-
Seicheamh metatranscriptome
Tha seicheamh metatranscriptome a’ comharrachadh faireachdainn gine de mhicroban (an dà chuid eukaryotes agus prokaryotes) taobh a-staigh àrainneachdan nàdarra (ie ùir, uisge, muir, feces, agus gut.). de ghnèithean, mion-sgrùdadh beairteachadh gnìomh de ghinean a tha air an cur an cèill gu eadar-dhealaichte, agus barrachd.
Àrd-ùrlar: Àrd-ùrlar Illumina NovaSeq
-
Genome fungach
Bidh Biomarker Technologies a’ toirt seachad sgrùdadh genome, genome grinn agus genome làn-chrìochnaichte de fhungasan a rèir amas rannsachaidh sònraichte.Faodar seicheamh genome, co-chruinneachadh agus notaichean gnìomh a choileanadh le bhith a’ cothlamadh sreath an ath ghinealach + sreath treas ginealach gus co-chruinneachadh genome àrd-ìre a choileanadh.Faodar teicneòlas Hi-C a chleachdadh cuideachd gus co-chruinneachadh genome a dhèanamh aig ìre chromosome.
Àrd-ùrlar:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Àrd-ùrlar Illumina NovaSeq
-
Innealan-ciùil
Tha BMKCloud na phrìomh àrd-ùrlar bith-fiosrachaidh a bheir seachad fuasgladh aon-stad airson prògraman genomic, anns a bheil earbsa farsaing aig luchd-rannsachaidh ann an grunn raointean a’ toirt a-steach eòlas meidigeach, àiteachais, àrainneachd, msaa. , goireasan coimpiutaireachd, stòr-dàta poblach, cùrsaichean bioinformtic air-loidhne, msaa. Tha grunn innealan bith-fiosrachaidh air an cleachdadh gu tric aig BMKCloud a’ toirt a-steach comharrachadh gine, innealan ginteil mean-fhàs, ncRNA, smachd càileachd dàta, co-chruinneachadh, co-thaobhadh, às-tharraing dàta, mùthaidhean, staitistig, gineadair figear, sreath mion-sgrùdadh, msaa.
-
Bacteria Genome coileanta
Bidh Biomarker Technologies a’ toirt seachad seirbheis sreathachaidh mu bhith a’ togail genoma iomlan de bacteria le beàrn neoni.Tha prìomh shruth-obrach de thogail genome iomlan bacteria a’ toirt a-steach sreath treas ginealach, co-chruinneachadh, comharrachadh gnìomh agus mion-sgrùdadh bioinformatic adhartach a’ coileanadh amasan rannsachaidh sònraichte.Tha ìomhaigh nas coileanta de genoma bacteria a’ toirt cumhachd do bhith a’ nochdadh uidheamachdan bunaiteach a tha mar bhunait air na pròiseasan bith-eòlasach aca, a dh’ fhaodadh cuideachd iomradh luachmhor a thoirt airson rannsachaidhean genomic ann an gnèithean eucaryotic nas àirde.
Àrd-ùrlar:Àrd-ùrlar Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq
PacBio Sequel II
-
RNA beag
Tha RNAn beaga nan seòrsa de RNA goirid neo-chòdachadh le fad cuibheasach de 18-30 nt, a’ toirt a-steach miRNA, siRNA agus piRNA.Thathas air aithris gu mòr gu bheil na RNAn beaga sin an sàs ann an grunn phròiseasan bith-eòlasach leithid truailleadh mRNA, casg air eadar-theangachadh, cruthachadh heterochromatin, msaa. Tha àrd-ùrlar anailis sreathachaidh a’ toirt a-steach mion-sgrùdadh àbhaisteach agus mèinneadh dàta adhartach.Air bunait dàta RNA-seq, faodaidh mion-sgrùdadh àbhaisteach comharrachadh agus ro-innse miRNA a choileanadh, ro-innse gine targaid miRNA, mion-sgrùdadh notaichean agus faireachdainn.Tha mion-sgrùdadh adhartach a’ comasachadh sgrùdadh agus às-tharraing miRNA gnàthaichte, gineadh diagram Venn, miRNA agus togail lìonra gine targaid.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Tha NGS-WGS na àrd-ùrlar anailis ath-sheicheamh genome slàn, a tha air a leasachadh air bunait eòlas beairteach ann am Biomarker Technologies.Tha an àrd-ùrlar seo a tha furasta a chleachdadh a’ ceadachadh sruth-obrach anailis aonaichte a chuir a-steach gu sgiobalta le bhith dìreach a’ suidheachadh beagan paramadair bunaiteach, a tha a’ freagairt air dàta sreath DNA a chaidh a chruthachadh bho àrd-ùrlar Illumina agus àrd-ùrlar sreath BGI.Tha an àrd-ùrlar seo air a chleachdadh air frithealaiche coimpiutaireachd àrd-choileanadh, a bheir cumhachd do mhion-sgrùdadh dàta fìor èifeachdach ann an ùine glè bheag.Tha mèinneadh dàta pearsanaichte ri fhaighinn air bunait mion-sgrùdadh àbhaisteach, a’ toirt a-steach ceist gine mutated, dealbhadh primer PCR, msaa.
-
mRNA (iomradh)
Is e Transcriptome an ceangal eadar fiosrachadh ginteil genomic agus proteome gnìomh bith-eòlasach.Is e riaghladh ìre tar-sgrìobhaidh am modh riaghlaidh fàs-bheairtean as cudromaiche agus as fharsainge.Faodaidh seicheamh tar-sgrìobhaidh an tar-sgrìobhadh a leantainn aig àm sam bith no fo chumha sam bith, le rùn neo-mhearachdach gu aon nucleotide. sampall ath-sgrìobhaidhean sònraichte.
