mRNA-seq (NGS) – નવીન

mRNA સિક્વન્સિંગ ચોક્કસ પરિસ્થિતિઓમાં કોષોમાં બધા mRNA ટ્રાન્સક્રિપ્ટનું પ્રોફાઇલિંગ કરવાની મંજૂરી આપે છે અને વિવિધ સંશોધન ક્ષેત્રોમાં વ્યાપકપણે ઉપયોગમાં લેવાતી તકનીક છે. BMKCloud De novo mRNA-seq પાઇપલાઇન જ્યારે કોઈ સંદર્ભ જીનોમ ઉપલબ્ધ ન હોય ત્યારે પોલી-A સમૃદ્ધ સિક્વન્સિંગ લાઇબ્રેરીઓનું વિશ્લેષણ કરવા માટે રચાયેલ છે. પાઇપલાઇન ગુણવત્તા નિયંત્રણથી શરૂ થાય છે, ત્યારબાદનવીનતાટ્રાન્સક્રિપ્ટ એસેમ્બલી અને યુનિજીન સેટ પસંદગી. યુનિજીન સ્ટ્રક્ચર વિશ્લેષણ કોડિંગ સિક્વન્સ (CDS) અને સિમ્પલ સિક્વન્સ રિપીટ્સ (SSR) ની આગાહી કરે છે. ત્યારબાદ, ડિફરન્શિયલ એક્સપ્રેશન વિશ્લેષણ પરીક્ષણ કરાયેલ પરિસ્થિતિઓમાં ડિફરન્શિયલલી એક્સપ્રેસ્ડ જનીનો (DEGs) શોધે છે, ત્યારબાદ જૈવિક આંતરદૃષ્ટિ કાઢવા માટે DEGs નું કાર્યાત્મક એનોટેશન અને સંવર્ધન કરવામાં આવે છે.