Metabolaimigeachd
Feartan
●Neo-Metabolomics Targaideach (Discovery Metabolomics)
Stèidhichte air teicneòlas cromatagrafaidheachd leaghaidh-speictreamachd mais (LC-MS), leigidh metabolomics neo-chuimsichte le lorg neo-chlaon a dhèanamh air uiread de mheitibilitean beaga-mholacile 's as urrainn ann an sampallan bith-eòlasach leithid ceallan, figheagan, buill-bodhaig, no lionntan bodhaig. Bidh e a’ dèanamh mion-sgrùdadh coimeasach eadar buidhnean deuchainneach agus smachd, a’ sgrìonadh diofar mheitibilitean tro mhion-sgrùdadh staitistigeil.
● Metabolomics neo-thargaideach airson Lipids
A’ cleachdadh teicneòlas cromatagrafaidheachd leaghaidh-speictreamachd mais (LC-MS),nBidh Metabolomics airson Lipids targaideach a’ coileanadh lorg neo-chlaon air uiread de mholacilean lipid ’s a ghabhas ann an sampallan bith-eòlasach a’ gabhail a-steach ceallan, figheagan, buill-bodhaig, no lionntan bodhaig.
● Farsaing-Metabolomics Targaideach
Tha an t-seirbheis seo a’ cothlamadh gu foirfe buannachdan àrd-rèiteachaidh agus còmhdach farsaing teicneòlais neo-chuimsichte leis a’ mhothachadh àrd agus comasan tomhais ceart teicneòlais MRM (Sgrùdadh Ath-bhualadh Iomadach) cuimsichte. Tha an sruth-obrach mar a leanas: An toiseach, thathas a’ cleachdadh speactramaitreachd mais àrd-rèiteachaidh gus sganadh MS² ultra-àrd-chòmhdach a dhèanamh air sampallan gus speactra MS² fhaighinn de na metabolites “uile”. An uairsin, thathas a’ dèanamh comharrachadh ceart metabolite le bhith gan cothlamadh le leabharlann MS² àrd-rèiteachaidh (a’ còmhdach còrr air 25,000 metabolites, le iomadh speactra MS² àrd-rèiteachaidh àbhaisteach airson gach metabolite). An uairsin, thathas a’ toirt a-mach fiosrachadh paidhir ian MRM bhon speactra mais gus leabharlann sònraichte a stèidheachadh airson sampallan. Mu dheireadh, thathas a’ cleachdadh speactramaitreachd mais trì-cheàrnach le teicneòlas MRM airson tomhais ceart.
● Metabolaimigeachd Targaideach
Bidh metabolomics cuimsichte ag amas air grunn choimeasgaidhean targaid no metabolites gu lèir/pàirteach a tha an sàs ann an slighe shònraichte. Le bhith a’ cleachdadh stuthan àbhaisteach, bidh e a’ stèidheachadh dòigh lorg le sònrachas làidir, cugallachd àrd, agus ath-aithris math airson tomhas agus mion-sgrùdadh choimeasgaidhean targaid. Bidh e a’ gabhail ri inbhe taobh a-muigh còmhla ri inbhe a-staigh airson tomhas iomlan, le loidhneachd a’ lùb àbhaisteach a’ ruighinn os cionn 0.99 agus an cugallachd suas gu ìre ng/mL.
Buannachdan
●Àrd-ùrlar Lorgaidh Adhartach
-Uidheamaichte le speactramaidearan mais àrd-rùn den ìre as àirde agus speactramaidearan mais trì-cheàrnach, a’ comasachadh lorg agus mion-sgrùdadh aig an aon àm air mìltean de mheatabolaitean.
●Stòran-dàta Coileanta
- Stòran-dàta Poblach: A’ còmhdach METLIN, KEGG, HMDB, NP Atlas, agus Lipidmaps, a’ gabhail a-steach còrr is 500,000 metabolite.
- Taobh a-staigh na companaidhStòr-dàta sònraichte do lusan: Anns a bheil còrr is 25,000 metabolites, nam measg metabolites bun-sgoile agus àrd-sgoile.
- Taobh a-staigh na companaidhStòr-dàta sònraichte do bheathaichean/leighis: A’ gabhail a-steach còrr is 12,000 metabolites.
