条形banner-03

Produtos

Bibliotecas predefinidas de Illumina

A tecnoloxía de secuenciación de Illumina, baseada na secuenciación por síntese (SBS), é unha innovación de nova xeración (NGS) adoptada a nivel mundial, responsable da xeración de máis do 90 % dos datos de secuenciación mundiais. O principio da SBS implica a obtención de imaxes de terminadores reversibles marcados con fluorescencia a medida que se engade cada dNTP e, posteriormente, a súa clivación para permitir a incorporación da seguinte base. Coa presenza dos catro dNTP unidos a terminadores reversibles en cada ciclo de secuenciación, a competencia natural minimiza o sesgo de incorporación. Esta tecnoloxía versátil admite bibliotecas de lectura única e de extremo emparellado, o que atende a unha ampla gama de aplicacións xenómicas. As capacidades de alto rendemento e a precisión da secuenciación de Illumina constitúena como unha pedra angular na investigación xenómica, o que permite aos científicos desentrañar as complexidades dos xenomas cun detalle e unha eficiencia inigualables.

O noso servizo de secuenciación de bibliotecas predefinidas permite aos clientes preparar bibliotecas de secuenciación a partir de diversas fontes (ARNm, xenoma completo, amplicóns, bibliotecas 10x, entre outras). Posteriormente, estas bibliotecas poden enviarse aos nosos centros de secuenciación para o control de calidade e a secuenciación en plataformas Illumina.


Detalles do servizo

Resultado da demostración

Características

Plataformas:Illumina NovaSeq 6000 e NovaSeq X Plus

Modos de secuenciación:PE150 e PE250

Control de calidade das bibliotecas antes da secuenciación

Secuenciación de datos, control de calidade e entrega:entrega do informe de control de calidade e datos brutos en formato fastq despois da desmultiplexación e filtrado das lecturas Q30

 

 

Vantaxes do servizo

Versatilidade dos servizos de secuenciación:O cliente pode escoller secuenciar por carril, cela de fluxo ou por cantidade de datos requiridos (secuenciación de carril parcial).

Ampla experiencia na plataforma de secuenciación Illumina:con miles de proxectos pechados con diversas especies. 

Entrega do informe de control de calidade da secuenciación:con métricas de calidade, precisión dos datos e rendemento xeral do proxecto de secuenciación.

Proceso de secuenciación madura:cun curto tempo de resposta.

Control de calidade rigorosoImplementamos uns requisitos de control de calidade estritos para garantir a entrega de resultados de alta calidade consistente.

 

 

Plataformas de mostra

Plataforma

Célula de fluxo

Modo de secuenciación

Unidade

Produción estimada

NovaSeq X

10B (8 carrís)

PE150

Carril único

Carril parcial

375 Gb / Carril

25B (8 carrís)

PE150

Carril único

Carril parcial

1000 Gb/Carril

NovaSeq 6000

Cela de fluxo SP (2 carrís)

PE250

Célula de fluxo

Carril único

Carril parcial

325-400 M lecturas/carril

Cela de fluxo S4 (4 carrís)

PE150

Célula de fluxo

Carril único

Carril parcial

~800 Gb/Carril

Requisitos da mostra

 

Cantidade de datos (Gb)

Conc. (qPCR) PE150

Conc. (qPCR) PE250

Volume

Carril parcial

 

 

G ≤ 10

≥ 1 nM

≥ 2nM

≥ 25 μl

10 < G ≤ 50

≥ 2 nM

≥ 3 nM

≥ 25 μl

50 < G ≤ 100

≥ 3 nM

≥ 4nM

≥ 25 μl

G > 100

≥ 4 nM

≥ 4nM

≥ 25 μl

Carril único

Por carril

≥ 1,5 nM/conxunto de bibliotecas

≥ 2 nM/Agrupación da biblioteca

≥ 25 µL/conxunto de biblioteca

Ademais da concentración e da cantidade total, tamén se require un patrón de picos axeitado.

Nota: A secuenciación de carriles de bibliotecas de baixa diversidade require a activación de PhiX para garantir unha chamada de base robusta.

Recomendamos enviar bibliotecas preagrupadas como mostras para a secuenciación de carriles. Se precisa que BMKGENE realice a agrupación de bibliotecas, consulte os requisitos da biblioteca para a secuenciación parcial de carriles.

Tamaño da biblioteca (mapa de picos)

Para a secuenciación PE150, o tamaño do inserto debe ser de 300–400 pb (excluíndo os adaptadores); para a secuenciación PE250, o tamaño do inserto debe ser de 150–500 pb (excluíndo os adaptadores).
As bibliotecas deben ter un único pico principal, sen contaminación do adaptador e sen dímeros de cebadores.

Póñase en contacto connosco se as súas mostras non cumpren os requisitos do material de partida.

Fluxo de traballo do servizo

preparación da mostra

Control de calidade da biblioteca

Secuenciación

Secuenciación

Análise de datos

Control de calidade dos datos

Control de calidade da mostra

Entrega do proxecto


  • Anterior:
  • Seguinte:

  • Informe de control de calidade da biblioteca

    Ofrécese un informe sobre a calidade da biblioteca antes da secuenciación, avaliando a cantidade da biblioteca e a fragmentación.

     

    Informe de control de calidade da secuenciación

     

    Táboa 1. Estatísticas sobre os datos de secuenciación.

    ID da mostra

    BMKID

    Lecturas brutas

    Datos brutos (pb)

    Lecturas limpas (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96,48

    99,14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96,00

    98,95

    93,89

    37,08

    Figura 1. Distribución da calidade ao longo das lecturas en cada mostra

    A9

    Figura 2. Distribución do contido base

    A10

    Figura 3. Distribución dos contidos lidos nos datos de secuenciación

    A11

     

    obter un orzamento

    Escribe aquí a túa mensaxe e envíanosla

    Envíanos a túa mensaxe: