નોન-રેફરન્સ આધારિત mRNA સિક્વન્સિંગ-NGS
સુવિધાઓ
● લાઇબ્રેરી તૈયારી પહેલાં પોલી mRNA નું કેપ્ચર
● કોઈપણ સંદર્ભ જીનોમથી સ્વતંત્ર: ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સના નવા એસેમ્બલી પર આધારિત, બહુવિધ ડેટાબેઝ (NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG) સાથે એનોટેટેડ યુનિજીન્સની સૂચિ જનરેટ કરે છે.
● જનીન અભિવ્યક્તિ અને ટ્રાન્સક્રિપ્ટ માળખાનું વ્યાપક બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણ
સેવાના ફાયદા
●વ્યાપક કુશળતા: BMKGENE ખાતે 600,000 થી વધુ નમૂનાઓ પર પ્રક્રિયા કરવાનો ટ્રેક રેકોર્ડ ધરાવતો, કોષ સંસ્કૃતિઓ, પેશીઓ અને શરીરના પ્રવાહી જેવા વિવિધ નમૂના પ્રકારોને આવરી લેતો, અમારી ટીમ દરેક પ્રોજેક્ટમાં અનુભવનો ભંડાર લાવે છે. અમે વિવિધ સંશોધન ક્ષેત્રોમાં 100,000 થી વધુ mRNA-Seq પ્રોજેક્ટ્સ સફળતાપૂર્વક પૂર્ણ કર્યા છે.
●સખત ગુણવત્તા નિયંત્રણ: અમે નમૂના અને પુસ્તકાલયની તૈયારીથી લઈને સિક્વન્સિંગ અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ સુધીના તમામ તબક્કામાં મુખ્ય નિયંત્રણ બિંદુઓનો અમલ કરીએ છીએ. આ ઝીણવટભર્યું નિરીક્ષણ સતત ઉચ્ચ-ગુણવત્તાવાળા પરિણામોની ડિલિવરીને સુનિશ્ચિત કરે છે.
● વ્યાપક ટીકા: અમે ડિફરન્શિયલી એક્સપ્રેસ્ડ જનીનો (DEGs) ને કાર્યાત્મક રીતે ટીકા કરવા અને અનુરૂપ સંવર્ધન વિશ્લેષણ કરવા માટે બહુવિધ ડેટાબેઝનો ઉપયોગ કરીએ છીએ, જે ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ પ્રતિભાવ અંતર્ગત સેલ્યુલર અને મોલેક્યુલર પ્રક્રિયાઓ પર આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે.
●વેચાણ પછીનો સપોર્ટ: અમારી પ્રતિબદ્ધતા પ્રોજેક્ટ પૂર્ણ થયા પછી પણ 3 મહિનાની વેચાણ પછીની સેવા સમયગાળા સાથે વિસ્તરે છે. આ સમય દરમિયાન, અમે પરિણામો સંબંધિત કોઈપણ પ્રશ્નોના જવાબ આપવા માટે પ્રોજેક્ટ ફોલો-અપ, મુશ્કેલીનિવારણ સહાય અને પ્રશ્ન અને જવાબ સત્રો પ્રદાન કરીએ છીએ.
