Produtos

Xenoma de fungos

Biomarker Technologies proporciona estudos do xenoma, xenoma fino e xenoma completo de fungos dependendo do obxectivo específico da investigación.A secuenciación, a ensamblaxe e a anotación funcional do xenoma pódense conseguir combinando a secuenciación de próxima xeración + a secuenciación de terceira xeración para conseguir unha ensamblaxe de xenoma de alto nivel.Tamén se pode empregar a tecnoloxía Hi-C para facilitar a ensamblaxe do xenoma a nivel cromosómico.

Plataforma:PacBio Sequel II

Nanopore PromethION P48

Plataforma Illumina NovaSeq

Contacta connosco

Detalles do servizo

Resultados da demostración

Vantaxes do servizo

● Múltiples estratexias de secuenciación dispoñibles para diferentes obxectivos de investigación

● Moita experiencia na montaxe de xenomas de fungos con máis de 10.000 xenomas completos ensamblados.

● Equipo profesional de soporte técnico posvenda que satisface necesidades de investigación máis específicas.

Especificacións do servizo

Servizo	Estratexia de secuenciación	Calidade garantida	Tempo estimado de entrega
Mapa fino de fungos	Illumina 50X + Nanopore 100X	Conti N50≥2 Mb	35 días laborables
Mapa fino de fungos	PacBio HiFi 30X	Conti N50≥2 Mb	35 días laborables
Mapa completo de pene de fungos	Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	Relación de ancoraxe cromosómica > 90%	45 días laborables

Análise bioinformática

● Control de calidade dos datos brutos

● Montaxe do xenoma

● Análise de compoñentes do xenoma

● Anotación da función xenética

● Análise xenómica comparativa

Requisitos de mostra e entrega

Requisitos de mostra:

ParaExtractos de ADN:

Tipo de mostra	Cantidade	Concentración	Pureza
Extractos de ADN	> 1,2 μg	> 20 ng/μl	OD260/280= 1,6-2,5

Para mostras de tecido:

Tipo de mostra

Tratamento de mostra recomendado

Almacenamento e envío de mostras

Fungo unicelular

Observa os fermentos ao microscopio e recolleos na súa fase exponencial

Transfire o cultivo (que contén aprox. 3-4,5e9 células) a un eppendorf de 1,5 ou 2 ml.(Segue no xeo)

Centrifugar o tubo durante 1 min a 14000 g para recoller bacterias e eliminar o sobrenadante con coidado.

Sela o tubo e conxela as bacterias en nitróxeno líquido durante polo menos 1-3 h.Garda o tubo na neveira a -80 ℃.

Conxelar as mostras en nitróxeno líquido durante 3-4 horas e almacenar en nitróxeno líquido ou -80 graos para reservar a longo prazo.É necesario o envío de mostras con xeo seco.

Macro Fungo

Recoméndase tecido en fase de crecemento activo.

Enxágüe o tecido con auga sen endotoxinas, despois 70% ethonal.

Garda a mostra en criotubos.