-
Seicheamh mRNA làn-fhad-Nanopore
Tha seicheamh RNA air a bhith na inneal luachmhor airson mion-sgrùdadh farsaing air tar-sgrìobhadh.Gun teagamh, choilean sreath traidiseanta le leughadh goirid grunn leasachaidhean cudromach an seo.Ach a dh’ aindeoin sin, bidh e gu tric a’ tighinn tarsainn air crìochan ann an comharrachadh isoform làn-fhad, tomhas, claonadh PCR.
Tha sreath nanopore ga eadar-dhealachadh fhèin bho àrd-ùrlaran sreathachaidh eile, leis gu bheil na nucleotides air an leughadh gu dìreach às aonais synthesis DNA agus a’ gineadh leughadh fada aig deichean de kilobases.Tha seo a’ toirt cumhachd do leughadh dìreach a bhith a’ dol thairis air tar-sgrìobhaidhean làn-ùine agus a’ dèiligeadh ris na dùbhlain ann an sgrùdaidhean ìre isoform.
Àrd-ùrlar:Brosnachadh Nanopore
Leabharlann:cDNA-PCR
-
An t-sreath ùr tar-sgrìobhaidh làn-fhad -PacBio
Chan eilseicheamh tar-sgrìobhaidh làn-fhad, ris an canar cuideachdChan eilTha Iso-Seq a’ gabhail na buannachdan a tha ann an sreath PacBio ann am fad leughaidh, a leigeas le bhith a’ leantainn moileciuilean cDNA làn-fhad gun bhriseadh sam bith.Bidh seo gu tur a’ seachnadh mhearachdan sam bith a thig bho cheuman co-chruinneachaidh tar-sgrìobhaidh agus a’ togail sheataichean unigene le rùn ìre isoform.Tha an seata unigene seo a’ toirt seachad fiosrachadh ginteil cumhachdach mar “genome iomraidh” aig ìre tar-sgrìobhaidh.A bharrachd air an sin, a’ tighinn còmhla ri dàta sreathachaidh an ath ghinealach, tha an t-seirbheis seo a’ toirt cumhachd do thomhas ceart de abairt ìre isoform.
Àrd-ùrlar: PacBio Sequel IILeabharlann: Leabharlann clag SMRT -
Seicheamh mRNA eukaryotic-Illumina
Tha seicheamh mRNA a’ comasachadh cunntas a thoirt air a h-uile mRNA a chaidh ath-sgrìobhadh bho cheallan fo chumhachan sònraichte.Is e teicneòlas cumhachdach a th’ ann airson ìomhaigh faireachdainn gine, structaran gine agus uidheamachd moileciuil de phròiseasan bith-eòlasach sònraichte a nochdadh.Gu ruige seo, tha seicheamh mRNA air a chleachdadh gu farsaing ann an rannsachadh bunaiteach, breithneachadh clionaigeach, leasachadh dhrogaichean, msaa.
Àrd-ùrlar: Illumina NovaSeq 6000
-
Seicheamh mRNA neo-iomradh-Illumina
Bidh sreath mRNA a’ gabhail ri innleachd seicheamh ginealach an ath ghinealach (NGS) gus an teachdaire RNA (mRNA) a ghlacadh bho Eukaryote aig àm sònraichte a tha cuid de ghnìomhan sònraichte gan cur an gnìomh.B’ e ‘Unigene’ an t-ainm a bha air an tar-sgrìobhadh as fhaide agus chaidh a chleachdadh mar an t-sreath iomraidh airson mion-sgrùdadh às deidh sin, a tha na dhòigh èifeachdach air uidheamachd moileciuil agus lìonra riaghlaidh a’ ghnè a sgrùdadh gun iomradh.
Às deidh co-chruinneachadh dàta tar-sgrìobhaidh agus nota gnìomh unigene
(1) Bidh mion-sgrùdadh SNP, mion-sgrùdadh SSR, ro-innse CDS agus structar gine air an ullachadh.
(2) Bithear a’ tomhas abairt unigene anns gach sampall.
(3) Lorgar unigene eadar-dhealaichte eadar sampallan (no buidhnean) stèidhichte air faireachdainn unigene
(4) Bithear a’ cruinneachadh, a’ comharrachadh gnìomh agus a’ mion-sgrùdadh beairteas air aonaranachd air an cur an cèill
-
Sreath fada neo-chòdachadh-Illumina
Is e seòrsa de mholacilean RNA le faid nas àirde na 200 nt a th’ ann an RNAn neo-chòdachadh fada (lncRNAn), a tha air an comharrachadh le comas còdaidh gu math ìosal.Tha LncRNA, mar phrìomh bhall ann an RNAn neo-chòdachadh, ri lorg sa mhòr-chuid ann an niuclas agus plasma.Tha an leasachadh ann an teicneòlas seicheamhachaidh agus bith-fhiosrachadh a’ comasachadh grunn lncRNAn ùra a chomharrachadh agus an fheadhainn le gnìomhan bith-eòlasach a cheangal.Tha fianais tionalach a’ nochdadh gu bheil lncRNA an sàs gu farsaing ann an riaghladh epigenetic, riaghladh tar-sgrìobhaidh agus riaghladh iar-sgrìobhadh.
