Proteómica
Características
●Proteómica cualitativa: usa LC-MS/MS para identificar a composición de proteínas en mostras complexas (tiras de xel SDS-PAGE, IP, Co-IP, Pull-down). Vantaxes: sen límite no número de mostras, detección rápida, procesamento sinxelo da mostra, alto rendemento e capacidade para detectar proteínas de baixa abundancia.
● Proteómica cuantitativa sen etiquetas: tecnoloxía non marcada con detección de mostras individuais. Cuantifica as proteínas comparando as intensidades do sinal peptídico nos datos de espectrometría de masas. Vantaxes: funcionamento sinxelo, alto rendemento (sen límite de número de mostras) e ampla aplicabilidade (adecuada para a comparación diferencial de proteínas por "presenza/ausencia" entre especies).
● Proteómica cuantitativa DIA: Adopta o modo de adquisición independente dos datos (DIA), explorando todos os ións en xanelas segmentadas para capturar a información completa dos ións. Vantaxes: Mellor repetibilidade, maior cobertura de proteínas e cuantificación máis precisa que o modo DDA (TMT/sen etiquetas), ideal para estudos de mostras grandes.
● Proteómica cuantitativa sen etiquetas 4D/proteómica cuantitativa 4D-DIA: baseada no espectrómetro de masas timsTOF de Bruker, que engade mobilidade iónica (sección transversal de colisión) á separación 3D tradicional. Vantaxes: mellora da utilización e precisión dos ións, mellora integral na profundidade de cobertura, sensibilidade e rendemento; maior profundidade de identificación que o método 3D tradicional.
● Proteómica cuantitativa sen etiqueta Astral/Proteómica cuantitativa Astral DIA: baseada no espectrómetro de masas de alta resolución Orbitrap™ Astral™. Vantaxes: maior rendemento (máis de 100 mostras/día cun gradiente de 8 minutos), cobertura máis profunda (máis de 8000 proteínas detectadas en células Hela en 8 minutos) e maior sensibilidade (requírese menos mostra).
● Proteómica cuantitativa TMT: usa 18 etiquetas isotópicas para marcar péptidos para a detección simultánea de 18 mostras. Vantaxes: alta estabilidade (mínima interferencia na estabilidade do instrumento, pequeno erro do sistema) e alta sensibilidade (o fraccionamento reduce a complexidade da mostra, mellorando a detección de proteínas de baixa abundancia).
● Proteómica dirixida PRM: tecnoloxía dirixida de alta resolución para a detección selectiva de proteínas/péptidos diana. Vantaxes: permite a cuantificación relativa/absoluta e a verificación de resultados proteómicos cuantitativos; sen restrición de anticorpos, aplicabilidade máis ampla que o Western Blot e o ELISA.
Vantaxes
● Equipamento avanzado: Equipado tanto con plataformas proteómicas convencionais como con espectrómetros de masas de alta profundidade avanzados (por exemplo, 4D, Astral).
● Detección estable: Os rigorosos sistemas de control de calidade garanten procesos de proba consistentes e estables.
● Resultados fiables: a análise cualitativa e cuantitativa simultánea proporciona a expresión relativa, o peso molecular, a abundancia e outros datos clave para cada grupo.
● Alta automatización: os sistemas LC-MS automatizados permiten unha análise rápida e un excelente rendemento de separación.
Especificacións do servizo
| Comparación de técnicas proteómicas non dirixidas | ||||
| Sen etiquetas | DIA | TMT | ||
| Etiquetado | NO | NO | SI | |
| Modo de dixitalización de datos | DDA | DDA | DIA | DDA |
| Reproducibilidade | Inferior | Alto | Alto | |
| Sensibilidade | Inferior | Alto | Alto | |
| Multiplexación | NO | SI | NO | SI |
| Aplicación | Comparación da presenza/ausencia de proteínas | Mostras a grande escala | Análise de diferentes lotes de mostras | Comparación da expresión diferencial de proteínas na mesma especie e tecido |
| Precisión | ★ | ★★(4D/Astral DlA ★★★) | ★★ | |
| Conteo de deteccións | ★ | ★★(4D/Astral D|A★★★) | ★★ | |
Requisitos da mostra
Estás a preguntarte se as túas mostras cumpren os nosos criterios? Fai clic aquí para obter o nosorequisitos máis recentes da mostra.
