page_head_bg

ઉત્પાદનો

મેટાજેનોમિક સિક્વન્સિંગ (NGS)

મેટાજેનોમ એ સજીવોના મિશ્ર સમુદાયની કુલ આનુવંશિક સામગ્રીના સંગ્રહનો ઉલ્લેખ કરે છે, જેમ કે પર્યાવરણીય મેટાજેનોમ, માનવ મેટાજેનોમ, વગેરે. તેમાં ખેતી કરી શકાય તેવા અને બિનખેતી ન કરી શકાય તેવા બંને સૂક્ષ્મજીવોના જીનોમનો સમાવેશ થાય છે.મેટાજેનોમિક સિક્વન્સિંગ એ એક પરમાણુ સાધન છે જેનો ઉપયોગ પર્યાવરણીય નમૂનાઓમાંથી કાઢવામાં આવેલી મિશ્ર જીનોમિક સામગ્રીનું વિશ્લેષણ કરવા માટે થાય છે, જે પ્રજાતિઓની વિવિધતા અને વિપુલતા, વસ્તી માળખું, ફાયલોજેનેટિક સંબંધ, કાર્યાત્મક જનીનો અને પર્યાવરણીય પરિબળો સાથેના સહસંબંધ નેટવર્કમાં વિગતવાર માહિતી પ્રદાન કરે છે.

પ્લેટફોર્મ:Illumina NovaSeq6000


સેવાની વિગતો

ડેમો પરિણામો

કેસ સ્ટડી

સેવા લાભો

Øમાઇક્રોબાયલ કોમ્યુનિટી પ્રોફાઇલિંગ માટે અલગતા અને ખેતી-મુક્ત

Øપર્યાવરણીય નમૂનાઓમાં ઓછી વિપુલતાવાળી પ્રજાતિઓ શોધવામાં ઉચ્ચ રીઝોલ્યુશન

Ø"મેટા-" નો વિચાર કાર્યાત્મક સ્તર, પ્રજાતિ સ્તર અને જનીન સ્તર પર તમામ જૈવિક લક્ષણોને એકીકૃત કરે છે, જે વાસ્તવિકતાની નજીકના ગતિશીલ દૃશ્યને પ્રતિબિંબિત કરે છે.

ØBMK 10,000 થી વધુ નમૂનાઓની પ્રક્રિયા સાથે વિવિધ નમૂનાના પ્રકારોમાં વિશાળ અનુભવ એકઠા કરે છે.

સેવા વિશિષ્ટતાઓ

સિક્વન્સિંગપ્લેટફોર્મ

પુસ્તકાલય

ભલામણ કરેલ ડેટા ઉપજ

અંદાજિત ટર્ન-અરાઉન્ડ સમય

ઈલુમિના નોવાસેક 6000

PE250

50K/100K/300K ટૅગ્સ

30 દિવસ

બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ વિશ્લેષણ

üકાચો ડેટા ગુણવત્તા નિયંત્રણ

üમેટાજેનોમ એસેમ્બલી

üબિન-રિડન્ડન્ટ જીન સેટ અને એનોટેશન

üજાતિ વિવિધતા વિશ્લેષણ

üઆનુવંશિક કાર્ય વિવિધતા વિશ્લેષણ

üઆંતર-જૂથ વિશ્લેષણ

üપ્રાયોગિક પરિબળો સામે એસોસિએશન વિશ્લેષણ

2

નમૂના જરૂરિયાતો અને ડિલિવરી

નમૂના જરૂરીયાતો:

માટેડીએનએ અર્ક:

નમૂનાનો પ્રકાર

રકમ

એકાગ્રતા

શુદ્ધતા

ડીએનએ અર્ક

> 30 એનજી

1 ng/μl

OD260/280= 1.6-2.5

પર્યાવરણીય નમૂનાઓ માટે:

નમૂના પ્રકાર

ભલામણ કરેલ નમૂના પ્રક્રિયા

માટી

નમૂનાની રકમ: આશરે.5 ગ્રામ;બાકીના સુકાઈ ગયેલા પદાર્થને સપાટી પરથી દૂર કરવાની જરૂર છે;મોટા ટુકડાને ગ્રાઇન્ડ કરો અને 2 એમએમ ફિલ્ટરમાંથી પસાર થાઓ;આરક્ષણ માટે જંતુરહિત ઇપી-ટ્યુબ અથવા સાયરોટ્યુબમાં એલિક્વોટ નમૂનાઓ.

મળ

નમૂનાની રકમ: આશરે.5 ગ્રામ;આરક્ષણ માટે જંતુરહિત ઇપી-ટ્યુબ અથવા ક્રાયોટ્યુબમાં અલિક્વોટ નમૂનાઓ એકત્રિત કરો.

આંતરડાની સામગ્રી

એસેપ્ટિક સ્થિતિ હેઠળ નમૂનાઓ પર પ્રક્રિયા કરવાની જરૂર છે.પીબીએસ સાથે એકત્રિત પેશી ધોવા;પીબીએસને સેન્ટ્રીફ્યુજ કરો અને ઇપી-ટ્યુબમાં પ્રીસીપીટન્ટ એકત્રિત કરો.

