ઉત્પાદનો

*અહીં બતાવેલ ડેમો પરિણામો બધા બાયોમાર્કર ટેક્નોલોજી સાથે પ્રકાશિત થયેલ જીનોમના છે

1.ના રંગસૂત્ર-સ્તરના જીનોમ એસેમ્બલી પર સર્કોસજી. રોટુન્ડિફોલિયમનેનોપોર સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મ દ્વારા

વાંગ એમ એટ અલ.,મોલેક્યુલર બાયોલોજી અને ઇવોલ્યુશન, 2021 

2.વેઈનિંગ રાઈ જીનોમ એસેમ્બલી અને ટીકાના આંકડા

લી જી એટ અલ.,નેચર જિનેટિક્સ, 2021

3.ની જીન આગાહીસેચિયમ એડ્યુલજીનોમ, ત્રણ આગાહી પદ્ધતિઓમાંથી તારવેલી:ડી નોવોઆગાહી, હોમોલોજી-આધારિત આગાહી અને RNA-Seq ડેટા આધારિત આગાહી

ફુ એ એટ અલ.,બાગાયત સંશોધન, 2021

4. ત્રણ સુતરાઉ જીનોમમાં અખંડ લાંબા ટર્મિનલ પુનરાવર્તનની ઓળખ

વાંગ એમ એટ અલ.,મોલેક્યુલર બાયોલોજી અને ઇવોલ્યુશન, 2021

5.Hi-C ગરમીનો નકશોસી. એક્યુમિનાટાજિનોમ જિનોમ-વ્યાપી તમામ-બાય-બધી ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ દર્શાવે છે.Hi-C ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓની તીવ્રતા કોન્ટિગ્સ વચ્ચેના રેખીય અંતરના પ્રમાણસર છે.આ ઉષ્મા નકશા પર સ્વચ્છ સીધી રેખા રંગસૂત્રો પર કોન્ટિગ્સની અત્યંત સચોટ એન્કરિંગ સૂચવે છે.(કોન્ટિગ એન્કરિંગ રેશિયો: 96.03%)

કાંગ એમ એટ અલ.,પ્રકૃતિ સંચાર,2021

BMK કેસ

ઉચ્ચ-ગુણવત્તાવાળી જીનોમ એસેમ્બલી રાઈ જીનોમિક લાક્ષણિકતાઓ અને કૃષિવિજ્ઞાનની દ્રષ્ટિએ મહત્વપૂર્ણ જનીનોને પ્રકાશિત કરે છે

પ્રકાશિત: નેચર જિનેટિક્સ, 2021

અનુક્રમ વ્યૂહરચના:

જીનોમ એસેમ્બલી: 20 kb લાઇબ્રેરી સાથે PacBio CLR મોડ (497 Gb, આશરે 63×)
ક્રમ સુધારણા: ઇલુમિના પ્લેટફોર્મ પર 270 bp DNA લાઇબ્રેરી (430 Gb, આશરે 54×) સાથે NGS
કોન્ટિગ્સ એન્કરિંગ: ઇલુમિના પ્લેટફોર્મ પર હાઇ-સી લાઇબ્રેરી (560 જીબી, આશરે 71×)
ઓપ્ટિકલ નકશો: (779.55 Gb, આશરે 99×) Bionano Irys પર

મુખ્ય પરિણામો

1.વેઈનિંગ રાઈ જીનોમની એક એસેમ્બલી 7.74 જીબી (ફ્લો સાયટોમેટ્રી દ્વારા અંદાજિત જીનોમ કદના 98.74%) ના કુલ જીનોમ કદ સાથે પ્રકાશિત કરવામાં આવી હતી.આ એસેમ્બલીના સ્કેફોલ્ડ N50 એ 1.04 Gb હાંસલ કર્યું.93.67% કોન્ટિગ્સ 7 સ્યુડો-રંગસૂત્રો પર સફળતાપૂર્વક એન્કર કરવામાં આવ્યા હતા.આ એસેમ્બલીનું લિન્કેજ મેપ, LAI અને BUSCO દ્વારા મૂલ્યાંકન કરવામાં આવ્યું હતું, જેના પરિણામે તમામ મૂલ્યાંકનમાં ઉચ્ચ સ્કોર આવ્યા હતા.

2. તુલનાત્મક જીનોમિક્સ પર વધુ અભ્યાસ, આનુવંશિક જોડાણ નકશો, ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ અભ્યાસ આ જીનોમના આધારે કરવામાં આવ્યા હતા.જિનોમ-વ્યાપી જનીન ડુપ્લિકેશન અને સ્ટાર્ચ જૈવસંશ્લેષણ જનીનો પર તેમની અસર સહિત લક્ષણો સંબંધિત જીનોમિક લક્ષણોની શ્રેણી જાહેર કરવામાં આવી હતી;જટિલ પ્રોલામીન લોકીનું ભૌતિક સંગઠન, જનીન અભિવ્યક્તિ લક્ષણો અંતર્ગત પ્રારંભિક મથાળાની લાક્ષણિકતા અને પોટેટીવ ડોમેસ્ટિકેશન-સંબંધિત રંગસૂત્ર વિસ્તારો અને રાઈમાં સ્થાન.

વેઈનિંગ રાઈ જીનોમના જીનોમિક લક્ષણો પર સર્કોસ ડાયાગ્રામ

રાઈ જીનોમનું ઉત્ક્રાંતિ અને રંગસૂત્ર સિન્ટેની વિશ્લેષણ