-
ક્રોમેટિન ઇમ્યુનોપ્રિસિપિટેશન સિક્વન્સિંગ (ChIP-seq)
ChIP-Seq હિસ્ટોન ફેરફાર, ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળો અને અન્ય ડીએનએ-સંબંધિત પ્રોટીન માટે ડીએનએ લક્ષ્યોની જીનોમ-વ્યાપી પ્રોફાઇલિંગ પ્રદાન કરે છે.તે ચોક્કસ પ્રોટીન-ડીએનએ સંકુલને પુનઃપ્રાપ્ત કરવા માટે ક્રોમેટિન ઇમ્યુનો-પ્રિસિપિટેશન (ChIP) ની પસંદગીને જોડે છે, પુનઃપ્રાપ્ત ડીએનએના ઉચ્ચ-થ્રુપુટ સિક્વન્સિંગ માટે નેક્સ્ટ-જનરેશન સિક્વન્સિંગ (NGS) ની શક્તિ સાથે.વધારામાં, કારણ કે પ્રોટીન-ડીએનએ સંકુલ જીવંત કોષોમાંથી પુનઃપ્રાપ્ત થાય છે, બંધનકર્તા સ્થળોની તુલના વિવિધ કોષ પ્રકારો અને પેશીઓમાં અથવા વિવિધ પરિસ્થિતિઓમાં કરી શકાય છે.એપ્લિકેશનો ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ રેગ્યુલેશનથી લઈને ડેવલપમેન્ટલ પાથવેઝથી લઈને ડિસીઝ મિકેનિઝમ્સ અને તેનાથી આગળની શ્રેણીની છે.
પ્લેટફોર્મ: Illumina NovaSeq 6000
-
સંપૂર્ણ જીનોમ બિસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગ
સાયટોસિન (5-mC) માં પાંચમા સ્થાને DNA મેથિલેશન જનીન અભિવ્યક્તિ અને સેલ્યુલર પ્રવૃત્તિ પર મૂળભૂત પ્રભાવ ધરાવે છે.અસામાન્ય મેથિલેશન પેટર્ન કેન્સર જેવી અનેક પરિસ્થિતિઓ અને રોગો સાથે સંકળાયેલી છે.WGBS એ સિંગલ બેઝ રિઝોલ્યુશન પર જીનોમ-વાઇડ મેથિલેશનનો અભ્યાસ કરવા માટેનું સુવર્ણ ધોરણ બની ગયું છે.
પ્લેટફોર્મ: Illumina NovaSeq6000
-
ઉચ્ચ થ્રુપુટ સિક્વન્સિંગ (ATAC-seq) સાથે ટ્રાન્સપોસેઝ-એક્સેસિબલ ક્રોમેટિન માટે પરીક્ષા
ATAC-seq એ જીનોમ-વ્યાપી ક્રોમેટિન સુલભતાના વિશ્લેષણ માટે ઉચ્ચ-થ્રુપુટ સિક્વન્સિંગ પદ્ધતિ છે, જે જનીન અભિવ્યક્તિના વૈશ્વિક એપિજેનેટિક નિયંત્રણ માટે મહત્વપૂર્ણ છે.સિક્વન્સિંગ એડેપ્ટરો હાયપરએક્ટિવ Tn5 ટ્રાન્સપોસેઝ દ્વારા ખુલ્લા ક્રોમેટિન પ્રદેશોમાં દાખલ કરવામાં આવે છે.પીસીઆર એમ્પ્લીફિકેશન પછી, સિક્વન્સિંગ લાઇબ્રેરી બનાવવામાં આવે છે.બધા ખુલ્લા ક્રોમેટિન પ્રદેશો ચોક્કસ અવકાશ-સમયની સ્થિતિ હેઠળ મેળવી શકાય છે, માત્ર ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળની બંધનકર્તા સાઇટ્સ અથવા ચોક્કસ હિસ્ટોન સંશોધિત પ્રદેશ સુધી મર્યાદિત નથી.
-
રિડ્યુસ્ડ રિપ્રેઝન્ટેશન બિસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગ (RRBS)
ડીએનએ મેથિલેશન સંશોધન હંમેશા રોગ સંશોધનમાં એક ગરમ વિષય રહ્યો છે, અને તે જનીન અભિવ્યક્તિ અને ફેનો-ટાઇપિક લક્ષણો સાથે નજીકથી સંબંધિત છે.RRBS એ DNA મેથિલેશન સંશોધન માટે સચોટ, કાર્યક્ષમ અને આર્થિક પદ્ધતિ છે.એન્ઝાઈમેટિક ક્લીવેજ (Msp I) દ્વારા પ્રમોટર અને CpG ટાપુના પ્રદેશોનું સંવર્ધન, Bisulfite ક્રમ સાથે મળીને, ઉચ્ચ રિઝોલ્યુશન DNA મેથિલેશન શોધ પ્રદાન કરે છે.
પ્લેટફોર્મ: Illumina NovaSeq 6000
