BMKCloud Inicie sesión

Produtos

Secuenciación de metatranscriptoma

Aproveitando a tecnoloxía de secuenciación de Illumina, o servizo de secuenciación de metatranscriptoma de BMKGene deixa a expresión xénica dinámica dunha variedade diversa de microbios, que abarca eucariotas a procariotas e virus, dentro de ambientes naturais como o solo, a auga, o mar, as tolo e o intestino. O noso servizo integral habilita aos investigadores para afondar en complexos perfís de expresión xénica das comunidades microbianas. Máis aló da análise taxonómica, o noso servizo de secuenciación de metatranscriptoma facilita a exploración no enriquecemento funcional, arroxando a luz sobre xenes expresados de forma diferente e os seus roles. Descubra unha riqueza de ideas biolóxicas ao navegar polas complexas paisaxes da expresión xénica, a diversidade taxonómica e a dinámica funcional dentro destes diversos nichos ambientais.

Póñase en contacto connosco

Detalles do servizo

Bioinformática

Resultados de demostración

Publicacións destacadas

Características do servizo

● esgotamento do ARNm seguido da preparación da biblioteca de ARNm direccional.

● Secuenciación en Illumina Novaseq.

Vantaxes do servizo

●Estuda os cambios de complexas comunidades microbianas:Isto sucede a nivel transcripcional e explora novos xenes potenciais.

●Explicando as interaccións da comunidade microbiana co hóspede ou o ambiente.

●Análise bioinformática completa: Isto ofrece información sobre as composicións taxonómicas e funcionais da comunidade, así como a análise de expresión xénica diferencial.

●Anotación xénica extensa:Empregando bases de datos de funcións xénicas actualizadas para información informativa sobre expresión xénica de comunidades microbianas.

●Soporte post-venda:O noso compromiso esténdese máis alá da finalización do proxecto cun período de servizo posterior a 3 meses. Durante este tempo, ofrecemos un seguimento do proxecto, asistencia de solución de problemas e sesións de Q&A para abordar as consultas relacionadas cos resultados.

Especificacións de servizo

Plataforma de secuenciación	Estratexia de secuenciación	Datos recomendados	Control de calidade de datos
Illumina Novaseq	PE150	12 GB	Q30≥85%

Requisitos da mostra

Concentración (ng/µl)	Cantidade total (µg)	Volume (µl)	OD260/280	OD260/230	Rin
≥50	≥1,0	≥20	1.8-2.0	1.0-2.5	≥6,5

Fluxo de traballo de servizo

Entrega de mostra

Construción da biblioteca

Secuenciación

Análise de datos

Servizos despois da venda

Anterior: Asemblea de xenoma de fungos de novo

Seguinte: Secuenciación de ARN procariota

Inclúe a seguinte análise:

● Control de calidade de secuenciación de datos

● Montaxe de transcrición

● Anotación taxonómica e abundancia

● Anotación funcional e abundancia

● Cuantificación de expresión e análise diferencial

Distribución taxonómica de cada mostra:

Análise da diversidade beta: UPGMA

Anotación funcional - Go Abundancia

Abundancia de taxonomía diferencial - Lefse

Explora os avances facilitados polos servizos de secuenciación de meta transcriptómicas de BMKGene a través dunha colección curada de publicacións.

Lu, Z. et al. (2023) "A tolerancia ao ácido das bacterias que utilizan o lactato da orde Bacteroidales contribúe á prevención da acidosis ruminal en cabras adaptadas a unha dieta de alto concentrado",Nutrición animal, 14, pp. 130–140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.

Canción, Z. et al. (2017) 'Desenvolvendo a microbiota funcional do núcleo na fermentación tradicional de estado sólido por amplicóns de alto rendemento e secuenciación de metatranscriptómicas ",Fronteiras en microbioloxía, 8 (Jul). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/completo.

Wang, W. et al. (2022) 'Novas micovirus descubertas a partir dunha enquisa de metatranscriptomics do fungo alternario fitopatogénico',Virus, 14 (11), p. 2552. Doi: 10.3390/v14112552/s1.

Wei, J. et al. (2022) 'A análise do metatranscriptoma paralelo revela a degradación dos metabolitos secundarios vexetais por escaravellos e os seus simbiontos intestinais ",Molecular Ecoloxía, 31 (15), pp. 3999–4016. doi: 10.1111/mec.16557.