-
પ્લાન્ટ/એનિમલ ડી નોવો જીનોમ સિક્વન્સિંગ
ડી નોવોસિક્વન્સિંગ એ સંદર્ભ જિનોમની ગેરહાજરીમાં, સિક્વન્સિંગ ટેક્નોલોજી, દા.ત. PacBio, નેનોપોર, NGS, વગેરેનો ઉપયોગ કરીને જાતિના સંપૂર્ણ જિનોમના નિર્માણનો સંદર્ભ આપે છે.ત્રીજી પેઢીની સિક્વન્સિંગ ટેક્નોલોજીની વાંચન લંબાઈમાં નોંધપાત્ર સુધારાએ જટિલ જીનોમને એસેમ્બલ કરવાની નવી તકો લાવી છે, જેમ કે ઉચ્ચ હેટરોઝાયગોસિટી, પુનરાવર્તિત પ્રદેશોનો ઉચ્ચ ગુણોત્તર, પોલીપ્લોઈડ વગેરે. દસ કિલોબેઝ સ્તરે વાંચન લંબાઈ સાથે, આ ક્રમ વાંચન સક્ષમ બનાવે છે. પુનરાવર્તિત તત્વોનું નિરાકરણ, અસામાન્ય GC સમાવિષ્ટો ધરાવતા પ્રદેશો અને અન્ય અત્યંત જટિલ પ્રદેશો.
પ્લેટફોર્મ: PacBio સિક્વલ II / નેનોપોર પ્રોમેથિઅન P48/ Illumina NovaSeq6000
-
Hi-C આધારિત જીનોમ એસેમ્બલી
હાઇ-સી એ પ્રોબિંગ પ્રોક્સિમિટી-આધારિત ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ અને ઉચ્ચ-થ્રુપુટ સિક્વન્સિંગને જોડીને રંગસૂત્ર રૂપરેખાંકન મેળવવા માટે રચાયેલ પદ્ધતિ છે.આ ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓની તીવ્રતા રંગસૂત્રો પરના ભૌતિક અંતર સાથે નકારાત્મક રીતે સંકળાયેલ હોવાનું માનવામાં આવે છે.તેથી, હાઈ-સી ડેટા ડ્રાફ્ટ જીનોમમાં એસેમ્બલ સિક્વન્સના ક્લસ્ટરિંગ, ઓર્ડર અને ઓરિએન્ટિંગ અને ચોક્કસ સંખ્યાના રંગસૂત્રો પર લંગર કરવા માટે માર્ગદર્શન આપી શકે છે.આ ટેક્નોલોજી વસ્તી-આધારિત આનુવંશિક નકશાની ગેરહાજરીમાં રંગસૂત્ર-સ્તરની જીનોમ એસેમ્બલીને સશક્ત બનાવે છે.દરેક જીનોમને હાઈ-સીની જરૂર હોય છે.
પ્લેટફોર્મ: ઇલુમિના નોવાસેક6000 / DNBSEQ
-
ઉત્ક્રાંતિ જિનેટિક્સ
ઇવોલ્યુશનરી જીનેટિક્સ એ એક પેક્ડ સિક્વન્સિંગ સેવા છે જે SNPs, InDels, SVs અને CNVs સહિત આનુવંશિક વિવિધતાઓના આધારે આપેલ સામગ્રીની ઉત્ક્રાંતિ માહિતી પર વ્યાપક અર્થઘટન પ્રદાન કરવા માટે રચાયેલ છે.તે ઉત્ક્રાંતિના ફેરફારો અને વસ્તીના આનુવંશિક લક્ષણો, જેમ કે વસ્તી માળખું, આનુવંશિક વિવિધતા, ફાયલોજેની સંબંધો, વગેરેનું વર્ણન કરવા માટે જરૂરી તમામ મૂળભૂત વિશ્લેષણ પ્રદાન કરે છે. તેમાં જનીન પ્રવાહ પર અભ્યાસ પણ છે, જે અસરકારક વસ્તી કદ, વિચલન સમયના અંદાજને સશક્ત બનાવે છે.
-
તુલનાત્મક જીનોમિક્સ
તુલનાત્મક જીનોમિક્સનો શાબ્દિક અર્થ થાય છે વિવિધ જાતિઓના સંપૂર્ણ જીનોમ સિક્વન્સ અને બંધારણોની તુલના કરવી.આ શિસ્તનો હેતુ વિવિધ જાતિઓમાં સંરક્ષણ અથવા ભિન્નતા ધરાવતા ક્રમ માળખા અને તત્વોને ઓળખીને જાતિના ઉત્ક્રાંતિ, જનીન કાર્ય, જીનોમ સ્તરે જનીન નિયમનકારી પદ્ધતિને જાહેર કરવાનો છે.લાક્ષણિક તુલનાત્મક જીનોમિક્સ અભ્યાસમાં જનીન કુટુંબ, ઉત્ક્રાંતિ વિકાસ, સંપૂર્ણ જીનોમ ડુપ્લિકેશન, પસંદગીયુક્ત દબાણ વગેરેના વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે.
-
જથ્થાબંધ અલગ-અલગ વિશ્લેષણ
બલ્ક્ડ સેગ્રિગન્ટ એનાલિસિસ (BSA) એ ફેનોટાઇપ સાથે સંકળાયેલ આનુવંશિક માર્કર્સને ઝડપથી ઓળખવા માટે કાર્યરત તકનીક છે.BSA ના મુખ્ય કાર્યપ્રવાહમાં અત્યંત વિરોધી ફિનોટાઇપ્સ ધરાવતી વ્યક્તિઓના બે જૂથોને પસંદ કરવા, તમામ વ્યક્તિઓના DNAને બે મોટા ભાગના DNA બનાવવા માટે, બે પૂલ વચ્ચેના વિભેદક અનુક્રમોને ઓળખવાનો સમાવેશ થાય છે.છોડ/પ્રાણી જીનોમમાં લક્ષિત જનીનો દ્વારા મજબૂત રીતે સંકળાયેલા આનુવંશિક માર્કર્સને ઓળખવા માટે આ ટેકનિકનો વ્યાપકપણે ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો છે.
