Pacbio Tar-sgrìobhadh làn-fhaid

Leigidh Sreathachadh Transcriptome Làn-Fhad PacBio, Isoseq, le bhith a’ comharrachadh isoforms tar-sgrìobhaidh gu ceart, a’ toirt solas do polyadenylation agus splicing eile, agus a’ leantainn gu mion-sgrùdadh nas cruinne air abairtean gine. Tha loidhne-phìoban Transcriptome Làn-Fhad BMKCloud PacBio air a dhealbhadh gus leabharlannan cDNA a sgrùdadh a chaidh a shreathachadh ann am modh Sreathachadh Co-aontachd Cearcallach (CCS) agus a’ comharrachadh sreathan Neo-Chimeric Làn-Fhad (FLNC), a tha an uairsin air an cruinneachadh ann an tar-sgrìobhaidhean neo-ath-aithriseach. Bidh mion-sgrùdadh BUSCO às dèidh sin a’ measadh iomlanachd cruinneachadh an transcriptome. Bhon transcriptome a chaidh a chruinneachadh, thèid iomadh mion-sgrùdadh a dhèanamh: splicing eile, ath-aithris sreath sìmplidh (SSR), ro-innse lncRNA agus ginean targaid co-fhreagarrach, ro-innse ginean ùra, mion-sgrùdadh teaghlaich gine, mion-sgrùdadh factaran tar-sgrìobhaidh, agus anotachadh gnìomh de thar-sgrìobhaidhean.