●Plataforma:MGI-DNBSEQ-T7
●Modos de secuenciación:PE150
●Transferencia de bibliotecas de Illumina aMGI:permitindo a secuenciación de grandes volumes de datos a baixo custo.
●Control de calidade das bibliotecas antes da secuenciación.
●Secuenciación de datos, control de calidade e entrega:entrega do informe de control de calidade e datos brutos en formato fastq despois da desmultiplexación e filtrado das lecturas Q30.
●Versatilidade dos servizos de secuenciación:O cliente pode escoller secuenciar por carril ou cantidade de datos.
●Alta saída de datos:1500 Gb/carril
●Entrega do informe de control de calidade da secuenciación:con métricas de calidade, precisión dos datos e rendemento xeral do proxecto de secuenciación.
●Proceso de secuenciación madura:cun curto tempo de resposta.
●Control de calidade rigorosoImplementamos uns requisitos de control de calidade estritos para garantir a entrega de resultados de alta calidade consistente.
| Cantidade de datos (X) | Concentración (qPCR/nM) | Volume | |
| Carril parcial
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Carril único | Por carril | ≥ 1,5 nM / conxunto de bibliotecas | ≥ 25 μl / conxunto de bibliotecas |
Ademais da concentración e da cantidade total, tamén se require un patrón de picos axeitado.
Nota: A secuenciación de carriles de bibliotecas de baixa diversidade require a activación de PhiX para garantir unha chamada de base robusta.
Recomendamos enviar bibliotecas preagrupadas como mostras. Se precisa que BMKGENE realice a agrupación de bibliotecas, consulte os requisitos da biblioteca para a secuenciación parcial de carriles.
O pico principal debería estar entre 300 e 450 pb.
As bibliotecas deben ter un único pico principal, sen contaminación do adaptador e sen dímeros de cebadores.
Ofrécese un informe sobre a calidade da biblioteca antes da secuenciación, avaliando a cantidade da biblioteca e a fragmentación.
Táboa 1. Estatísticas sobre os datos de secuenciación.
| ID da mostra | BMKID | Lecturas brutas | Datos brutos (pb) | Lecturas limpas (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37,08 |
Figura 1. Distribución da calidade ao longo das lecturas en cada mostra
Figura 2. Distribución do contido base
Figura 3. Distribución dos contidos lidos nos datos de secuenciación