BMKCloud Log in
条形banner-03

Produtos

Secuenciación de ARNm eucariotas-Illumina

A secuenciación do ARNm permite o perfil de todos os ARNm transcritos das células en condicións específicas.É unha tecnoloxía poderosa para revelar o perfil de expresión xénica, as estruturas xénicas e os mecanismos moleculares de certos procesos biolóxicos.Ata a data, a secuenciación do ARNm empregouse amplamente na investigación fundamental, diagnóstico clínico, desenvolvemento de fármacos, etc.

Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq


Detalles do servizo

Bioinformática

Resultados da demostración

Vantaxes

● Altamente experimentado: máis de 200.000 mostras foron procesadas en BMK que abarcan diversos tipos de mostras, incluíndo cultivo celular, tecido, fluído corporal, etc.

● Sistema de control de calidade estrito: os puntos básicos de control de calidade a través de todos os pasos, incluíndo a preparación de mostras, a preparación da biblioteca, a secuenciación e a bioinformática están baixo un seguimento estreito para obter resultados de alta calidade.

● Múltiples bases de datos dispoñibles para a anotación de funcións e estudos de enriquecemento para cumprir diversos obxectivos de investigación.

● Servizos posvenda: servizos posvenda válidos durante 3 meses despois da finalización do proxecto, incluíndo o seguimento dos proxectos, a resolución de problemas, as preguntas e respostas dos resultados, etc.

Requisitos de mostra e entrega

Biblioteca Estratexia de secuenciación Datos recomendados Control de calidade
Poli A enriquecido Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85%

Requisitos de mostra:

Nucleótidos:

Conc. (ng/μl)

Cantidade (μg)

Pureza

Integridade

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Contaminación limitada ou nula de proteínas ou ADN no xel.

Para plantas: RIN≥6,5;

Para animais: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

elevación de referencia limitada ou nula

Tecido: Peso (seco):≥ 1 g
*Para tecidos inferiores a 5 mg, recomendamos enviar mostras de tecido conxelada instantáneamente (en nitróxeno líquido).

Suspensión celular:Número de células = 3×106- 1×107
*Recomendamos enviar lisado celular conxelado.No caso de que esa cela conte menos de 5×105.

Mostras de sangue:Volume ≥1 ml

Microorganismo:Masa ≥ 1 g

Entrega de mostra recomendada

Recipiente: tubo de centrífuga de 2 ml (non se recomenda papel de aluminio)

Etiquetaxe da mostra: grupo+réplica, por exemplo, A1, A2, A3;B1, B2, B3....

Envío:

  1. Xeo seco: as mostras deben ser embaladas en bolsas e enterradas en xeo seco.
  2. Tubos RNAstable: as mostras de ARN pódense secar nun tubo de estabilización de ARN (por exemplo, RNAstable®) e enviarse a temperatura ambiente.

Fluxo de traballo do servizo

QC de mostra

Deseño de experimentos

entrega da mostra

Entrega da mostra

Experimento piloto

extracción de ARN

Preparación da biblioteca

Construción da biblioteca

Secuenciación

Secuenciación

Análise de datos

Análise de datos

Servizos posvenda

Servizos posvenda


  • Anterior:
  • Seguinte:

  • Bioinformática

    wps_doc_10

    Eucariota Fluxo de traballo de análise de secuenciación de ARNm

    Bioinformática

    ØControl de calidade dos datos brutos

    ØAliñación do xenoma de referencia

    ØAnálise da estrutura da transcrición

    ØCuantificación de expresións

    ØAnálise da expresión diferencial

    ØAnotación e enriquecemento de funcións

    1.Curva de saturación de datos de ARNm

    3(1)

    2.Análise de expresión diferencial-Gráfica do volcán

    4(1)

    3.Anotación KEGG en DEG

    5 (1)

    4.Clasificación GO en DEG

    6(1)

    obter unha cotización

    Escribe aquí a túa mensaxe e envíanolo

    Envíanos a túa mensaxe: