条形 Banner-03

Produtos

Secuenciación de ADN/ARN - secuenciador nanoporo

A secuenciación de ONT é unha tecnoloxía de secuenciación de sinal eléctrica en tempo real de molécula baseada en nanopores, o principio de secuenciación de cada plataforma é o mesmo. Double-stranded DNA/RNA will bind to nanoporous protein embedded in the biofilm and unwinding under the lead of motor protein, under the action of voltage difference from both sides of the biofilm, DNA/RNA strands pass through the nanopore channel protein at a certain taxa. Debido ás diferenzas das propiedades químicas das distintas bases na cadea de ADN/ARN, cando unha única base ou molécula de ADN pasa pola canle de nanoporo, provocará o cambio de diferentes sinais eléctricos. Detectando e correspondendo a estes sinais, pódense calcular os tipos de base correspondentes e pódese completar a detección en tempo real da secuencia.


Detalles do servizo

Resultado de demostración

Características de detalles do servizo

Plataforma

Tamaño da biblioteca

Rendemento de datos teóricos (por cela)

Precisión de base única

Aplicacións

Nanopore

8kb, 10kb, 20kb, ultralóng, CDNA-PCR

70-90 GB/Cell

85-92%

SV Calling, de novo, secuenciación de lonxitude completa, iso-seq, anotación xénica, detección de metilación do ADN

Vantaxes do servizo

● Máis de 5 anos de experiencia na plataforma de secuenciación de PacBio con miles de proxectos pechados con varias especies.
● BMKGene é un socio oficial de Oxford Nanopore, con certificación de ARN/ADN de dobre plataforma.
● Hai modelos principais de secuenciadores con equipos completos e rendemento de secuenciación suficiente.
● Baseándose na plataforma Nanopore, máis de 10 investigacións sobre Denovo animais e vexetais publicáronse en revistas de renome internacional.

Requisitos da mostra


Tipo de mostra

Cantidade

Concentración (qubit ®)

Volume

Pureza

Outros

ADN xenómico

Depende do requisito de datos

 ≥20ng/µl

≥15 ml

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1,5 ;

Pico claro a 260 nm , sen contaminacións

A concentración debe medirse por qubit e qubit/nanopor ≤ 2

ARN total

≥1,2 μg

≥100μg/µl

≥15 ml

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ; Non hai contaminacións

Valor RIN ≥7,5

 

Fluxo de traballo de servizo

preparación da mostra

Preparación da mostra

Preparación da biblioteca

Construción da biblioteca

Secuenciación

Secuenciación

Análise de datos

Análise de datos

Mostra QC

Entrega do proxecto


  • Anterior:
  • Seguinte:

  • Avaliación da calidade de datos da mostra de ADN

    Táboa 1. Estatísticas sobre datos limpos.

    Bmkid

    Rawseqnum

    Rawsumbase

    CleanSQnum

    limpsumbase

    Cleann50len

    Cleann90len

    CleanMeanlen

    CleanMaxlen

    CleanMeanqual

    ADN_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25,90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Avaliación da calidade dos datos da mostra de ARN

    Táboa 1. Estatísticas sobre datos limpos.

    Nome de ficheiro

    ClientID

    Readnum

    Basenum

    N50

    Lonxitude media

    MaxLength

    Meanqscore

    ARN_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    P12

    Figura 1. Lea a distribución da lonxitude

    A3

    Figura 2. Distribución da puntuación de calidade dos datos limpos

    A4

    Figura 3. Distribución de puntuación de lonxitude e calidade de datos limpos

    A5

    Obtén un presuposto

    Escribe a túa mensaxe aquí e enviala

    Envíanos a túa mensaxe: