Plataforma | Tamaño da biblioteca | Rendemento de datos teóricos (por cela) | Precisión de base única | Aplicacións |
Nanopore | 8kb, 10kb, 20kb, ultralóng, CDNA-PCR | 70-90 GB/Cell | 85-92% | SV Calling, de novo, secuenciación de lonxitude completa, iso-seq, anotación xénica, detección de metilación do ADN |
● Máis de 5 anos de experiencia na plataforma de secuenciación de PacBio con miles de proxectos pechados con varias especies.
● BMKGene é un socio oficial de Oxford Nanopore, con certificación de ARN/ADN de dobre plataforma.
● Hai modelos principais de secuenciadores con equipos completos e rendemento de secuenciación suficiente.
● Baseándose na plataforma Nanopore, máis de 10 investigacións sobre Denovo animais e vexetais publicáronse en revistas de renome internacional.
Tipo de mostra | Cantidade | Concentración (qubit ®) | Volume | Pureza | Outros |
ADN xenómico | Depende do requisito de datos | ≥20ng/µl | ≥15 ml | OD260/280 = 1,7-2,2; OD260/230≥1,5 ; Pico claro a 260 nm , sen contaminacións | A concentración debe medirse por qubit e qubit/nanopor ≤ 2 |
ARN total | ≥1,2 μg | ≥100μg/µl | ≥15 ml | OD260/280 = 1,7-2,5; OD260/230 = 0,5-2,5 ; Non hai contaminacións | Valor RIN ≥7,5 |
Avaliación da calidade de datos da mostra de ADN
Táboa 1. Estatísticas sobre datos limpos.
Bmkid | Rawseqnum | Rawsumbase | CleanSQnum | limpsumbase | Cleann50len | Cleann90len | CleanMeanlen | CleanMaxlen | CleanMeanqual |
ADN_BMK01 | 1.218.239 | 26.37 | 1.121.736 | 25,90 | 28.014 | 15.764 | 23.090 | 143.181 | 9 |
Avaliación da calidade dos datos da mostra de ARN
Táboa 1. Estatísticas sobre datos limpos.
Nome de ficheiro | ClientID | Readnum | Basenum | N50 | Lonxitude media | MaxLength | Meanqscore |
ARN_BMK001 | C2 | 8.947.708 | 4.047.230.083 | 398 | 452 | 129.227 | P12 |
Figura 1. Lea a distribución da lonxitude
Figura 2. Distribución da puntuación de calidade dos datos limpos
Figura 3. Distribución de puntuación de lonxitude e calidade de datos limpos