મેટાજેનોમિક સિક્વન્સિંગ -એન.જી.
મેટાજેનોમ એ પર્યાવરણીય અને માનવ મેટાજેનોમ્સ જેવા સજીવના મિશ્ર સમુદાયની કુલ આનુવંશિક સામગ્રીનો સંગ્રહ છે. તેમાં વાવેતર અને બિનસલાહભર્યા સુક્ષ્મસજીવો બંનેના જિનોમ છે. એનજીએસ સાથે શોટગન મેટાજેનોમિક સિક્વન્સીંગ, વર્ગીકરણ પ્રોફાઇલિંગ કરતાં વધુ પ્રદાન કરીને પર્યાવરણીય નમૂનાઓમાં જડિત આ જટિલ જિનોમિક લેન્ડસ્કેપ્સના અભ્યાસને સક્ષમ કરે છે, પ્રજાતિઓની વિવિધતા, વિપુલતા ગતિશીલતા અને જટિલ વસ્તી રચનાઓમાં દાણાદાર આંતરદૃષ્ટિ આપે છે. વર્ગીકરણ અધ્યયન ઉપરાંત, શોટગન મેટાજેનોમિક્સ પણ કાર્યાત્મક જીનોમિક્સ પરિપ્રેક્ષ્ય પ્રદાન કરે છે, જે ઇકોલોજીકલ પ્રક્રિયાઓમાં એન્કોડ કરેલા જનીનોની શોધ અને તેમની મૂર્તિમંત ભૂમિકાઓને સક્ષમ કરે છે. છેવટે, આનુવંશિક તત્વો અને પર્યાવરણીય પરિબળો વચ્ચેના સહસંબંધ નેટવર્કની સ્થાપના માઇક્રોબાયલ સમુદાયો અને તેમની ઇકોલોજીકલ પૃષ્ઠભૂમિ વચ્ચેના જટિલ ઇન્ટરપ્લેની સાકલ્યવાદી સમજમાં ફાળો આપે છે. નિષ્કર્ષમાં, મેટાજેનોમિક સિક્વન્સીંગ વિવિધ માઇક્રોબાયલ સમુદાયોના જિનોમિક જટિલતાને ઉકેલી કા to વા માટે, આ જટિલ ઇકોસિસ્ટમ્સમાં આનુવંશિકતા અને ઇકોલોજી વચ્ચેના મલ્ટિફેસ્ટેડ સંબંધોને પ્રકાશિત કરવા માટે એક મુખ્ય સાધન તરીકે છે.
પ્લેટફોર્મ્સ: ઇલુમિના નોવાઝેક અને ડીએનબીએસક્યુ-ટી 7
સેવા લાભ
.માઇક્રોબાયલ સમુદાયની પ્રોફાઇલિંગ માટે અલગતા અને ખેતી મુક્ત પદ્ધતિ: બિનસલાહભર્યા સજીવોથી આનુવંશિક સામગ્રીનું અનુક્રમ સક્ષમ કરવું.
.ઉચ્ચ ઠરાવ: પર્યાવરણીય નમૂનાઓમાં ઓછી વિપુલતા પ્રજાતિઓ શોધી કા .ો.
.વ્યાપક બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ વિશ્લેષણ:ફક્ત વર્ગીકરણ વિવિધતા પર જ નહીં પરંતુ સમુદાયની કાર્યાત્મક વિવિધતા પર પણ ધ્યાન કેન્દ્રિત કર્યું.
.વ્યાપક અનુભવ:વિવિધ સંશોધન ડોમેન્સમાં બહુવિધ મેટાજેનોમિક્સ પ્રોજેક્ટ્સને સફળતાપૂર્વક બંધ કરવા અને 200,000 નમૂનાઓ પર પ્રક્રિયા કરવાના ટ્રેક રેકોર્ડ સાથે, અમારી ટીમ દરેક પ્રોજેક્ટમાં અનુભવની સંપત્તિ લાવે છે.
સેવા વિશિષ્ટતાઓ
| અનુક્રમ પ્લેટફોર્મ | અનુક્રમ વ્યૂહરચના | માહિતી સૂચવવી | ગુણવત્તા નિયંત્રણ |
| ઇલુમિના નોવાઝેક અથવા ડીએનબીએસક્યુ-ટી 7 | પીઇ 150 | 6-20 જીબી | Q30≥85% |
સેવા આવશ્યકતા
| એકાગ્રતા (એનજી/µL) | કુલ રકમ (એનજી) | વોલ્યુમ (µL) |
| ≥1 | ≥30 | ≥20 |
● માટી/કાદવ: 2-3 જી
● આંતરડાની સામગ્રી-એનિમલ: 0.5-2 જી
● આંતરડાની સામગ્રી-જંતુઓ: 0.1-0.25 જી
● છોડની સપાટી (સમૃદ્ધ કાંપ): 0.5-1 જી
● આથો બ્રોથ સમૃદ્ધ કાંપ): 0.2-0.5 જી
● મળ (મોટા પ્રાણીઓ): 0.5-2 જી
● FAEES (માઉસ): 3-5
Mon પલ્મોનરી એલ્વિઓલર લ v વ ફ્લુઇડ: ફિલ્ટર પેપર
● યોનિમાર્ગ સ્વેબ: 5-6 સ્વેબ્સ
● ત્વચા/જનન સ્વાબ/લાળ/મૌખિક નરમ પેશી/ફેરીંજિયલ સ્વેબ/રેક્ટલ સ્વેબ: 2-3 સ્વેબ્સ
● સપાટી સુક્ષ્મસજીવો: 5-6 સ્વેબ્સ
● વોટરબોડી/એર/બાયોફિલ્મ: ફિલ્ટર પેપર
● એન્ડોફાઇટ્સ: 2-3 જી
● ડેન્ટલ પ્લેક: 0.5-1 જી
સેવા કાર્ય -પ્રવાહ
નમૂનાની સોંપણી
ગ્રંથાલય બાંધકામ
અનુક્રમ
આંકડા -માહિતી
વેચાણ બાદની સેવાઓ
નીચેના વિશ્લેષણ શામેલ છે:
Data ડેટા ક્વોલિટી કંટ્રોલ સિક્વન્સિંગ
● મેટાજેનોમ એસેમ્બલી અને જનીન આગાહી
Ne જનીન ot નોટેશન
● વર્ગીકરણ આલ્ફા વિવિધતા વિશ્લેષણ
Community સમુદાયનું કાર્યાત્મક વિશ્લેષણ: જૈવિક કાર્ય, મેટાબોલિક, એન્ટિબાયોટિક પ્રતિકાર
કાર્યાત્મક અને વર્ગીકરણ વિવિધતા બંને પર વિશ્લેષણ:
બીટા વિવિધતા વિશ્લેષણ
આંતર જૂથ
સહસંબંધ વિશ્લેષણ: પર્યાવરણીય પરિબળો અને બહારની રચના અને વિવિધતા વચ્ચે
કાર્યાત્મક વિશ્લેષણ: કાર્ડ એન્ટિબાયોટિક પ્રતિકાર
કેઇજીજી મેટાબોલિક માર્ગોનું વિભેદક વિશ્લેષણ: નોંધપાત્ર માર્ગોનો હીટમેપ
વર્ગીકરણ વિતરણની આલ્ફા વિવિધતા: ACE અનુક્રમણિકા
વર્ગીકરણ વિતરણની બીટા વિવિધતા: પી.સી.ઓ.એ.
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા ઇલુમિના સાથે BMKGENE ની મેટાજેનોમ સિક્વન્સીંગ સેવાઓ દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલી પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો.
હાય, ક્યૂ. એટ અલ. .માઇક્રોબાયોલોજીમાં સરહદ, 14, પી. 1275649. Doi: 10.3389/fmicb.2023.1275649.
માઓ, સી. એટ અલ. (2023) 'માઇક્રોબાયલ સમુદાયો, પ્રતિકાર જનીનો અને વિવિધ ટ્રોફિક સ્ટેટ્સના શહેરી તળાવોમાં પ્રતિકારક જોખમો: આંતરિક લિંક્સ અને બાહ્ય પ્રભાવો',જોખમી સામગ્રીની પ્રગતિ જર્નલ, 9, પી. 100233. Doi: 10.1016/j.hazadd.2023.100233.
સુ, એમ. એટ અલ. (2022) 'મેટાજેનોમિક વિશ્લેષણમાં ઘેટાં રૂમેનના પ્રવાહી-સંબંધિત અને નક્કર-સંબંધિત સુક્ષ્મસજીવો વચ્ચે રચના અને કાર્યમાં તફાવત બહાર આવ્યા',માઇક્રોબાયોલોજીમાં સરહદ, 13, પી. 851567. Doi: 10.3389/fmicb.2022.851567.
યિન, જે. એટ અલ. .નવીનતા, 4 (5), પી. 100486. Doi: 10.1016/j.xinn.2023.100486.
ઝાઓ, એક્સ. એટ અલ. (2023) 'હૈહ એસ્ટ્યુરી, ચાઇનાના ઉપલા અને નીચલા પહોંચમાં પ્રતિનિધિ બાયો/નોન-ડિગ્રેડેબલ પ્લાસ્ટિક અને નોન-પ્લાસ્ટિક કાટમાળના સંભવિત જોખમોની મેટાજેનોમિક આંતરદૃષ્ટિ'સંપૂર્ણ વાતાવરણનું વિજ્ scienceાન, 887, પી. 164026. Doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.164026.
