Secuenciación de bisulfito do xenoma completo (WGBS)
Esta técnica, baseada no tratamento do ADN con bisulfito para inducir a conversión de citosinas non metiladas en uracilo (C a U), deixando as citosinas metiladas sen cambios, constitúese a metodoloxía de referencia para a exploración en profundidade da metilación do ADN, concretamente a quinta posición na citosina (5-mC), un regulador fundamental da expresión xénica e da actividade celular.
Esta técnica ofrece unha resolución nunha soa base, o que permite aos investigadores investigar exhaustivamente o metiloma e descubrir patróns de metilación anormais dentro das mostras. Ao empregar WGBS, os científicos poden obter información sen precedentes sobre as paisaxes de metilación a nivel de todo o xenoma, proporcionando unha comprensión matizada dos mecanismos epixenéticos que subxacen a diversos procesos biolóxicos e enfermidades.
Características do servizo
● Secuenciación en Illumina NovaSeq.
● Require un xenoma de referencia.
● Engádese ADN lambda para monitorizar a eficiencia da conversión de bisulfito.
Vantaxes do servizo
●Estándar de ouro para a investigación da metilación do ADNEsta tecnoloxía madura ten alta precisión e boa reproducibilidade.
●Ampla cobertura e resolución de base única:A detección de sitios de metilación realízase a nivel de todo o xenoma.
●Plataforma completa:Ofrecemos un servizo integral que abrangue desde o procesamento de mostras, a construción de bibliotecas e a secuenciación ata a análise bioinformática.
●Ampla experienciaTemos unha ampla gama de proxectos completados nunha diversa gama de especies. BMKGENE achega máis dunha década de experiencia, un equipo de análise altamente cualificado, contido completo e unha excelente asistencia posvenda.
●Posibilidade de unirse coa análise transcriptómicaPermitindo a análise integrada de WGBS con outros datos ómicos como a secuenciación de ARN.
Especificacións de mostra
| Biblioteca | Estratexia de secuenciación | Saída de datos recomendada | Control de calidade |
| Tratado con bisulfito | Illumina PE150 | 30x profundidade | Q30 ≥ 85% Conversión de bisulfito > 99% |
Requisitos da mostra
| Concentración (ng/µL) | Cantidade total (ng) | Requisitos adicionais | |
| ADN xenómico | ≥ 1,25 | ≥ 100 | Degradación ou contaminación limitadas |
Fluxo de traballo do servizo
Entrega de mostras
Extracción de ADN
Construción de bibliotecas
Secuenciación
Análise de datos
Entrega de datos
O servizo inclúe a seguinte análise:
● Control de calidade da secuenciación bruta;
● Mapeo ao xenoma de referencia;
● Detección de bases metiladas a 5 mC;
● Análise da distribución e anotación da metilación;
● Análise de rexións diferencialmente metiladas (DMR);
● Anotación funcional de xenes asociados a DMRs.
Detección de metilación de 5 mC: tipos de sitios metilados
Mapa de metilación. Distribución xenómica da metilación de 5 mC
Anotación de rexións altamente metiladas
Rexións diferencialmente metiladas: xenes asociados
Rexións diferencialmente metiladas: anotación de xenes asociados (Ontoloxía xénica)
Explora os avances na investigación facilitados polos servizos de secuenciación de bisulfito do xenoma completo de BMKGene a través dunha colección seleccionada de publicacións.
Fan, Y. et al. (2020) «Análise dos perfís de metilación do ADN durante o desenvolvemento do músculo esquelético ovino mediante a secuenciación de bisulfito do xenoma completo»,Xenómica de BMC, 21 (1), páxs 1–15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) «Novas perturbacións da metilación do ácido desoxirribonucleico en traballadores expostos ao cloruro de vinilo»,Toxicoloxía e Saúde Industrial, 38 (7), páxinas 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) «Relacións entre a metilación do xenoma, os niveis de ARN non codificantes, ARNm e metabolitos na maduración do froito do tomate»,O diario das plantas, 103(3), páxinas 980–994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
