ડીએનએ/આરએનએ સિક્વન્સિંગ - નેનોપોર સિક્વન્સર
સેવા વિગતો સુવિધાઓ
| પ્લેટફોર્મ | લાઇબ્રેરીનું કદ | સૈદ્ધાંતિક ડેટા ઉપજ (પ્રતિ કોષ) | સિંગલ-બેઝ ચોકસાઈ | અરજીઓ |
| નેનોપોર | 8Kb, 10kb, 20kb, અલ્ટ્રાલોંગ, cDNA-PCR | ૭૦-૯૦ જીબી/સેલ | ૮૫-૯૨% | એસવી કોલિંગ, ડી નોવો, પૂર્ણ-લંબાઈનું ક્રમ, આઇસો-સેક, જનીન એનોટેશન, ડીએનએ મિથાઈલેશનની શોધ |
સેવાના ફાયદા
● વિવિધ પ્રજાતિઓ સાથે હજારો બંધ પ્રોજેક્ટ્સ સાથે PacBio સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મ પર 5 વર્ષથી વધુનો અનુભવ.
● BMKGENE એ ઓક્સફોર્ડ નેનોપોરનો સત્તાવાર ભાગીદાર છે, જેની પાસે ડ્યુઅલ પ્લેટફોર્મ RNA/DNA પ્રમાણપત્ર છે.
● સંપૂર્ણ સાધનો અને પૂરતા સિક્વન્સિંગ થ્રુપુટ સાથે સિક્વન્સર્સના મુખ્ય પ્રવાહના મોડેલો ઉપલબ્ધ છે.
● નેનોપોર પ્લેટફોર્મ પર આધારિત, 10 થી વધુ પ્રાણી અને વનસ્પતિ ડેનોવો સંશોધનો આંતરરાષ્ટ્રીય સ્તરે પ્રખ્યાત જર્નલોમાં પ્રકાશિત થયા છે.
નમૂના આવશ્યકતાઓ
| નમૂનાનો પ્રકાર | રકમ | સાંદ્રતા (ક્યુબિટ ®) | વોલ્યુમ | શુદ્ધતા | અન્ય |
| જીનોમિક ડીએનએ | ડેટા જરૂરિયાત પર આધાર રાખે છે | ≥20 ન્યુગ્રા/μl | ≥૧૫μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5; ૨૬૦ nm પર સ્પષ્ટ ટોચ, કોઈ દૂષણ નથી | સાંદ્રતા ક્યુબિટ અને ક્યુબિટ/નેનોપોર ≤ 2 દ્વારા માપવાની જરૂર છે. |
| કુલ આરએનએ | ≥૧.૨μg | ≥100μg/μl | ≥૧૫μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5; કોઈ દૂષણ નથી | RIN મૂલ્ય ≥7.5 |
સેવા કાર્યપ્રવાહ
નમૂનાની તૈયારી
પુસ્તકાલય બાંધકામ
ક્રમ
ડેટા વિશ્લેષણ
પ્રોજેક્ટ ડિલિવરી
ડીએનએ નમૂનાનું ડેટા ગુણવત્તા મૂલ્યાંકન
કોષ્ટક 1. સ્વચ્છ ડેટા પર આંકડા.
| બીએમકેઆઈડી | કાચોસેકનમ | કાચો સમબેઝ | ક્લીનસેકનમ | ક્લીનસમબેઝ | સ્વચ્છN50Len | સ્વચ્છN90Len | સ્વચ્છ મીનલેન | ક્લીનમેક્સલેન | સ્વચ્છ સરેરાશ ક્વોલ |
| ડીએનએ_બીએમકે01 | ૧,૨૧૮,૨૩૯ | ૨૬.૩૭ | ૧,૧૨૧,૭૩૬ | ૨૫.૯૦ | ૨૮,૦૧૪ | ૧૫,૭૬૪ | ૨૩,૦૯૦ | ૧૪૩,૧૮૧ | 9 |
આરએનએ નમૂનાનું ડેટા ગુણવત્તા મૂલ્યાંકન
કોષ્ટક 1. સ્વચ્છ ડેટા પર આંકડા.
| ફાઇલનું નામ | ક્લાયન્ટ આઈડી | રીડન્યૂ | આધાર સંખ્યા | એન50 | સરેરાશ લંબાઈ | મહત્તમ લંબાઈ | મીનક્યુસ્કોર |
| આરએનએ_બીએમકે001 | C2 | ૮,૯૪૭,૭૦૮ | ૪,૦૪૭,૨૩૦,૦૮૩ | ૩૯૮ | ૪૫૨ | ૧૨૯,૨૨૭ | પ્રશ્ન ૧૨ |
આકૃતિ 1. વાંચન લંબાઈ વિતરણ
આકૃતિ 2. સ્વચ્છ ડેટાનું ગુણવત્તા સ્કોર વિતરણ
આકૃતિ 3. સ્વચ્છ ડેટાની લંબાઈ અને ગુણવત્તા સ્કોર વિતરણ
