Produtos

Análise de asociación de todo o xenoma

Imaxe destacada da análise da asociación de todo o xenoma

O estudo de asociación de todo o xenoma (GWAS) ten como obxectivo identificar variantes xenéticas (xenotipo) que se asocian con trazos específicos (fenotipo).O estudo GWAS investiga os marcadores xenéticos que cruzan o xenoma completo dun gran número de individuos e prevé asociacións xenotipo-fenotipo mediante análises estatísticas a nivel poboacional.Aplicouse amplamente na investigación de enfermidades humanas e na minería de xenes funcionais en trazos complexos de animais ou plantas.

Contacta connosco

Detalles do servizo

Resultado Demo

Publicación destacada

1. Vantaxes do servizo

● Casos de proxectos abundantes: desde a súa creación en 2009, BMKGENE completou centos de proxectos de especies na investigación GWAS poboacional, axudou aos investigadores a publicar máis de 100 artigos e o factor de impacto acumulado alcanzou os 500.
● Analistas profesionais.
● Ciclo de análise curto.
● Minería de datos precisa.

2. Especificacións do servizo

Tipo	Escala de poboación	Estratexia de secuenciación e profundidade
SLAF-GWAS	Número de mostra ≥200	Tamaño do xenoma < 400 M, con xenoma ref, recoméndase WGS
		Tamaño do xenoma ≤ 1G, etiquetas 100K e 10X
		1G ≤ Tamaño do xenoma ≤ 2G, etiquetas 200K e 10X
		Tamaño do xenoma > 2G, etiquetas 300K e 10X
WGS-GWAS	Número de mostra ≥200	10X por cada mostra

3. Selección do material

Diferentes variedades, subespecies, variedades autóctonas/bancos de xenes/familias mixtas/recursos silvestres

Diferentes variedades, subespecies, razas autóctonas

Familia de medio irmán/familia de irmáns completos/recursos salvaxes

4. Análise da bioinformación

● Análise de asociacións de todo o xenoma
● Análise e cribado de SNP significativos
● Anotación funcional do xene candidato

5. Fluxo de traballo do servizo

Deseño de experimentos

Entrega da mostra

extracción de ARN

Construción da biblioteca

Secuenciación

Análise de datos

Servizos posvenda

Anterior: Secuenciación de ARN dun só núcleo

Seguinte:

a.Fenotipo QC

Histograma de distribución de frecuencias

Estadística de fenotipos

b.Análise de asociacións (Modelo: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

Trama QQ

Trama Manhattan

Ano	Xornal	IF	Título
2022	NC	17.69	Bases xenómicas dos giga-cromosomas e giga-xenoma da peonía arbórea Paeonia ostii
2015	NP	7.43	As pegadas de domesticación ancoran rexións xenómicas de importancia agronómica na soia
2018	MP	9.32	A resecuenciación do xenoma completo dunha colección mundial de accesos de colza revela a base xenética da diverxencia dos seus ecotipos
2022	HR	7.29	A análise de asociación de todo o xenoma proporciona información molecular sobre a variación natural do tamaño da semente de sandía