Pròtain-eòlas
Feartan
●Pròtain-eòlas Càileachdail: A’ cleachdadh LC-MS/MS gus co-dhèanamh phròtain a chomharrachadh ann an sampallan iom-fhillte (stiallan gel SDS-PAGE, IP, Co-IP, Pull-down). Buannachdan: Gun chrìoch air àireamh nan sampallan, lorg luath, giullachd shìmplidh sìmplidh, toradh àrd, agus comas pròtainean ìosal-phailteas a lorg.
● Pròtaineamaigs Cainneachdail Gun Leubail: Teicneòlas gun leubail le lorg sampall fa leth. A’ tomhas phròtainean le bhith a’ dèanamh coimeas eadar dian chomharran peptide ann an dàta speactramaitreachd mais. Buannachdan: Obrachadh sìmplidh, toradh àrd (gun chrìoch àireamh sampall), agus cleachdadh farsaing (freagarrach airson coimeas eadar-dhealaichte pròtain “làthaireachd/neo-làthaireachd” thar ghnèithean).
● Pròtaineamaigs Meudach DIA: A’ gabhail ri modh togail neo-eisimeileach bho dhàta (DIA), a’ sganadh nan ian uile ann an uinneagan roinnte gus fiosrachadh iomlan mu na h-ianan a ghlacadh. Buannachdan: Ath-aithris nas fheàrr, còmhdach pròtain nas àirde, agus tomhas nas cruinne na modh DDA (TMT/Label Free), freagarrach airson sgrùdaidhean sampall mòr.
● Pròtaineamaigs Meudach gun Leubail 4D/Pròtaineamaigs Meudach 4D-DIA: Stèidhichte air speactrometer mais Bruker timsTOF, a’ cur gluasadachd ian (earrann-tarsainn bualadh) ri dealachadh 3D traidiseanta. Buannachdan: Cleachdadh agus cruinneas ian nas fheàrr, leasachadh coileanta ann an doimhneachd còmhdaich, cugallachd agus toradh; doimhneachd comharrachaidh nas àirde na an dòigh 3D traidiseanta.
● Proteomics Meudach Saor bho Leubail Astral/Proteomics Meudach DIA Astral: Stèidhichte air speactrometer mais àrd-rùn OrbitrapTM AstralTM. Buannachdan: Toradh nas àirde (100+ sampall/latha le caisead 8-mionaidean), còmhdach nas doimhne (8,000+ pròtainean air an lorg ann an ceallan Hela ann an 8 mionaidean), agus cugallachd nas àirde (nas lugha de shampall a dhìth).
● Pròtaineamaigs Meudach TMT: A’ cleachdadh 18 tagaichean isotop gus peptidean a chomharrachadh airson lorg aig an aon àm air 18 sampallan. Buannachdan: Seasmhachd àrd (glè bheag de bhacadh seasmhachd ionnstramaid, mearachd siostaim bheag) agus cugallachd àrd (tha bloighdeadh a’ lughdachadh iom-fhillteachd sampallan, a’ leasachadh lorg pròtain ìosal-phailteas).
● Pròtain-eòlas Targaideach PRM: Teicneòlas targaideach àrd-rèiteachaidh airson lorg roghnach phròtainean/peptidean targaid. Buannachdan: A’ comasachadh tomhas coimeasach/iomlan agus dearbhadh thoraidhean pròtain-eòlas cainneachdail; gun bhacadh air antibody, cleachdadh nas fharsainge na Western Blot agus ELISA.
Buannachdan
● Uidheam Adhartach: Uidheamachadh le àrd-ùrlaran pròtaineamaigs àbhaisteach agus speactramaitearan mais àrd-dhoimhne adhartach (m.e., 4D, Astral).
● Lorgaireachd Sheasmhach: Bidh siostaman smachd càileachd teann a’ dèanamh cinnteach à pròiseasan deuchainn cunbhalach agus seasmhach.