●Siostam Smachd Càileachd Teann
-Smachd càileachd teann a’ còmhdach seasmhachd ionnstramaidean, fuigheall stuthan, PCA sampall QC agus mion-sgrùdadh co-dhàimh gus dèanamh cinnteach à càileachd dàta earbsach.
●Comas Àrd airson Lorg Metabolites
- Neo-Metabolomics Targaideach: A’ lorg cuibheasachd de chòrr air 4,200 metabolites gach ruith, air leth freagarrach airson metabolites neo-aithnichte a sgrùdadh ann an sampallan agus metabolites a chomharrachadh ann an sampallan iom-fhillte.
- Farsaing-Metabolomics Targaideach (Lus): A’ lorg cuibheasachd de chòrr air 2,410 metabolites gach ruith, a’ gabhail a-steach metabolites bun-sgoile agus àrd-sgoile.
- Farsaing-Metabolomics Targaideach (Beathach): A’ lorg cuibheasachd de chòrr is 1,250 metabolites gach ruith.
- Metabolomics Targaideach: Pannalanairsoniomadh roinn metabolite.
●Mion-sgrùdadh Coileanta
-A’ tabhann còrr is 10 nithean anailis agus còrr is 20 clàr lèirsinn.
●Seirbheis às dèidh reic cùramach
-A’ toirt seachad co-chomhairle às dèidh reic agus taic airson mìneachadh aithisgean deireannach.
Sònrachaidhean Seirbheis
| Fuasgladh | Àrd-ùrlar | Ath-riochdachadh bith-eòlasach a thathar a’ moladh |
|---|---|---|
| Metabolomics Neo-Thargaideach | UHPLC-TOF-MS (Waters Xevo G2-XS QTof) | Sampall planntrais is meanbh-bhitheach: ≥ 6 Sampall bheathaichean: ≥ 10 Sampall clionaigeach: ≥ 30 A h-uile sampall leth-bhreac bith-eòlasach air a sgrùdadh gu neo-eisimeileach. |
| Metabolomics Farsaing | Uisge Xevo G2-XS QTOF + AB Sciex QTRAP 6500+ | Sampall planntrais: ≥ 3 |
| Metabolomics Targaideach | UHPLC-QQQ-MS (AB Sciex QTRAP 6500+) GC-MS (Agilent 7890-5977, Agilent 7820-5977) | Sampall planntrais: ≥ 3 Sampall bheathaichean: ≥ 6 |
Riatanasan Sampall
A bheil thu a’ faighneachd a bheil na sampallan agad a’ coinneachadh ris na slatan-tomhais againn? Briog an seo gus na slatan-tomhais againn fhaighinnriatanasan sampall as ùire.
Sruth-obrach Seirbheis
Cruinneachadh Eisimpleirean
Tarraing Meataibileit
Cruinneachadh Dàta
Mion-sgrùdadh Dàta
Lìbhrigeadh Dàta
1. Fuaim cùl-fhiosrachaidh agus giullachd dàta amh de dhroch chàileachd
2. Measadh Càileachd Dàta
2.1 Mion-sgrùdadh air prìomh phàirtean
2.2 Measadh ath-riochdachadh
3. Mìneachadh air Meatabilite
3.1 Nòtaichean stòr-dàta KEGG
3.2 Notaichean stòr-dàta HMDB
3.3 Nòtaichean stòr-dàta Lipidmaps
4. Mion-sgrùdadh Dàta Buidhneachaidh Sampallan (ath-aithrisean bith-eòlasach)≥3)
4.1 Mion-sgrùdadh air prìomh phàirtean na buidhne
4.2 Mion-sgrùdadh eadar-dhealachaidh ceàrnagan as lugha pàirteach ortogonal (OPLS-DA)
4.3 Mion-sgrùdadh metabolite eadar-dhealaichte buidhne
5. Taghadh Meataibileit Eadar-dhealaichte (ath-aithrisean bith-eòlasach≥3)
5.1 Mion-sgrùdadh atharrachaidh fillte eadar-dhealaichte
5.2 Plota bholcàno metabolite eadar-dhealaichte
