૧૦x જીનોમિક્સ વિઝિયમ સ્પેશિયલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ
ટેકનિકલ યોજના
સુવિધાઓ
● રિઝોલ્યુશન: 100 µM
● સ્પોટ વ્યાસ: 55 µM
● જગ્યાઓની સંખ્યા: ૪૯૯૨
● કેપ્ચર ક્ષેત્ર: 6.5 x 6.5 મીમી
● દરેક બારકોડેડ સ્પોટ 4 વિભાગોથી બનેલા પ્રાઇમર્સથી ભરેલું હોય છે:
- mRNA પ્રાઇમિંગ અને cDNA સંશ્લેષણ માટે પોલી(dT) પૂંછડી
- એમ્પ્લીફિકેશન બાયસ સુધારવા માટે યુનિક મોલેક્યુલર આઇડેન્ટિફાયર (UMI)
- અવકાશી બારકોડ
- આંશિક વાંચન 1 સિક્વન્સિંગ પ્રાઈમરનો બંધનકર્તા ક્રમ
● વિભાગોનું H&E સ્ટેનિંગ
ફાયદા
●વન-સ્ટોપ સેવા: ક્રાયો-સેક્શનિંગ, સ્ટેનિંગ, ટીશ્યુ ઑપ્ટિમાઇઝેશન, સ્પેશિયલ બારકોડિંગ, લાઇબ્રેરી તૈયારી, સિક્વન્સિંગ અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ સહિત તમામ અનુભવ અને કૌશલ્ય-આધારિત પગલાંને એકીકૃત કરે છે.
● ઉચ્ચ કુશળ ટેકનિકલ ટીમ: 250 થી વધુ પેશી પ્રકારો અને માનવ, ઉંદર, સસ્તન પ્રાણીઓ, માછલી અને છોડ સહિત 100+ પ્રજાતિઓમાં અનુભવ સાથે.
●સમગ્ર પ્રોજેક્ટ પર રીઅલ-ટાઇમ અપડેટ: પ્રાયોગિક પ્રગતિ પર સંપૂર્ણ નિયંત્રણ સાથે.
●વ્યાપક માનક બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ:પેકેજમાં 29 વિશ્લેષણ અને 100+ ઉચ્ચ-ગુણવત્તાવાળા આંકડા શામેલ છે.
●કસ્ટમાઇઝ્ડ ડેટા વિશ્લેષણ અને વિઝ્યુલાઇઝેશન: વિવિધ સંશોધન વિનંતીઓ માટે ઉપલબ્ધ.
●સિંગલ-સેલ mRNA સિક્વન્સિંગ સાથે વૈકલ્પિક સંયુક્ત વિશ્લેષણ
વિશિષ્ટતાઓ
| નમૂના આવશ્યકતાઓ | પુસ્તકાલય | ક્રમ વ્યૂહરચના | ભલામણ કરેલ ડેટા | ગુણવત્તા નિયંત્રણ |
| OCT-એમ્બેડેડ ક્રાયો નમૂનાઓ (શ્રેષ્ઠ વ્યાસ: આશરે 6x6x6 mm³) પ્રતિ નમૂના 2 બ્લોક્સ | 10X વિઝિયમ સીડીએનએ લાઇબ્રેરી | ઇલુમિના PE150 | પ્રતિ સ્પોટ 50K PE રીડ (૬૦ જીબી) | RIN > 7 |
નમૂના તૈયારી માર્ગદર્શન અને સેવા કાર્યપ્રવાહ વિશે વધુ વિગતો માટે, કૃપા કરીને કોઈ સાથે વાત કરવા માટે નિઃસંકોચ રહોBMKGENE નિષ્ણાત
સેવા કાર્યપ્રવાહ
નમૂના તૈયારીના તબક્કામાં, ઉચ્ચ-ગુણવત્તાવાળા RNA મેળવી શકાય તેની ખાતરી કરવા માટે પ્રારંભિક બલ્ક RNA નિષ્કર્ષણ ટ્રાયલ કરવામાં આવે છે. પેશી ઑપ્ટિમાઇઝેશન તબક્કામાં વિભાગોને રંગીન અને વિઝ્યુઅલાઈઝ કરવામાં આવે છે અને પેશીમાંથી mRNA મુક્તિ માટે અભેદ્યતા શરતોને ઑપ્ટિમાઇઝ કરવામાં આવે છે. ત્યારબાદ ઑપ્ટિમાઇઝ પ્રોટોકોલ લાઇબ્રેરી બાંધકામ દરમિયાન લાગુ કરવામાં આવે છે, ત્યારબાદ સિક્વન્સિંગ અને ડેટા વિશ્લેષણ કરવામાં આવે છે.
સંપૂર્ણ સેવા કાર્યપ્રવાહમાં રીઅલ-ટાઇમ અપડેટ્સ અને ક્લાયન્ટ પુષ્ટિકરણનો સમાવેશ થાય છે જેથી પ્રતિભાવશીલ પ્રતિસાદ લૂપ જાળવી શકાય, જે પ્રોજેક્ટના સરળ અમલીકરણને સુનિશ્ચિત કરે છે.
નીચેના વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે:
ડેટા ગુણવત્તા નિયંત્રણ:
o ડેટા આઉટપુટ અને ગુણવત્તા સ્કોર વિતરણ
o સ્થળ દીઠ જનીન શોધ
o ટીશ્યુ કવરેજ
આંતરિક-નમૂના વિશ્લેષણ:
o જનીન સમૃદ્ધિ
o સ્પોટ ક્લસ્ટરિંગ, જેમાં ઘટાડેલા પરિમાણ વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે
o ક્લસ્ટરો વચ્ચે વિભેદક અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ: માર્કર જનીનોની ઓળખ
o માર્કર જનીનોનું કાર્યાત્મક ટીકા અને સંવર્ધન
આંતર-જૂથ વિશ્લેષણ
o બંને નમૂનાઓ (દા.ત. રોગગ્રસ્ત અને નિયંત્રણ) અને ફરીથી ક્લસ્ટરમાંથી ફોલ્લીઓનું પુનઃસંયોજન
o દરેક ક્લસ્ટર માટે માર્કર જનીનોની ઓળખ
o માર્કર જનીનોનું કાર્યાત્મક ટીકા અને સંવર્ધન
o જૂથો વચ્ચે સમાન ક્લસ્ટરની વિભેદક અભિવ્યક્તિ
આંતરિક-નમૂના વિશ્લેષણ
સ્પોટ ક્લસ્ટરિંગ
માર્કર જનીનો ઓળખ અને અવકાશી વિતરણ
આંતર-જૂથ વિશ્લેષણ
બંને જૂથો અને પુનઃક્લસ્ટરમાંથી ડેટા સંયોજન
નવા ક્લસ્ટરોના માર્કર જનીનો
10X વિઝિયમ દ્વારા BMKGene ની અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ સેવા દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલી પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો. આ ફીચર્ડ પ્રકાશનોમાં:
ચેન, ડી. એટ અલ. (2023) 'mthl1, સસ્તન પ્રાણીઓના સંલગ્ન GPCRs નું સંભવિત ડ્રોસોફિલા હોમોલોગ, માખીઓમાં ઇન્જેક્ટેડ ઓન્કોજેનિક કોષો માટે એન્ટિટ્યુમર પ્રતિક્રિયાઓમાં સામેલ છે',યુનાઇટેડ સ્ટેટ્સ ઑફ અમેરિકાની નેશનલ એકેડેમી ઑફ સાયન્સની કાર્યવાહી, ૧૨૦(૩૦), પાનું. e૨૩૦૩૪૬૨૧૨૦. doi: /૧૦.૧૦૭૩/pnas.૨૩૦૩૪૬૨૧૨૦
ચેન, વાય. એટ અલ. (2023) 'સ્ટીલ સ્પેશીયોટેમ્પોરલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક ડેટાના ઉચ્ચ-રીઝોલ્યુશન ડિલાઇનેશનને સક્ષમ કરે છે',બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સમાં બ્રીફિંગ્સ, 24(2), પૃષ્ઠ 1–10. doi: 10.1093/BIB/BBAD068.
લિયુ, સી. એટ અલ. (૨૦૨૨) 'ઓર્કિડ ફૂલોના વિકાસમાં ઓર્ગેનોજેનેસિસનો અવકાશીય ટેમ્પોરલ એટલાસ',ન્યુક્લિક એસિડ સંશોધન, 50(17), પાના. 9724–9737. doi: 10.1093/NAR/GKAC773.
વાંગ, જે. એટ અલ. (2023) 'સ્પેશિયલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ અને સિંગલ-ન્યુક્લિયસ આરએનએ સિક્વન્સિંગનું સંકલન ગર્ભાશયના લીઓમાયોમા માટે સંભવિત ઉપચારાત્મક વ્યૂહરચનાઓને જાહેર કરે છે',ઇન્ટરનેશનલ જર્નલ ઓફ બાયોલોજિકલ સાયન્સિસ, 19(8), પૃષ્ઠ 2515–2530. doi: 10.7150/IJBS.83510.
