Transcriptoma completo de Pacbio

A secuenciación de transcritomas de lonxitude completa de PacBio, Isoseq, permite a identificación precisa das isoformas de transcritos, o que arroxa luz sobre a poliadenilación e o empalme alternativos e leva a unha análise da expresión xénica máis precisa. A canle de transcritomas de lonxitude completa de PacBio de BMKCloud está deseñada para analizar bibliotecas de ADNc secuenciadas en modo de secuenciación por consenso circular (CCS) e identifica secuencias non quiméricas de lonxitude completa (FLNC), que logo se agrupan en transcritos non redundantes. Unha análise BUSCO posterior avalía a integridade do ensamblaxe do transcritoma. A partir do transcritoma ensamblado, realízanse múltiples análises: empalme alternativo, repetición de secuencia simple (SSR), predición de lncRNA e xenes diana correspondentes, predición de novos xenes, análise de familias de xenes, análise de factores de transcrición e anotación funcional de transcritos.