Transcriptome làn-fhaid Nanopore

Tha sreath-sgrìobhaidh Nanopore na dhòigh chumhachdach airson sreath-sgrìobhaidh cDNA làn-fhaid a dhèanamh, a’ comharrachadh agus a’ tomhas isoforms tar-sgrìobhaidh gu ceart. Tha Pìob-loidhne Tar-sgrìobhaidh Làn-Fhad BMKCloud Nanopore air a dhealbhadh gus dàta RNA-Seq a chaidh a chruthachadh air àrd-ùrlar Nanopore a sgrùdadh an aghaidh genome iomraidh àrd-inbhe le deagh notaichean, a’ toirt seachad mion-sgrùdadh càileachdail agus cainneachdail aig ìre a’ ghine agus an tar-sgrìobhaidh. Às deidh smachd càileachd, gheibhear sreathan làn-fhaid neo-chimeric (FLNC) agus thèid sreathan co-aontachd a mhapadh chun genome iomraidh gus tar-sgrìobhaidhean ath-aithriseach a thoirt air falbh. Bhon t-seata tar-sgrìobhaidh seo, thèid an abairt a thomhas agus thèid ginean agus tar-sgrìobhaidhean a tha air an cur an cèill gu eadar-dhealaichte a chomharrachadh agus a chomharrachadh gu gnìomhach. Tha am pìob-loidhne cuideachd a’ toirt a-steach mion-sgrùdadh polyadenylation eile (APA), mion-sgrùdadh splicing eile, mion-sgrùdadh ath-aithris sreath sìmplidh (SSR), ro-innse lncRNA agus targaidean co-fhreagarrach, ro-innse sreathan còdaidh (CDS), mion-sgrùdadh teaghlaich gine, mion-sgrùdadh factar tar-sgrìobhaidh, ro-innse ginean ùra agus notaichean gnìomhach air tar-sgrìobhaidhean.