Fluxo de traballo do servizo
Recollida de mostras
Extracción de proteínas
Dixestión encimática
Separación
Adquisición de datos
Análise de datos
Entrega de datos
Proteómica cualitativa
1. Solución/xel de proteínas: táboa de resultados cualitativos
2. Resultados da busca na base de datos
2.1 Lista de segmentos peptídicos coincidentes na busca na base de datos
2.2 Lista de proteínas coincidentes na busca na base de datos
2.3 Lista de modificacións coincidentes na busca na base de datos (fosforilación, ubiquitinación, etc.)
3. Datos brutos
Proteómica cuantitativa(Sen etiquetas/DIA/TMT)
1. Preprocesamento de datos
1.1 Busca na base de datos de proteínas
2. Análise da expresión de proteínas
2.1 Análise de compoñentes principais (ACP)
2.2 Desviación estándar relativa (RSD)
2.3 Distribución de tendencia de K-medias
2.4 Avaliación da reproducibilidade
2.5 Mapa de calor da expresión de proteínas
3. Anotación funcional
3.1 Anotación funcional de GO
3.2 Anotación funcional de KEGG
3.3 Anotación funcional do COG
3.4 Anotación funcional de GOslim
3.5 Anotación do dominio da estrutura da proteína Pfam
4. Análise diferencial de proteínas (réplicas biolóxicas ≥ 3)
4.1 Resultados da análise diferencial de proteínas
4.2 Distribución dos cambios diferenciais no pregamento proteico (FC)
4.3 Análise estatística da cantidade diferencial de proteínas
4.4 Gráfico diferencial do volcán de proteínas
4.5 Mapa de calor da agrupación diferencial de proteínas
4.6 Anotación funcional e análise de enriquecemento diferencial de proteínas GO
4.7 Anotación funcional e análise de enriquecemento diferencial de proteínas KEGG
4.8 Anotación funcional COG de proteínas diferenciais
4.9 Análise de anotación e enriquecemento diferencial de proteínas GOslim
4.10 Anotación e análise de enriquecemento de dominios de estrutura diferencial de proteínas
5. Análise de interacción de redes de proteínas
6. Anotación da ruta do reactoma proteico
7. Predición do péptido sinal
8. Localización subcelular de proteínas
Proteómica cuantitativa(PRM)
1. Resultados da cuantificación de proteínas PRM
1.1 Visión xeral dos resultados da cuantificación
1.2 Distribución das áreas dos picos de ións fragmentados para segmentos peptídicos
Proteómica cuantitativa
1.Análise de expresión de proteínas
↑Análise de compoñentes principais (ACP)↑Desviación estándar relativa (RSD)
↑Distribución de tendencia de K-medias ↑CorrelaciónAanálise dePproteínaEexpresiónLniveis
↑ Mapa de calor da expresión de proteínas
2. Anotación funcional
↑Anotación funcional de GO↑Anotación funcional de KEGG
↑ Anotación funcional de COG ↑ Anotación funcional de GOslim
↑ Anotación do dominio da estrutura da proteína Pfam
3.Análise de interacción de redes de proteínas
↑ Análise de interacción de redes de proteínas
4.Predición de péptidos sinalizadores
↑ Predición do péptido de sinalización
5. Localización subcelular de proteínas
↑Localización subcelular de proteínas
| 2025 | As vesículas apoptóticas derivadas de células nai mesenquimais melloran as respostas de hipersensibilidade mediante a indución da apoptose das células T CD8+ con sobrecarga de calcio e disfunción mitocondrial | Ciencia Avanzada |
| 2024 | A multiómica integrada demostra unha maior eficacia antitumoral de | Oncoloxía translacional |
| 2024 | A análise multiómica revela as características distintivas das vías metabólicas que apoian o Tamaño do froito e variación da cor da cabaza xigante | Int. J. Mol. Science. |
| 2024 | A elaboración de perfís do transcriptoma e do metaboloma proporciona novas perspectivas sobre a atrofia muscular por desuso en polo: o posible papel das fibras musculares de contracción rápida | Int. J. Mol. Science. |
| 2023 | A análise multiómica revela a influencia da tetraciclina no crecemento da raíz de raigrás. | Revista de materiais perigosos |