● Toraidhean earbsach: Bheir mion-sgrùdadh càileachdail is cainneachdail aig an aon àm seachad dàta coimeasach air abairt, cuideam moileciuil, pailteas agus dàta cudromach eile airson gach buidheann.
● Fèin-ghluasad Àrd: Leigidh siostaman LC-MS fèin-ghluasadach le mion-sgrùdadh luath agus coileanadh dealachaidh sàr-mhath.
Sònrachaidhean Seirbheis
| Coimeas eadar Dòighean-obrach Proteomics Neo-thargaideach | ||||
| Gun leubail | DIA | TMT | ||
| Lipéadachadh | NO | NO | THA | |
| Modh Sganadh Dàta | DDA | DDA | DIA | DDA |
| Ath-riochdachadh | Ìosal | Àrd | Àrd | |
| Mothachaidh | Ìosal | Àrd | Àrd | |
| Ioma-fhillteachadh | NO | THA | NO | THA |
| Iarrtas | A’ dèanamh coimeas eadar làthaireachd/neo-làthaireachd phròtain | Sampallan mòra | Mion-sgrùdadh air diofar bhaidsean de shamhlaichean | A’ dèanamh coimeas eadar abairt pròtain eadar-dhealaichte anns an aon ghnè agus clò |
| Cruinneas | ★ | ★★(4D/Astral DlA ★★★) | ★★ | |
| Àireamh Lorgaidh | ★ | ★★(4D/Astral D| A★★★) | ★★ | |
Riatanasan Sampall
A bheil thu a’ faighneachd a bheil na sampallan agad a’ coinneachadh ris na slatan-tomhais againn? Briog an seo gus na slatan-tomhais againn fhaighinnriatanasan sampall as ùire.
Sruth-obrach Seirbheis
Cruinneachadh Eisimpleirean
Tarraing Pròtain
Cnàmhadh einsímeach
Dealachadh
Cruinneachadh Dàta
Mion-sgrùdadh Dàta
Lìbhrigeadh Dàta
Pròtaineamaigs Càileachdail
1. Fuasgladh/gel pròtain: clàr thoraidhean càileachdail
2. Toraidhean Rannsachaidh Stòr-dàta
2.1 Liosta de earrannan peptide a chaidh a mhaidseadh ann an rannsachadh an stòr-dàta
2.2 Liosta de phròtainean a chaidh a mhaidseadh ann an rannsachadh an stòr-dàta
2.3 Liosta de na h-atharrachaidhean a chaidh a mhaidseadh ann an rannsachadh an stòr-dàta (fosfaraileachadh, ubiquitinachadh, msaa.)
3. Dàta amh
Pròtaineamaigs Cainneachdail(Gun Leubail/DIA/TMT)
1. Ro-phròiseasadh Dàta
1.1 Rannsachadh Stòr-dàta Pròtain
2. Mion-sgrùdadh air Abairteachadh Pròtain
2.1 Mion-sgrùdadh Prìomh-phàirtean (PCA)
2.2 Claonadh Coitcheann Coimeasach (RSD)
2.3 K-means Sgaoileadh Treand
2.4 Measadh Ath-riochdachadh
2.5 Mapa Teasachaidh Abairteachaidh Pròtain
3. Nòtaichean Gnìomhach
3.1 Nòtaichean Gnìomhach GO
3.2 Nòtaichean Gnìomhach KEGG
3.3 Nòtaichean Gnìomhail COG
3.4 Nòtaichean Gnìomhach GOslim
3.5 Mìneachadh air Fearann Structar Pròtain Pfam
4. Mion-sgrùdadh Eadar-dhealachaidh Pròtain (ath-aithrisean bith-eòlasach ≥ 3)
4.1 Toraidhean Mion-sgrùdadh Eadar-dhealachaidh Pròtain
4.2 Sgaoileadh Atharrachaidhean Pasgadh Pròtain Eadar-dhealaichte (FC)
