Produtos

Secuenciación de ARN pequeno exosomal: Illumina

Os exosomas son pequenas vesículas segregadas por células, cuxo diámetro adoita oscilar entre os 30 e os 100 nanómetros. Estas vesículas conteñen varios tipos de ARN. Entre os tipos de ARN dos exosomas, o máis común e estudado é o microARN (miARN). O miARN é unha clase de pequenos ARN non codificantes de aproximadamente 18-25 nucleótidos de lonxitude. Median o silenciamento xénico postranscricional uníndose á rexión 3' non traducida (3' UTR) dos ARNm diana, regulando así a expresión xénica. Por exemplo, os exosomas segregados por certas células tumorais conteñen miARN específicos, como o miR-126 e o miR-92a. Estes miARN poden influír na expresión xénica nas células receptoras e promover a anxioxénese tumoral (Tomohiro Umezu, et al., Oncogene, 2012).

Contacta connosco

Detalles do servizo

bioinformática

Resultados da demostración

Características

● Úsase ARN total exosomal como material de entrada. Durante a purificación, empréganse esferas de miRNA para illar o miRNA.

● Análise bioinformática centrada na predición de miARN e os seus obxectivos.

Vantaxes do servizo

● Análise bioinformática exhaustiva: permite a identificación de miARN coñecidos e novos, a identificación de miARN diana e a correspondente anotación funcional e enriquecemento con múltiples bases de datos (KEGG, GO).

● Control de calidade rigoroso: Implementamos puntos de control básicos en todas as etapas, desde a preparación de mostras e bibliotecas ata a secuenciación e a bioinformática. Esta monitorización meticulosa garante a entrega de resultados de alta calidade consistente.

● Asistencia posvenda: O noso compromiso vai máis alá da finalización do proxecto cun período de servizo posvenda de 3 meses. Durante este tempo, ofrecemos seguimento do proxecto, asistencia para a resolución de problemas e sesións de preguntas e respostas para abordar calquera dúbida relacionada cos resultados.

Requisitos e entrega da mostra

Biblioteca	Plataforma	Datos recomendados	Control de calidade de datos
Illamento de miRNA exosomal	Illumina SE50	10M-20M lecturas	Q30≥85%

Requisitos da mostra

Nucleótidos:

Cantidade (ng)	Volume (μL)
40	20

Tecido:

Exosoma: 100 μL; 40 μg; >10^9 partículas/mL
Soro/plasma: 5 mL
Sobrenadante de cultivo celular: 100 mL
Urina: 100 mL
Saliva: 15 mL
Secreción nasal: 15 mL
Líquido cefalorraquídeo: 15 mL
Líquido amniótico: 50 mL
Semen: 5 mL
Bile: 5 mL
Ascite: 50 mL
Leite: 15 ml
Fluído folicular: 15 mL
Sobrenadante fecal: 50 mL
Sobrenadante de cultivo microbiano: 100 mL
Tecido animal: 3 g
Tecido vexetal: 1 g

Entrega de mostras recomendada

Recipiente: tubo de centrífuga de 2 mL (non se recomenda o uso de papel de aluminio)
Etiquetado de mostra: Agrupar+replicar, por exemplo, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Envío:
1. Xeo seco: as mostras deben embalarse en bolsas e soterrarse en xeo seco.
2. Tubos ARN estables: as mostras de ARN pódense secar en tubos de estabilización de ARN (por exemplo, RNAstable®) e enviar a temperatura ambiente.

Fluxo de traballo do servizo

deseño de experimentos

Entrega de mostras

Extracción de ARN

Construción de bibliotecas

Secuenciación

Análise de datos

servizos posvenda

Anterior: BMKMANU S3000_Transcriptoma espacial

Seguinte: Secuenciación de ARNm/ARNlnc/ARN circense exosomal: Illumina

Bioinformática

● Control de calidade dos datos brutos
● Clasificación do ARNp
● Aliñamento cun xenoma de referencia
● Identificación de microARN coñecidos e novos
● Análise de expresión diferencial de miARN
● Anotación funcional de miARN dianas

Identificación de microARN: estrutura e profundidade