ઉત્પાદનો

1.હિસ્ટોગ્રામ: પ્રજાતિઓનું વિતરણ

2. KEGG મેટાબોલિક પાથવેઝ પર ટીકા કરાયેલ કાર્યાત્મક જનીનો

3. ગરમીનો નકશો: સંબંધિત જનીન વિપુલતા પર આધારિત વિભેદક કાર્યો4.કાર્ડ એન્ટિબાયોટિક રેઝિસ્ટન્સ જનીનોનું સર્કોસ

BMK કેસ

માટી-મેન્ગ્રોવ રુટ સાતત્ય સાથે એન્ટિબાયોટિક પ્રતિકારક જનીનો અને બેક્ટેરિયલ પેથોજેન્સનો વ્યાપ

પ્રકાશિત:જોખમી સામગ્રીનું જર્નલ, 2021

અનુક્રમ વ્યૂહરચના:

સામગ્રી:મેન્ગ્રોવ મૂળ સાથે સંકળાયેલા નમૂનાઓના ચાર ટુકડાઓના ડીએનએ અર્ક: બિન-રોપાયેલી માટી, રાઇઝોસ્ફિયર, એપિસ્ફિયર અને એન્ડોસ્ફિયર કમ્પાર્ટમેન્ટ્સ
પ્લેટફોર્મ: Illumina HiSeq 2500
લક્ષ્યો: મેટાજેનોમ
16S rRNA જનીન V3-V4 પ્રદેશ

મુખ્ય પરિણામો

માટીમાંથી છોડમાં એન્ટિબાયોટિક પ્રતિકારક જનીનો (ARGs) ના પ્રસારનો અભ્યાસ કરવા માટે મેન્ગ્રોવના રોપાઓના માટી-મૂળ સાતત્ય પર મેટાજેનોમિક સિક્વન્સિંગ અને મેટાબારકોડિંગ પ્રોફાઇલિંગની પ્રક્રિયા કરવામાં આવી હતી.મેટાજેનોમિક ડેટા દર્શાવે છે કે 91.4% એન્ટિબાયોટિક પ્રતિકારક જનીનો સામાન્ય રીતે ઉપર જણાવેલ ચારેય માટીના ભાગોમાં ઓળખવામાં આવ્યા હતા, જે સતત ફેશન દર્શાવે છે.16S rRNA એમ્પ્લિકન સિક્વન્સિંગે 29,285 સિક્વન્સ જનરેટ કર્યા, જે 346 પ્રજાતિઓનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે.એમ્પ્લિકોન સિક્વન્સિંગ દ્વારા પ્રજાતિઓની રૂપરેખા સાથે સંયોજનમાં, આ પ્રસાર રુટ-સંબંધિત માઇક્રોબાયોટાથી સ્વતંત્ર હોવાનું જણાયું હતું, જો કે, તેને આનુવંશિક તત્વોના મોબાઇલ દ્વારા સુવિધા આપી શકાય છે.આ અભ્યાસે એકબીજા સાથે જોડાયેલા માટી-મૂળ સાતત્ય દ્વારા જમીનમાંથી છોડમાં એઆરજી અને પેથોજેન્સનો પ્રવાહ ઓળખ્યો.

સંદર્ભ

વાંગ, સી. , હુ, આર. , સ્ટ્રોંગ, પીજે , ઝુઆંગ, ડબલ્યુ. , અને શુ, એલ. .(2020).માટી-મેન્ગ્રોવ રુટ સાતત્ય સાથે એન્ટિબાયોટિક પ્રતિકારક જનીનો અને બેક્ટેરિયલ પેથોજેન્સનો વ્યાપ.જોખમી સામગ્રીની જર્નલ, 408, 124985.