条形banner-03

Produtos

Bibliotecas predefinidas de DNBSEQ

DNBSEQ, desenvolvida por MGI, é unha innovadora tecnoloxía NGS que conseguiu reducir aínda máis os custos de secuenciación e aumentar o rendemento. A preparación das bibliotecas DNBSEQ implica a fragmentación do ADN, a preparación de ssDNA e a amplificación por círculos rodantes para obter as nanobólas de ADN (DNB). Estas cárganse entón nunha superficie sólida e posteriormente secuencianse mediante síntese combinatoria de sonda-áncora (cPAS). A tecnoloxía DNBSEQ combina as vantaxes de ter unha baixa taxa de erro de amplificación co uso de patróns de erro de alta densidade con nanobólas, o que resulta nunha secuenciación con maior rendemento e precisión.

O noso servizo de secuenciación de bibliotecas predefinidas permite aos clientes preparar bibliotecas de secuenciación Illumina a partir de diversas fontes (ARNm, xenoma completo, amplicóns, bibliotecas 10x, entre outras), que se converten en bibliotecas MGI nos nosos laboratorios para seren secuenciadas en DNBSEQ-T7, o que permite grandes cantidades de datos a custos máis baixos.


Detalles do servizo

Resultado da demostración

Características

●Plataforma:MGI-DNBSEQ-T7

●Modos de secuenciación:PE150

●Transferencia de bibliotecas de Illumina aMGI:permitindo a secuenciación de grandes volumes de datos a baixo custo.

●Control de calidade das bibliotecas antes da secuenciación.

●Secuenciación de datos, control de calidade e entrega:entrega do informe de control de calidade e datos brutos en formato fastq despois da desmultiplexación e filtrado das lecturas Q30.

 

Vantaxes

●Versatilidade dos servizos de secuenciación:O cliente pode escoller secuenciar por carril ou cantidade de datos.

●Alta saída de datos:1500 Gb/carril

●Entrega do informe de control de calidade da secuenciación:con métricas de calidade, precisión dos datos e rendemento xeral do proxecto de secuenciación.

●Proceso de secuenciación madura:cun curto tempo de resposta.

●Control de calidade rigorosoImplementamos uns requisitos de control de calidade estritos para garantir a entrega de resultados de alta calidade consistente.

 

Requisitos da mostra

 

Cantidade de datos (X)

Concentración (qPCR/nM)

Volume

Carril parcial

   

X ≤ 10 Gb

≥ 1 nM

≥ 25 μl

10 Gb < X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 25 μl

50 Gb < X ≤ 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 25 μl

X > 100 Gb

≥ 4 nM

 

Carril único

Por carril

≥ 1,5 nM / conxunto de bibliotecas

≥ 25 μl / conxunto de bibliotecas

Ademais da concentración e da cantidade total, tamén se require un patrón de picos axeitado.

Nota: A secuenciación de carriles de bibliotecas de baixa diversidade require a activación de PhiX para garantir unha chamada de base robusta.

Recomendamos enviar bibliotecas preagrupadas como mostras. Se precisa que BMKGENE realice a agrupación de bibliotecas, consulte os requisitos da biblioteca para a secuenciación parcial de carriles.

Tamaño da biblioteca (mapa de picos)

O pico principal debería estar entre 300 e 450 pb.

As bibliotecas deben ter un único pico principal, sen contaminación do adaptador e sen dímeros de cebadores.

Fluxo de traballo do servizo

preparación de mostras
Secuenciación
Análise de datos
Control de calidade da mostra

  • Anterior:
  • Seguinte:

  • Informe de control de calidade da biblioteca

    Ofrécese un informe sobre a calidade da biblioteca antes da secuenciación, avaliando a cantidade da biblioteca e a fragmentación.

     

    Informe de control de calidade da secuenciación

     

    Táboa 1. Estatísticas sobre os datos de secuenciación.

    ID da mostra

    BMKID

    Lecturas brutas

    Datos brutos (pb)

    Lecturas limpas (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96,48

    99,14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96,00

    98,95

    93,89

    37,08

    Figura 1. Distribución da calidade ao longo das lecturas en cada mostra

    A9

    Figura 2. Distribución do contido base

    A10

    Figura 3. Distribución dos contidos lidos nos datos de secuenciación

    A11

    obter un orzamento

    Escribe aquí a túa mensaxe e envíanosla

    Envíanos a túa mensaxe: