૧૬એસ/૧૮એસ/આઇટીએસ એમ્પ્લીકોન સિક્વન્સિંગ-પેકબાયો
સેવા સુવિધાઓ
● સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મ: પેકબાયો રેવિઓ
● સિક્વન્સિંગ મોડ: CCS (HiFi રીડ્સ)
● HiFi SMRT બેલ લાઇબ્રેરી તૈયાર કરતા પહેલા લક્ષ્ય ક્ષેત્રનું વિસ્તરણ અને ત્યારબાદ એમ્પ્લીકોન્સનું ટેન્ડમ લિંકિંગ.
સેવાના ફાયદા
●ઉચ્ચ વર્ગીકરણ રીઝોલ્યુશન: ટીહેન શોર્ટ-એમ્પ્લીકોન સિક્વન્સિંગ,પ્રજાતિ સ્તરે ઉચ્ચ OTU વર્ગીકરણ દરને સક્ષમ બનાવે છે.
●ખૂબ જ સચોટ બેઝ કોલિંગ: PacBio CCS મોડ સિક્વન્સિંગ (HiFi રીડ્સ).
●આઇસોલેશન-મુક્ત: પર્યાવરણીય નમૂનાઓમાં માઇક્રોબાયલ રચનાની ઝડપી ઓળખ.
●વ્યાપકપણે લાગુ: વિવિધ માઇક્રોબાયલ સમુદાય અભ્યાસ.
●વ્યાપક બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણ: ડેટાબેઝ, એનોટેશન, OTU/ASV ના સંદર્ભમાં વિવિધ વિશ્લેષણ સાથે નવીનતમ QIIME2 પેકેજ (માઇક્રોબાયલ ઇકોલોજીમાં માત્રાત્મક આંતરદૃષ્ટિ).
●વ્યાપક કુશળતા: વાર્ષિક ધોરણે હજારો એમ્પ્લીકોન સિક્વન્સિંગ પ્રોજેક્ટ્સ હાથ ધરવા સાથે, BMKGENE એક દાયકાથી વધુનો અનુભવ, ઉચ્ચ કુશળ વિશ્લેષણ ટીમ, વ્યાપક સામગ્રી અને ઉત્તમ પોસ્ટ-સેલ્સ સપોર્ટ લાવે છે.
સેવા સ્પષ્ટીકરણો
| પુસ્તકાલય | સિક્વન્સિંગ સ્ટ્રેટેજી | ભલામણ કરેલ ડેટા |
| એમ્પ્લીકોન | પેકબાયો રેવિયો | ૧૦/૩૦/૫૦ કે ટૅગ્સ (સીસીએસ) |
નમૂના આવશ્યકતાઓ
| સાંદ્રતા (ng/µL) | કુલ રકમ (µg) | વોલ્યુમ (µL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥૨૦ |
ભલામણ કરેલ નમૂના વિતરણ
નમૂનાઓને પ્રવાહી નાઇટ્રોજનમાં 3-4 કલાક માટે ફ્રીઝ કરો અને પ્રવાહી નાઇટ્રોજન અથવા -80 ડિગ્રીથી લાંબા ગાળાના રિઝર્વેશનમાં સ્ટોર કરો. ડ્રાય-આઇસ સાથે નમૂના શિપિંગ જરૂરી છે.
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
નમૂના વિતરણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
ક્રમ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
નીચેના વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે:
● કાચા ડેટા ગુણવત્તા નિયંત્રણ
● OTU ક્લસ્ટરિંગ/ડી-નોઈઝ (ASV)
● OTU ટીકા
● આલ્ફા વિવિધતા વિશ્લેષણ: શેનોન, સિમ્પસન અને ACE સહિત બહુવિધ સૂચકાંકો.
● બીટા વિવિધતા વિશ્લેષણ
● આંતર-જૂથ વિશ્લેષણ
● સહસંબંધ વિશ્લેષણ: પર્યાવરણીય પરિબળો અને OUT રચના અને વિવિધતા વચ્ચે
● 16S કાર્યાત્મક જનીન આગાહી
વર્ગીકરણ વિતરણનો હિસ્ટોગ્રામ
સમુદાય વિતરણ ફાયલોજેનેટિક વૃક્ષ
આલ્ફા વિવિધતા વિશ્લેષણ: ACE
સૂચકાંક
બીટા વિવિધતા વિશ્લેષણ: PCoA
આંતરજૂથ વિશ્લેષણ: ANOVA
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા PacBio સાથે BMKGene ની એમ્પ્લીકોન સિક્વન્સિંગ સેવાઓ દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલી પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો.
ગાઓ, એક્સ. અને વાંગ, એચ. (2023) 'આલ્પાઇન મેડોવ પર બે વૃદ્ધિ તબક્કાઓ સાથે આલ્પાઇન મેરિનો ઘેટાંમાં વિવિધ ફેનોલોજી (રેગ્રીન વિરુદ્ધ ઘાસવાળું) માટે અનુકૂલન દરમિયાન રુમેન બેક્ટેરિયલ પ્રોફાઇલ્સ અને કાર્યોનું તુલનાત્મક વિશ્લેષણ', આથો, 9(1), પૃષ્ઠ 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
લી, એસ. એટ અલ. (2023) 'કલ્ચ્યુરોમિક્સ-આધારિત મેટાજેનોમિક્સ અને ઉચ્ચ-રિઝોલ્યુશન વિશ્લેષણનો ઉપયોગ કરીને રણની જમીનમાં માઇક્રોબાયલ ડાર્ક મેટરને કેપ્ચર કરવું', npj બાયોફિલ્મ્સ અને માઇક્રોબાયોમ્સ 2023 9:1, 9(1), પૃષ્ઠ 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
મુ, એલ. એટ અલ. (2022) 'આલ્ફલ્ફા, ચોખાના ભૂસા અને ઘઉંના ભૂસાથી તૈયાર કરાયેલ મિશ્ર સાઇલેજની આથો લાક્ષણિકતાઓ, બેક્ટેરિયલ વિવિધતા અને એરોબિક સ્થિરતા પર ફેટી એસિડ ક્ષારની અસરો', જર્નલ ઓફ ધ સાયન્સ ઓફ ફૂડ એન્ડ એગ્રીકલ્ચર, 102(4), પૃષ્ઠ. 1475–1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
યાંગ, જે. એટ અલ. (2023) 'પુખ્ત ઝેબ્રાફિશમાં ઓક્સાઝોલોન-પ્રેરિત આંતરડાના ઓક્સિડેટીવ તણાવમાં સોન્ચુસ બ્રેકીઓટસ ડીસીના અર્કના એન્ટીઑકિસડન્ટ અસરોમાં ઓક્સિડેટીવ તણાવ બાયોમાર્કર્સ અને ગટ માઇક્રોબાયોટા વચ્ચેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયા', એન્ટીઑકિસડન્ટ્સ 2023, વોલ્યુમ 12, પૃષ્ઠ 192, 12(1), પૃષ્ઠ 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