-
Seicheamh RNA beag - Illumina
Tha RNA beag a’ toirt iomradh air clas de mholacilean RNA neo-chòdachadh a tha mar as trice nas lugha na 200nt de dh’fhaid, a’ toirt a-steach meanbh-RNA (miRNA), RNA eadar-theachd beag (siRNA), agus RNA eadar-ghnìomhach piwi (piRNA).
Tha microRNA (miRNA) na chlas de RNA beag endogenous le fad timcheall air 20-24nt, aig a bheil grunn dhleastanasan riaghlaidh cudromach ann an ceallan.miRNA an sàs ann am mòran phròiseasan beatha a tha a’ nochdadh clò - sònraichte agus ìre - faireachdainn sònraichte agus air a ghleidheadh gu mòr ann an diofar ghnèithean.
-
seicheamh circRNA-Illumina
Tha seicheamh tar-sgrìobhaidh slàn air a dhealbhadh gus ìomhaigh a thoirt do gach seòrsa de mholacilean RNA, a’ toirt a-steach còdadh (mRNA) agus RNAn neo-chòdachadh (a’ toirt a-steach lncRNA, circRNA agus miRNA) a tha air an ath-sgrìobhadh le ceallan sònraichte aig àm sònraichte.Tha sreath tar-sgrìobhaidh slàn, ris an canar cuideachd “sreath iomlan RNA” ag amas air lìonraidhean riaghlaidh coileanta fhoillseachadh aig ìre tar-sgrìobhaidh.A’ gabhail brath air teicneòlas NGS, tha sreathan de thoraidhean tar-sgrìobhaidh iomlan rim faighinn airson mion-sgrùdadh ceRNA agus mion-sgrùdadh RNA còmhla, a bheir seachad a’ chiad cheum a dh’ ionnsaigh caractar gnìomh.A’ nochdadh lìonra riaghlaidh de ceRNA stèidhichte air circRNA-miRNA-mRNA.
-
Sreath tar-sgrìobhaidh slàn - Illumina
Tha seicheamh tar-sgrìobhaidh slàn air a dhealbhadh gus ìomhaigh a thoirt do gach seòrsa de mholacilean RNA, a’ toirt a-steach còdadh (mRNA) agus RNAn neo-chòdachadh (a’ toirt a-steach lncRNA, circRNA agus miRNA) a tha air an ath-sgrìobhadh le ceallan sònraichte aig àm sònraichte.Tha sreath tar-sgrìobhaidh slàn, ris an canar cuideachd “sreath iomlan RNA” ag amas air lìonraidhean riaghlaidh coileanta fhoillseachadh aig ìre tar-sgrìobhaidh.A’ gabhail brath air teicneòlas NGS, tha sreathan de thoraidhean tar-sgrìobhaidh iomlan rim faighinn airson mion-sgrùdadh ceRNA agus mion-sgrùdadh RNA còmhla, a bheir seachad a’ chiad cheum a dh’ ionnsaigh caractar gnìomh.A’ nochdadh lìonra riaghlaidh de ceRNA stèidhichte air circRNA-miRNA-mRNA.
-
Seicheamh RNA prokaryotic
Bidh seicheamh RNA prokaryotic a’ cleachdadh sreath an ath ghinealach (NGS) gus làthaireachd agus meud RNA a nochdadh aig àm sònraichte, le bhith a’ dèanamh anailis air an tar-sgrìobhadh cealla caochlaideach.Tha sreath prokaryotic RNA a 'chompanaidh againn, ag amas gu sònraichte air prokaryotes le genomes iomraidh, a' toirt dhut pròifil tar-sgrìobhaidh, mion-sgrùdadh structar ginealachd, msaa.
Àrd-ùrlar: Illumina NovaSeq 6000
-
Seicheamh metatranscriptome
Tha seicheamh metatranscriptome a’ comharrachadh faireachdainn gine de mhicroban (an dà chuid eukaryotes agus prokaryotes) taobh a-staigh àrainneachdan nàdarra (ie ùir, uisge, muir, feces, agus gut.). de ghnèithean, mion-sgrùdadh beairteachadh gnìomh de ghinean a tha air an cur an cèill gu eadar-dhealaichte, agus barrachd.
Àrd-ùrlar: Illumina NovaSeq 6000