નમૂનાની આવશ્યકતાઓ અને ડિલિવરી
| પુસ્તકાલય | ક્રમ વ્યૂહરચના | ભલામણ કરેલ ડેટા | ગુણવત્તા નિયંત્રણ |
| પોલી એ સમૃદ્ધ | ઇલુમિના PE150 DNBSEQ-T7 નો પરિચય | ૬-૧૦ જીબી | Q30≥85% |
નમૂના આવશ્યકતાઓ:
ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ:
| સંક્ષિપ્ત (ng/μl) | રકમ (μg) | શુદ્ધતા | પ્રામાણિકતા |
| ≥ ૧૦ | ≥ ૦.૨ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 જેલ પર મર્યાદિત અથવા કોઈ પ્રોટીન અથવા ડીએનએ દૂષણ દર્શાવવામાં આવ્યું નથી. | છોડ માટે: RIN≥4.0; પ્રાણીઓ માટે: RIN≥4.5; ૫.૦≥૨૮એસ/૧૮એસ≥૧.૦; મર્યાદિત અથવા કોઈ બેઝલાઇન ઊંચાઈ નહીં |
● છોડ:
મૂળ, થડ અથવા પાંખડી: 450 મિલિગ્રામ
પાન અથવા બીજ: ૩૦૦ મિલિગ્રામ
ફળ: ૧.૨ ગ્રામ
● પ્રાણી:
હૃદય અથવા આંતરડા: 300 મિલિગ્રામ
વિસેરા અથવા મગજ: 240 મિલિગ્રામ
સ્નાયુ: 450 મિલિગ્રામ
હાડકાં, વાળ અથવા ત્વચા: ૧ ગ્રામ
● આર્થ્રોપોડ્સ:
જંતુઓ: 6 ગ્રામ
ક્રસ્ટેસીયા: 300 મિલિગ્રામ
● આખું લોહી: ૧ ટ્યુબ
● કોષો: 106 કોષો
ભલામણ કરેલ નમૂના વિતરણ
કન્ટેનર: 2 મિલી સેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ (ટીન ફોઇલની ભલામણ કરવામાં આવતી નથી)
નમૂના લેબલિંગ: જૂથ+પ્રતિકૃતિ દા.ત. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
શિપમેન્ટ:
૧. સૂકો બરફ: નમૂનાઓને બેગમાં પેક કરીને સૂકો બરફમાં દાટી દેવા જોઈએ.
2. RNAstable ટ્યુબ: RNA નમૂનાઓને RNA સ્ટેબિલાઇઝેશન ટ્યુબ (દા.ત. RNAstable®) માં સૂકવી શકાય છે અને ઓરડાના તાપમાને મોકલી શકાય છે.
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
પ્રયોગ ડિઝાઇન
નમૂના વિતરણ
આરએનએ નિષ્કર્ષણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
ક્રમ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ
ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ એસેમ્બલી અને યુનિજીન પસંદગી
યુનિજીન એનોટેશન
જૈવિક પ્રતિકૃતિઓના નમૂના સહસંબંધ અને મૂલ્યાંકન
વિભેદક રીતે વ્યક્ત થયેલા જનીનો (DEGs)
DEGs ની કાર્યાત્મક ટીકા
DEGs નું કાર્યાત્મક સંવર્ધન
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા BMKGene ની યુકેરીયોટિક NGS mRNA સિક્વન્સિંગ સેવાઓ દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલી પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો.
શેન, એફ. એટ અલ. (2020) 'અમુર કેટફિશ (સિલુરસ એસોટસ) ના ગોનાડ્સમાં ડી નોવો ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ એસેમ્બલી અને સેક્સ-બાયાસ્ડ જનીન અભિવ્યક્તિ', જીનોમિક્સ, 112(3), પૃષ્ઠ. 2603–2614. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
ઝાંગ, સી. એટ અલ. (2016) 'ડુંગળીમાં બલ્બ સોજો અને વિકાસ દરમિયાન સુક્રોઝ મેટાબોલિઝમનું ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ વિશ્લેષણ (એલિયમ સેપા એલ.)', ફ્રન્ટીયર્સ ઇન પ્લાન્ટ સાયન્સ, 7(સપ્ટેમ્બર), પૃષ્ઠ 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
ઝુ, સી. એટ અલ. (2017) 'ડે નોવો એસેમ્બલી, સરકોચેઇલિચથિસ સિનેન્સિસના ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ માટે લાક્ષણિકતા અને ટીકા', PLoS ONE, 12(2). doi: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
ઝુ, એલ. એટ અલ. (2021) 'ડી નોવો ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ વિશ્લેષણ ખારાશના તણાવ હેઠળ પોડોકાર્પસ મેક્રોફિલસની મીઠા સહિષ્ણુતામાં આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે', BMC પ્લાન્ટ બાયોલોજી, 21(1), પૃષ્ઠ 1–17. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.