5.3 Mapa teas cruinneachaidh metabolite eadar-dhealaichte
5.4 Plota co-dhàimh metabolite eadar-dhealaichte
5.5 Plota sgòr-Z airson metabolite eadar-dhealaichte
5.6 Mion-sgrùdadh plota radar metabolite eadar-dhealaichte
5.7 Plota fidheall metabolite eadar-dhealaichte
5.8 Plot bogsa metabolite eadar-dhealaichte
5.9 Mion-sgrùdadh gnìomh agus beairteachaidh air metabolite eadar-dhealaichte KEGG
5.10 Mion-sgrùdadh lùb ROC
5.11 Cruinneachadh k-means metabolite eadar-dhealaichte
5.12 Diagram Venn airson metabolite eadar-dhealaichte
1. Measadh Càileachd Dàta
↑Cmion-sgrùdadh co-cheangail(Sampall deuchainn/sampall càileachd càileachd)
↑Mion-sgrùdadh prìomh phàirtean ↑Mion-sgrùdadh cruinneachaidh meatabilit
2. Mìneachadh air Meatabilite
↑Nòta stòr-dàta KEGG↑Nòta stòr-dàta HMDB
↑Nòtaichean stòr-dàta Lipidmaps
3. Mion-sgrùdadh Dàta Buidhneachaidh Sampallan (ath-aithrisean bith-eòlasach≥3)
↑Mion-sgrùdadh air prìomh phàirtean na buidhne(2D/3D)
↑Mion-sgrùdadh eadar-dhealachaidh ceàrnagan as lugha pàirteach ortogonal (OPLS-DA)
4. Taghadh Meataibileit Eadar-dhealaichte (ath-aithrisean bith-eòlasach≥3)
↑Mion-sgrùdadh atharrachaidh fillte eadar-dhealaichte↑Plota bholcàno metabolite eadar-dhealaichte
↑Mapa teas cruinneachaidh metabolite eadar-dhealaichte↑Plota co-dhàimh metabolite eadar-dhealaichte
↑Plota sgòr-Z airson metabolite eadar-dhealaichte↑Mion-sgrùdadh plota radar metabolite eadar-dhealaichte
↑Plota fidheall metabolite eadar-dhealaichte↑Plota bogsa metabolite eadar-dhealaichte
↑Mion-sgrùdadh gnìomh agus beairteachaidh air metabolite eadar-dhealaichte KEGG
↑Mion-sgrùdadh lùb ROC↑Cruinneachadh k-means metabolite eadar-dhealaichte
↑ Diagram Venn metabolite eadar-dhealaichte
Wang X, Wang D, Liu X, Zhang H, Chen G, Xu M, Shen X, You C. Bidh am factar tar-sgrìobhaidh homeodomain coltach ri BEL1, SAWTOOTH1 (MdSAW1), ann am Malus domestica a’ neartachadh fulangas ubhal transgenic agus Arabidopsis ri cus cuideam sinc. Int J Biol Macromol. 2025 Cèitean;307(Pt 3):141948. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.141948. Epub 2025 Màrt 10. PMID: 40074134.
Ain QU, Hussain HA, Rahman L, Zhang Q, Rehman A, Hussain S, Uddin S, Imran A. Buaidh eadar-ghnìomhach nanoparticles uaine agus fungasan mycorrhizal arbuscular air fàs, ailtireachd siostam freumhaich, agus gabhail beathachaidh ann an arbhar Innseanach (Zea mays L.). Plant Physiol Biochem. Sultain 2025;226:110063. doi: 10.1016/j.plaphy.2025.110063. Epub 24 Cèitean 2025. PMID: 40441096.
Wang X, Luo J, Wang Q, Zhang Q, Zhao T, Liu Y, Li T, Liu X, Jiang J. Bidh Jasmonate a’ gnìomhachadh modúl coltach ri SlJAZ2/3-SlMYC3 a bhios a’ riaghladh gabhail K+ ann am freagairt tomato ri cuideam ìosal K+. J Integr Plant Biol. 2025 Lùnastal;67(8):2058-2077. doi: 10.1111/jipb.13941. Epub 2025 Cèitean 28. PMID: 40432500.
