● Úsanse sondas especiais para eliminar o ADNc ribosómico.
● Construción de bibliotecas específicas para cada ramal.
● Un fluxo de traballo para obter datos de ARNm, ARN non lineal e ARN circular simultaneamente.
● Control de calidade rigoroso: Implementamos puntos de control básicos en todas as etapas, desde a preparación de mostras e bibliotecas ata a secuenciación e a bioinformática. Esta monitorización meticulosa garante a entrega de resultados de alta calidade consistente.
● Asistencia posvenda: O noso compromiso vai máis alá da finalización do proxecto cun período de servizo posvenda de 3 meses. Durante este tempo, ofrecemos seguimento do proxecto, asistencia para a resolución de problemas e sesións de preguntas e respostas para abordar calquera dúbida relacionada cos resultados.
| Biblioteca | Plataforma | Datos recomendados | Control de calidade de datos |
| Biblioteca direccional con ARNr esgotado | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Nucleótidos:
| Cantidade (ng) | Volume (μL) |
| 40 | 20 |
Tecido:
Exosoma: 100 μL; 40 μg; >10^9 partículas/mL
Soro/plasma: 5 mL
Sobrenadante de cultivo celular: 100 mL
Urina: 100 mL
Saliva: 15 mL
Secreción nasal: 15 mL
Líquido cefalorraquídeo: 15 mL
Líquido amniótico: 50 mL
Semen: 5 mL
Bile: 5 mL
Ascite: 50 mL
Leite: 15 mL
Fluído folicular: 15 mL
Sobrenadante fecal: 50 mL
Sobrenadante de cultivo microbiano: 100 mL
Tecido animal: 3 g
Tecido vexetal: 1 g
Recipiente: tubo de centrífuga de 2 mL (non se recomenda o uso de papel de aluminio)
Etiquetado de mostra: Agrupar+replicar, por exemplo, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Envío:
1. Xeo seco: as mostras deben embalarse en bolsas e soterrarse en xeo seco.
2. Tubos ARN estables: as mostras de ARN pódense secar en tubos de estabilización de ARN (por exemplo, RNAstable®) e enviarse a temperatura ambiente.
Bioinformática
Predición de circRNA: distribución cromosómica
CircRNAs expresados diferencialmente: diagrama do volcán
CircRNAs expresados diferencialmente: agrupamento xerárquico
Enriquecemento funcional dos xenes hóspedes do circRNA
Análise de expresión xénica diferencial (DEG)
Cuantificación da expresión de lncRNA: agrupamento en clústeres
Enriquecemento de xenes diana de lncRNA
Análise conxunta da posición do ARNm e do ARNnc: diagrama de Circos (o círculo central é o ARNm e o círculo interior é o ARNnc)