Aig an àm seo, tha teicneòlas seicheamh tar-sgrìobhaidh air a chleachdadh gu farsaing ann an agronomy, leigheas agus raointean rannsachaidh eile, a’ toirt a-steach riaghladh leasachadh bheathaichean is phlanntaichean, atharrachadh àrainneachd, eadar-obrachadh dìonachd, sgìreachadh gine, mean-fhàs ginteil gnè agus lorg tumhair is galair ginteil.
-
Metagenomics (NGS)
Tha an àrd-ùrlar anailis seo air a dhealbhadh airson mion-sgrùdadh dàta metagenomic gunna-gunna air bunait bliadhnaichean de eòlas.Tha e a’ toirt a-steach sruth-obrach amalaichte anns a bheil grunn de mhion-sgrùdaidhean metagenomics a dh’ fheumar gu cumanta, a’ gabhail a-steach giullachd dàta, sgrùdaidhean ìre gnè, sgrùdaidhean ìre gnìomh gine, binneachadh metagenome, msaa. , suidheachadh paramadair, gineadh figear pearsanaichte, msaa.
-
LncRNA
Is e seòrsa de ath-sgrìobhaidhean le faid nas fhaide na 200 nt a th’ ann an RNAn neo-chòdachadh fada (lncRNA), nach urrainn pròtainean a chòdachadh.Tha fianais tionalach a’ nochdadh gu bheil a’ mhòr-chuid de lncRNAn dualtach a bhith obrachail.Tha teicneòlasan seicheamh àrd-threabhadh agus innealan sgrùdaidh bith-fiosrachaidh a’ toirt cumhachd dhuinn sreathan lncRNA agus fiosrachadh suidheachaidh fhoillseachadh nas èifeachdaiche agus ar stiùireadh gu lorg lncRNAn le gnìomhan riaghlaidh deatamach.Tha BMKCloud moiteil àrd-ùrlar mion-sgrùdadh sreath lncRNA a thoirt don luchd-ceannach againn gus mion-sgrùdadh lncRNA luath, earbsach agus sùbailte a choileanadh.
-
GWAS
Tha sgrùdadh comann air feadh genome (GWAS) ag amas air caochlaidhean ginteil (genotype) a chomharrachadh a tha co-cheangailte ri feartan sònraichte (phenotype).Bidh sgrùdaidhean GWA a’ sgrùdadh comharran ginteil a ’dol thairis air genoma iomlan de àireamh mhòr de dhaoine fa-leth agus a’ ro-innse comainn genotype-phenotype le mion-sgrùdadh staitistigeil aig ìre sluaigh.Dh’ fhaodadh ath-sheicheamh làn-genome faighinn a-mach a h-uile caochladh ginteil.A’ ceangal ri dàta phenotypic, faodar GWAS a ghiullachd gus SNPan co-cheangailte ri phenotype, QTLs agus ginean tagraiche a chomharrachadh, a tha gu làidir a’ toirt taic do ghintinn bheathaichean/lusan an latha an-diugh.Tha SLAF na ro-innleachd seicheamh genome nas sìmplidhe fèin-leasaichte, a tha a’ lorg comharran sgaoilte air feadh genome, SNP.Faodar na SNPan sin, mar chomharran ginteil moileciuil, a phròiseasadh airson sgrùdaidhean co-cheangail le comharran cuimsichte.Is e ro-innleachd cosg-èifeachdach a th’ ann ann a bhith a’ comharrachadh atharrachaidhean ginteil co-cheangailte ri feartan iom-fhillte.
-
Ath-sgrìobhaidhean làn-ùine Nanopore
Tha isoforman iom-fhillte agus caochlaideach eile ann am fàs-bheairtean nan dòighean ginteil cudromach airson a bhith a’ riaghladh faireachdainn gine agus iomadachd pròtain.Tha comharrachadh ceart de structaran tar-sgrìobhaidh mar bhunait airson sgrùdadh domhainn air pàtrain riaghlaidh faireachdainn gine.Tha àrd-ùrlar sreathachaidh Nanopore air sgrùdadh tar-sgrìobhaidh a thoirt gu ìre isoform.Tha an àrd-ùrlar anailis seo air a dhealbhadh gus mion-sgrùdadh a dhèanamh air dàta RNA-Seq a chaidh a chruthachadh air àrd-ùrlar Nanopore air bunait genoma iomraidh, a choileanas mion-sgrùdaidhean càileachdail is cainneachdail ann an ìre gine agus ìre tar-sgrìobhaidhean.
-
circ-RNA
'S e seòrsa de RNA neo-còdaidh a th' ann an cearcall RNA (circRNA), a chaidh a lorg o chionn ghoirid gu bheil pàirt chudromach aca ann an lìonraidhean riaghlaidh a tha an sàs ann a bhith a' leasachadh, strì an aghaidh na h-àrainneachd, msaa. tha cinn circRNA air an ceangal ri chèile gus structar cruinn a chruthachadh, a shàbhaileas iad bho bhith a’ cnàmhadh exonuclease agus a tha nas seasmhaiche na a’ mhòr-chuid de RNA sreathach.Thathas air faighinn a-mach gu bheil gnìomhan eadar-dhealaichte aig CircRNA ann a bhith a’ riaghladh faireachdainn gine.Faodaidh CircRNA coileanadh mar ceRNA, a tha a’ ceangal miRNA gu farpaiseach, ris an canar spong miRNA.Tha àrd-ùrlar anailis sreathachaidh CircRNA a’ toirt cumhachd do mhion-sgrùdadh structar agus faireachdainn circRNA, ro-innse targaidean agus mion-sgrùdadh còmhla le seòrsachan eile de mholacilean RNA
