Produtos

Secuenciación de ADN/ARN: secuenciador de nanoporos

Secuenciación de ADN/ARN: imaxe destacada do secuenciador de nanoporos

A secuenciación ONT é unha tecnoloxía de secuenciación de sinais eléctricos en tempo real dunha soa molécula baseada en nanoporos. O principio de secuenciación de cada plataforma é o mesmo. O ADN/ARN bicatenario únese á proteína nanoporosa incrustada no biofilm e desenrólase baixo a dirección da proteína motora. Baixo a acción da diferenza de voltaxe de ambos os dous lados do biofilm, as febras de ADN/ARN pasan a través da proteína do canal de nanoporos a unha determinada velocidade. Debido ás diferenzas nas propiedades químicas das diferentes bases da febra de ADN/ARN, cando unha soa base ou molécula de ADN pasa a través do canal de nanoporos, provocará o cambio de diferentes sinais eléctricos. Ao detectar e corresponder a estes sinais, pódense calcular os tipos de bases correspondentes e pódese completar a detección en tempo real da secuencia.

Contacta connosco

Detalles do servizo

Resultado da demostración

Características dos detalles do servizo

Plataforma	Tamaño da biblioteca	Rendemento de datos teóricos (por cela)	Precisión de base única	Aplicacións
Nanoporo	8 kb, 10 kb, 20 kb, ultralongo, PCR de ADNc	70-90 Gb/célula	85-92%	Chamada SV, De novo, Secuenciación de lonxitude completa, Iso-Seq, Anotación xénica, Detección de metilación do ADN

Vantaxes do servizo

● Máis de 5 anos de experiencia na plataforma de secuenciación PacBio con miles de proxectos pechados con diversas especies.
● BMKGENE é un socio oficial de Oxford Nanopore, con certificación de ARN/ADN de dobre plataforma.
● Existen modelos convencionais de secuenciadores con equipamento completo e rendemento de secuenciación suficiente.
● Baseándose na plataforma Nanopore, publicáronse máis de 10 investigacións de Denovo en animais e plantas en revistas de renome internacional.

Requisitos da mostra

Tipo de mostra

Cantidade

Concentración (Qubit ®)

Volume

Pureza

Outros

ADN xenómico

Depende do requisito de datos

≥20 ng/μl

≥15 μl

DO260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1.5;

Pico claro a 260 nm, sen contaminacións

A concentración debe medirse mediante Qubit e Qubit/Nanopore ≤ 2

ARN total

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15 μl

DO260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; sen contaminacións

Valor RIN ≥7,5

Fluxo de traballo do servizo

Preparación da mostra

Construción de bibliotecas

Secuenciación

Análise de datos

Entrega do proxecto

Anterior: Bibliotecas predefinidas de Illumina

Seguinte: Secuenciación de fragmentos amplificados por locus específico (SLAF-Seq)

Avaliación da calidade dos datos dunha mostra de ADN

Táboa 1. Estatísticas sobre datos limpos.

BMKID	Núm.Sec.Raw	rawSumBase	núm. de secuencia limpa	limparSumaBase	limparN50Len	limpoN90Len	limparMeanLen	limparMaxLen	cleanMeanQual
ADN_BMK01	1.218.239	26,37	1.121.736	25,90	28.014	15.764	23.090	143.181	9

Avaliación da calidade dos datos da mostra de ARN

Táboa 1. Estatísticas sobre datos limpos.

Nome do ficheiro	ID do cliente	LecturaNúmero	Número de base	N50	Lonxitude media	Lonxitude máxima	Puntuación media
ARN_BMK001	C2	8.947.708	4.047.230.083	398	452	129.227	P12