હાઇ-સી આધારિત ક્રોમેટિન ક્રિયાપ્રતિક્રિયા
સેવા સુવિધાઓ
● PE150 સાથે ઇલુમિના નોવાસેક પર સિક્વન્સિંગ.
● સેવા માટે ફોર્માલ્ડીહાઇડ સાથે ક્રોસ-લિંક કરવા અને ડીએનએ-પ્રોટીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓનું સંરક્ષણ કરવા માટે, કાઢવામાં આવેલા ન્યુક્લિક એસિડને બદલે, પેશીઓના નમૂનાઓની જરૂર પડે છે.
● હાઇ-સી પ્રયોગમાં બાયોટિન વડે સ્ટીકી છેડાઓનું પ્રતિબંધ અને સમારકામ શામેલ છે, ત્યારબાદ પરિણામી બ્લન્ટ છેડાઓનું પરિપત્રકરણ કરીને ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓને સાચવવામાં આવે છે. ત્યારબાદ સ્ટ્રેપ્ટાવિડિન મણકા વડે ડીએનએને નીચે ખેંચવામાં આવે છે અને અનુગામી લાઇબ્રેરી તૈયારી માટે શુદ્ધ કરવામાં આવે છે.
સેવાના ફાયદા
●શ્રેષ્ઠ પ્રતિબંધ એન્ઝાઇમ ડિઝાઇન: 93% સુધી માન્ય ક્રિયાપ્રતિક્રિયા જોડીઓ સાથે વિવિધ પ્રજાતિઓ પર ઉચ્ચ Hi-C કાર્યક્ષમતા સુનિશ્ચિત કરવા.
●વ્યાપક કુશળતા અને પ્રકાશન રેકોર્ડ્સ:BMKGene પાસે 800 વિવિધ પ્રજાતિઓ અને વિવિધ પેટન્ટના 2000 થી વધુ હાઇ-સી સિક્વન્સિંગ પ્રોજેક્ટ્સનો બહોળો અનુભવ છે. 900 થી વધુના સંચિત અસર પરિબળ સાથે 100 થી વધુ પ્રકાશિત કેસ.
●ઉચ્ચ કુશળ બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ ટીમ:હાઇ-સી પ્રયોગો અને ડેટા વિશ્લેષણ માટે ઇન-હાઉસ પેટન્ટ અને સોફ્ટવેર કોપીરાઇટ અને સ્વ-વિકસિત વિઝ્યુલાઇઝેશન ડેટા સોફ્ટવેર સાથે.
●વેચાણ પછીનો સપોર્ટ:અમારી પ્રતિબદ્ધતા પ્રોજેક્ટ પૂર્ણ થવા ઉપરાંત 3 મહિનાના વેચાણ પછીના સેવા સમયગાળા સાથે વિસ્તૃત છે. આ સમય દરમિયાન, અમે પરિણામો સંબંધિત કોઈપણ પ્રશ્નોના જવાબ આપવા માટે પ્રોજેક્ટ ફોલો-અપ, મુશ્કેલીનિવારણ સહાય અને પ્રશ્ન અને જવાબ સત્રો પ્રદાન કરીએ છીએ.
●વ્યાપક ટીકા: અમે ઓળખાયેલ ભિન્નતાઓ સાથે જનીનોને કાર્યાત્મક રીતે ટીકા કરવા અને અનુરૂપ સંવર્ધન વિશ્લેષણ કરવા માટે બહુવિધ ડેટાબેઝનો ઉપયોગ કરીએ છીએ, જે બહુવિધ સંશોધન પ્રોજેક્ટ્સ પર આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે.
સેવા સ્પષ્ટીકરણો
| પુસ્તકાલય | સિક્વન્સિંગ સ્ટ્રેટેજી | ભલામણ કરેલ ડેટા આઉટપુટ | હાઇ-સી સિગ્નલ રિઝોલ્યુશન |
| હાઇ-સી લાઇબ્રેરી | ઇલુમિના PE150 | ક્રોમેટિન લૂપ: 150x TAD: ૫૦x | ક્રોમેટિન લૂપ: 10Kb કુલ રકમ: ૪૦ કેબી |
સેવાની આવશ્યકતાઓ
| નમૂનાનો પ્રકાર | જરૂરી રકમ |
| પ્રાણી પેશી | ≥2 ગ્રામ |
| આખું લોહી | ≥2 મિલી |
| ફૂગ | ≥1 ગ્રામ |
| છોડ- યુવાન પેશી | ૧ ગ્રામ/અલીક્વોટ, ૨-૪અલીક્વોટ ભલામણ કરેલ |
| સંસ્કારી કોષો | ≥1x107 |
નીચેના વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે:
● કાચો ડેટા QC;
● મેપિંગ અને હાઇ-સી લાઇબ્રેરી QC: માન્ય ઇન્ટરેક્શન જોડીઓ અને ઇન્ટરેક્શન ડેકે એક્સપોનન્ટ્સ (IDEs);
● જીનોમ-વ્યાપી ક્રિયાપ્રતિક્રિયા પ્રોફાઇલિંગ: cis/trans વિશ્લેષણ અને Hi-C ક્રિયાપ્રતિક્રિયા નકશો;
● A/B કમ્પાર્ટમેન્ટ વિતરણનું વિશ્લેષણ;
● TAD અને ક્રોમેટિન લૂપ્સની ઓળખ;
● નમૂનાઓમાં 3D ક્રોમેટિન માળખાના તત્વો અને સંકળાયેલ જનીનોના અનુરૂપ કાર્યાત્મક એનોટેશન પર વિભેદક વિશ્લેષણ.
સીઆઈએસ અને ટ્રાન્સ પ્રમાણ વિતરણ
નમૂનાઓ વચ્ચે રંગસૂત્રીય ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓનો હીટમેપ
A/B કમ્પાર્ટમેન્ટનું જીનોમ-વ્યાપી વિતરણ
ક્રોમેટિન લૂપ્સનું જીનોમ-વ્યાપી વિતરણ
TADs નું વિઝ્યુલાઇઝેશન
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા BMKGene ની Hi-C સિક્વન્સિંગ સેવાઓ દ્વારા કરવામાં આવેલી સંશોધન પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો.
મેંગ, ટી. એટ અલ. (2021) 'તુલનાત્મક સંકલિત મલ્ટી-ઓમિક્સ વિશ્લેષણ CA2 ને કોર્ડોમા માટે એક નવલકથા લક્ષ્ય તરીકે ઓળખે છે',ન્યુરો-ઓન્કોલોજી, 23(10), પાના. 1709–1722. doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156.
ઝુ, એલ. એટ અલ. (2021) 'જીનોમનું 3D ડિસઓર્ગેનાઇઝેશન અને પુનર્ગઠન સંકલિત હાઇ-સી, નેનોપોર અને આરએનએ સિક્વન્સિંગ દ્વારા NAFLD ના પેથોજેનેસિસમાં આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે',એક્ટા ફાર્માસ્યુટિકા સિનિકા બી, 11(10), પૃષ્ઠ 3150–3164. doi: 10.1016/J.APSB.2021.03.022.