4.3 Mion-sgrùdadh Staitistigeil air Meud Pròtain Eadar-dhealaichte
4.4 Plota Bholcàno Pròtain Eadar-dhealaichte
4.5 Mapa Teas Cruinneachadh Pròtain Eadar-dhealaichte
4.6 Mion-sgrùdadh Gnìomhach is Beairteachaidh air Pròtain Eadar-dhealaichte GO
4.7 Mion-sgrùdadh Gnìomhach is Beairteachaidh air Pròtain Eadar-dhealaichte KEGG
4.8 Nòtaichean Gnìomhach COG Pròtain Eadar-dhealaichte
4.9 Mion-sgrùdadh air Notaichean is Beairteachadh GOslim air Pròtain Eadar-dhealaichte
4.10 Mion-sgrùdadh air Fearann Structar Pròtain Eadar-dhealaichte agus Beairteachadh
5. Mion-sgrùdadh Eadar-obrachadh Lìonra Pròtain
6. Nòtaichean air Slighe Ath-bhualadh Pròtain
7. Ro-innse Peptide Comharran
8. Suidheachadh Fo-cheallach Phròtainean
Pròtaineamaigs Cainneachdail(PRM)
1. Toraidhean Meudachaidh Pròtain PRM
1.1 Sealladh farsaing air toraidhean tomhais
1.2 Sgaoileadh Raon Mullaich Ian nam Beàrnan airson Earrannan Peptide
Pròtaineamaigs Cainneachdail
1.Mion-sgrùdadh air Abairt Pròtain
↑Mion-sgrùdadh Prìomh Cho-phàirtean (PCA)↑Claonadh Coitcheann Coimeasach (RSD)
↑K-a’ ciallachadh Sgaoileadh Treand ↑Co-dhàimhAmion-sgrùdadh airPpròtainEabairtLìrean
↑ Mapa Teasachaidh Abairteachaidh Pròtain
2. Nòtaichean Gnìomhach
↑GO Notaichean Gnìomhach↑Notaichean Gnìomhach KEGG
↑ Mìneachadh Gnìomhach COG ↑ Mìneachadh Gnìomhach GOslim
↑ Mion-chomharrachadh Fearainn Structar Pròtain Pfam
3.Mion-sgrùdadh Eadar-obrachadh Lìonra Pròtain
↑ Mion-sgrùdadh Eadar-obrachadh Lìonra Pròtain
4.Ro-innse Peptide Comharran
↑ Ro-innse Peptide Comharran
5. Suidheachadh Fo-cheallach Phròtainean
↑Suidheachadh fo-cheallach phròtainean
| 2025 | Bidh vesicles apoptotic a tha air an toirt bho cheallan gas mesenchymal a’ leasachadh freagairtean cus-mhothachaidh tro bhith a’ brosnachadh apoptosis ceallan T CD8+ le cus luchd calcium agus mì-ghnìomhachd mitochondrial | Saidheans Adhartach |
| 2024 | Tha ioma-omics amalaichte a’ sealltainn èifeachdas an-aghaidh tumhair nas fheàrr | Onco-eòlas Eadar-theangachaidh |
| 2024 | Tha Mion-sgrùdadh Ioma-Omach a’ nochdadh feartan sònraichte shlighean metabolachd a tha a’ toirt taic don Meud Measan agus Caochladh Dath Pumpkin Mòr | Eadar-nàiseanta J. Mol. Sci. |
| 2024 | Tha Pròifileadh Transcriptome agus Metabolome a’ toirt sealladh ùr air crìonadh fèithean gun chleachdadh ann an Cearc: An Dreuchd a Dh’fhaodadh a bhith aig Snàithleanan Fèithe Luath-Thwitch | Eadar-nàiseanta J. Mol. Sci. |
| 2023 | Tha mion-sgrùdadh ioma-omics a’ nochdadh buaidh tetracycline air fàs freumh seagal. | Iris stuthan cunnartach |
