadh DEG + ginean targaid lncRNA eadar-dhealaichte air an cur an cèill
- Aithneachadh tar-sgrìobhaidh
- Aithneachadh lncRNA (glèidhteachas lncRNA agus lncRNA aithnichte)
- Ro-innse ginean targaid lncRNA
- Meudachadh abairt lncRNA
- Mion-sgrùdadh co-cheangailte le dàta mRNA
Mion-sgrùdadh air Eadar-dhealachadh Gine Abairt (DEGan)
Meudachadh air abairt lncRNA – cruinneachadh
Beairteachadh ghinean targaid lncRNA
Mion-sgrùdadh suidheachadh mRNA agus lncRNA còmhla – plota Circos (mRNA sa chearcall meadhanach agus lncRNA sa chearcall a-staigh)
Rannsaich na h-adhartasan a tha air an comasachadh le seirbheisean sreathanachaidh lncRNA BMKGene tro chruinneachadh taghte de fhoillseachaidhean.
Ji, H. et al. (2020) ‘Comharrachadh, ro-innse gnìomh, agus dearbhadh lncRNA cudromach de lncRNAs co-cheangailte ri cuideam fuachd ann an grùthan radain’,Aithisgean Saidheansail2020 10:1, 10(1), td. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) ‘Tha Mion-sgrùdadh Tar-sgrìobhaidh Amalaichte a’ nochdadh an Uidheam Dìonachd airson Seòrsa Carp Cumanta a tha an aghaidh CyHV-3’,Crìochan ann an Imdhìon-eòlas, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) ‘Prìomhachasachadh Stèidhichte air Amalachadh Ioma-Omics airson Lìonraidhean Riaghlaidh RNA Endogenous Farpaiseach ann an Aillse Sgamhain Cealla Beaga: Feartan Moileciuil agus Tagraichean Dhrogaichean’,Crìochan ann an Onco-eòlas, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) ‘Sgaradh ginteil air lìonra co-abairt gine a tha na bhunait airson foto-cho-chur ann am Populus’,Iris Bith-theicneòlas Lusan, 18(4), duilleagan 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) ‘Lìonra Riaghlaidh Cruinneil airson Neo-riaghlaichte Abairteachadh Gine agus Comharradh Metabolach Neo-àbhaisteach ann an Ceallan Dìonachd ann am Microàrainneachd Galar Graves agus Thyroiditis Hashimoto’,Crìochan ann an Imdhìon-eòlas, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
