ØAltamente experimentado: máis de 200.000 mostras foron procesadas en BMK que abarcan diversos tipos de mostras, incluíndo cultivo celular, tecido, fluído corporal, etc.
ØSistema de control de calidade estrito: os puntos básicos de control de calidade a través de todos os pasos, incluída a preparación de mostras, a preparación da biblioteca, a secuenciación e a bioinformática, están baixo estreito seguimento para obter resultados de alta calidade.
ØMúltiples bases de datos dispoñibles para a anotación de funcións e estudos de enriquecemento para cumprir diversos obxectivos de investigación.
ØServizos posvenda: servizos posvenda válidos durante 3 meses despois da finalización do proxecto, incluíndo o seguimento dos proxectos, a resolución de problemas, as preguntas e respostas dos resultados, etc.
Biblioteca | Estratexia de secuenciación | Datos recomendados | Control de calidade |
Poli A enriquecido | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nucleótidos:
Pureza | Integridade | Cantidade |
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Contaminación limitada ou nula de proteínas ou ADN no xel. | Para plantas: RIN ≥ 6,5; Para animais: RIN ≥ 7; 28S/18S ≥ 1,0; elevación de referencia limitada ou nula | Conc.≥30 ng/μl;Volume ≥ 10 μl;Total ≥ 1,5 μg |
Tecido: Peso (seco):≥1 g
*Para tecidos inferiores a 5 mg, recomendamos enviar mostras de tecido conxelada instantáneamente (en nitróxeno líquido).
Suspensión celular:Número de células = 3×106- 1×107
*Recomendamos enviar lisado celular conxelado.No caso de que ese reconto de células sexa inferior a 5 × 105, recoméndase conxelar instantáneamente en nitróxeno líquido, o que é preferible para a microextracción.
Mostras de sangue:Volume ≥1 ml
Microorganismo:Masa ≥ 1 g
Recipiente: tubo de centrífuga de 2 ml (non se recomenda papel de aluminio)
Etiquetaxe da mostra: grupo+réplica, por exemplo, A1, A2, A3;B1, B2, B3....
Envío:
Bioinformática
Eucariota Fluxo de traballo de análise de secuenciación de ARNm
Bioinformática
ØControl de calidade dos datos brutos
ØAliñación do xenoma de referencia
ØAnálise da estrutura da transcrición
ØCuantificación de expresións
ØAnálise da expresión diferencial
ØAnotación e enriquecemento de funcións
1.Curva de saturación de datos de ARNm
2.Análise de expresión diferencial-Gráfica do volcán
3.Anotación KEGG en DEG
4.Clasificación GO en DEG