કાદવ

નમૂનાની રકમ: આશરે.5 ગ્રામ;આરક્ષણ માટે જંતુરહિત ઇપી-ટ્યુબ અથવા ક્રાયોટ્યુબમાં અલિક્વોટ કાદવના નમૂના એકત્રિત કરો

વોટરબોડી

માઇક્રોબાયલની મર્યાદિત માત્રા સાથેના નમૂના માટે, જેમ કે નળનું પાણી, કૂવાનું પાણી, વગેરે, ઓછામાં ઓછું 1 L પાણી એકત્રિત કરો અને પટલ પર માઇક્રોબાયલને સમૃદ્ધ બનાવવા માટે 0.22 μm ફિલ્ટરમાંથી પસાર કરો.પટલને જંતુરહિત ટ્યુબમાં સંગ્રહિત કરો.

ત્વચા

જંતુરહિત કપાસના સ્વેબ અથવા સર્જિકલ બ્લેડથી ત્વચાની સપાટીને કાળજીપૂર્વક ઉઝરડો અને તેને જંતુરહિત ટ્યુબમાં મૂકો.

ભલામણ કરેલ નમૂના ડિલિવરી

નમૂનાઓને 3-4 કલાક માટે પ્રવાહી નાઇટ્રોજનમાં સ્થિર કરો અને પ્રવાહી નાઇટ્રોજનમાં અથવા -80 ડિગ્રી સુધી લાંબા ગાળાના રિઝર્વેશનમાં સ્ટોર કરો.ડ્રાય આઈસ સાથે સેમ્પલ શિપિંગ જરૂરી છે.

સેવા કાર્ય પ્રવાહ

logo_02

નમૂના વિતરણ

logo_04

પુસ્તકાલય બાંધકામ

logo_05

સિક્વન્સિંગ

logo_06

માહિતી વિશ્લેષણ

logo_07

વેચાણ પછીની સેવાઓ


  • અગાઉના:
  • આગળ:

  • 1.હિસ્ટોગ્રામ: પ્રજાતિઓનું વિતરણ

    3

    2. KEGG મેટાબોલિક પાથવેઝ પર ટીકા કરાયેલ કાર્યાત્મક જનીનો

    4

    3. ગરમીનો નકશો: સંબંધિત જનીન વિપુલતા પર આધારિત વિભેદક કાર્યો54.કાર્ડ એન્ટિબાયોટિક રેઝિસ્ટન્સ જનીનોનું સર્કોસ

    6

    BMK કેસ

    માટી-મેન્ગ્રોવ રુટ સાતત્ય સાથે એન્ટિબાયોટિક પ્રતિકારક જનીનો અને બેક્ટેરિયલ પેથોજેન્સનો વ્યાપ

    પ્રકાશિત:જોખમી સામગ્રીનું જર્નલ, 2021

    અનુક્રમ વ્યૂહરચના:

    સામગ્રી:મેન્ગ્રોવ મૂળ સાથે સંકળાયેલા નમૂનાઓના ચાર ટુકડાઓના ડીએનએ અર્ક: બિન-રોપાયેલી માટી, રાઇઝોસ્ફિયર, એપિસ્ફિયર અને એન્ડોસ્ફિયર કમ્પાર્ટમેન્ટ્સ
    પ્લેટફોર્મ: Illumina HiSeq 2500
    લક્ષ્યો: મેટાજેનોમ
    16S rRNA જનીન V3-V4 પ્રદેશ

    મુખ્ય પરિણામો

    માટીમાંથી છોડમાં એન્ટિબાયોટિક પ્રતિકારક જનીનો (ARGs) ના પ્રસારનો અભ્યાસ કરવા માટે મેન્ગ્રોવના રોપાઓના માટી-મૂળ સાતત્ય પર મેટાજેનોમિક સિક્વન્સિંગ અને મેટાબારકોડિંગ પ્રોફાઇલિંગની પ્રક્રિયા કરવામાં આવી હતી.મેટાજેનોમિક ડેટા દર્શાવે છે કે 91.4% એન્ટિબાયોટિક પ્રતિકારક જનીનો સામાન્ય રીતે ઉપર જણાવેલ ચારેય માટીના ભાગોમાં ઓળખવામાં આવ્યા હતા, જે સતત ફેશન દર્શાવે છે.16S rRNA એમ્પ્લિકન સિક્વન્સિંગે 29,285 સિક્વન્સ જનરેટ કર્યા, જે 346 પ્રજાતિઓનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે.એમ્પ્લિકોન સિક્વન્સિંગ દ્વારા પ્રજાતિઓની રૂપરેખા સાથે સંયોજનમાં, આ પ્રસાર રુટ-સંબંધિત માઇક્રોબાયોટાથી સ્વતંત્ર હોવાનું જણાયું હતું, જો કે, તેને આનુવંશિક તત્વોના મોબાઇલ દ્વારા સુવિધા આપી શકાય છે.આ અભ્યાસે એકબીજા સાથે જોડાયેલા માટી-મૂળ સાતત્ય દ્વારા જમીનમાંથી છોડમાં એઆરજી અને પેથોજેન્સનો પ્રવાહ ઓળખ્યો.

    સંદર્ભ

    વાંગ, સી. , હુ, આર. , સ્ટ્રોંગ, પીજે , ઝુઆંગ, ડબલ્યુ. , અને શુ, એલ. .(2020).માટી-મેન્ગ્રોવ રુટ સાતત્ય સાથે એન્ટિબાયોટિક પ્રતિકારક જનીનો અને બેક્ટેરિયલ પેથોજેન્સનો વ્યાપ.જોખમી સામગ્રીની જર્નલ, 408, 124985.

    એક ભાવ મેળવવા

    તમારો સંદેશ અહીં લખો અને અમને મોકલો

    તમારો સંદેશ અમને મોકલો: