ડીએનએ/આરએનએ સિક્વન્સિંગ - નેનોપોર સિક્વન્સર
સેવા વિગતો સુવિધાઓ
| પ્લેટફોર્મ | પુસ્તકાલયનું કદ | સૈદ્ધાંતિક ડેટા ઉપજ (કોષ દીઠ) | સિંગલ-બેઝ ચોકસાઈ | અરજીઓ |
| નેનોપોર | 8Kb, 10kb, 20kb, અલ્ટ્રાલોંગ, cDNA-PCR | 70-90Gb/સેલ | 85-92% | એસવી કૉલિંગ, ડી નોવો, પૂર્ણ-લંબાઈની સિક્વન્સિંગ, આઇસો-સેક, જીન એનોટેશન, ડીએનએ મેથિલેશનની તપાસ |
સેવા લાભો
● વિવિધ પ્રજાતિઓ સાથે હજારો બંધ પ્રોજેક્ટ્સ સાથે PacBio સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મ પર 5 વર્ષથી વધુનો અનુભવ.
● BMKGENE ડ્યુઅલ પ્લેટફોર્મ RNA/DNA પ્રમાણપત્ર સાથે ઓક્સફર્ડ નેનોપોરનું સત્તાવાર ભાગીદાર છે.
● સંપૂર્ણ સાધનસામગ્રી અને પર્યાપ્ત સિક્વન્સિંગ થ્રુપુટ સાથે સિક્વન્સર્સના મુખ્ય પ્રવાહના મોડલ છે.
● નેનોપોર પ્લેટફોર્મ પર આધારિત, 10 થી વધુ પ્રાણી અને છોડ ડેનોવો સંશોધનો આંતરરાષ્ટ્રીય ખ્યાતિપ્રાપ્ત જર્નલમાં પ્રકાશિત થયા છે.
નમૂના જરૂરીયાતો
| નમૂનાનો પ્રકાર | રકમ | એકાગ્રતા(Qubit®) | વોલ્યુમ | શુદ્ધતા | અન્ય |
| જીનોમિક ડીએનએ | ડેટા જરૂરિયાત પર આધાર રાખે છે | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5； 260 nm પર સ્પષ્ટ ટોચ, કોઈ દૂષણ નથી | એકાગ્રતાને ક્યુબીટ અને ક્યુબીટ/નેનોપોર ≤ 2 દ્વારા માપવાની જરૂર છે |
| કુલ આરએનએ | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5；કોઈ દૂષણ નથી | RIN મૂલ્ય ≥7.5 |
સેવા વર્કફ્લો
નમૂના તૈયારી
પુસ્તકાલય બાંધકામ
સિક્વન્સિંગ
માહિતી વિશ્લેષણ
પ્રોજેક્ટ ડિલિવરી
ડીએનએ નમૂનાનું ડેટા ગુણવત્તા મૂલ્યાંકન
કોષ્ટક 1. સ્વચ્છ ડેટા પરના આંકડા.
| BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | cleanN50Len | cleanN90Len | cleanMeanLen | cleanMaxLen | cleanMeanQual |
| DNA_BMK01 | 1,218,239 છે | 26.37 | 1,121,736 છે | 25.90 છે | 28,014 છે | 15,764 પર રાખવામાં આવી છે | 23,090 પર રાખવામાં આવી છે | 143,181 છે | 9 |
આરએનએ નમૂનાનું ડેટા ગુણવત્તા મૂલ્યાંકન
કોષ્ટક 1. સ્વચ્છ ડેટા પરના આંકડા.
| ફાઈલનું નામ | ClientID | ReadNum | BaseNum | N50 | સરેરાશ લંબાઈ | મહત્તમ લંબાઈ | MeanQscore |
| RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 છે | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 છે | પ્રશ્ન12 |
આકૃતિ 1. લંબાઈ વિતરણ વાંચો
આકૃતિ 2. સ્વચ્છ ડેટાનું ગુણવત્તા સ્કોર વિતરણ
આકૃતિ 3. સ્વચ્છ ડેટાની લંબાઈ અને ગુણવત્તા સ્કોરનું વિતરણ
