-
પેકબાયો-પૂર્ણ-લંબાઈ 16S/18S/ITS એમ્પ્લીકોન સિક્વન્સિંગ
એમ્પ્લીકોન (16S/18S/ITS) પ્લેટફોર્મ માઇક્રોબાયલ ડાયવર્સિટી પ્રોજેક્ટ વિશ્લેષણમાં વર્ષોના અનુભવ સાથે વિકસાવવામાં આવ્યું છે, જેમાં પ્રમાણિત મૂળભૂત વિશ્લેષણ અને વ્યક્તિગત વિશ્લેષણ શામેલ છે: મૂળભૂત વિશ્લેષણ વર્તમાન માઇક્રોબાયલ સંશોધનની મુખ્ય પ્રવાહ વિશ્લેષણ સામગ્રીને આવરી લે છે, વિશ્લેષણ સામગ્રી સમૃદ્ધ અને વ્યાપક છે, અને વિશ્લેષણ પરિણામો પ્રોજેક્ટ રિપોર્ટ્સના સ્વરૂપમાં રજૂ કરવામાં આવે છે; વ્યક્તિગત વિશ્લેષણની સામગ્રી વૈવિધ્યસભર છે. વ્યક્તિગત જરૂરિયાતોને પૂર્ણ કરવા માટે, નમૂનાઓ પસંદ કરી શકાય છે અને મૂળભૂત વિશ્લેષણ અહેવાલ અને સંશોધન હેતુ અનુસાર પરિમાણો લવચીક રીતે સેટ કરી શકાય છે. વિન્ડોઝ ઓપરેટિંગ સિસ્ટમ, સરળ અને ઝડપી.
-
પેકબાયો-પૂર્ણ-લંબાઈનું ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ (સંદર્ભ વિનાનું)
પેસિફિક બાયોસાયન્સિસ (પેકબાયો) આઇસોફોર્મ સિક્વન્સિંગ ડેટાને ઇનપુટ તરીકે લેતા, આ એપ્લિકેશન પૂર્ણ-લંબાઈના ટ્રાન્સક્રિપ્ટ સિક્વન્સ (એસેમ્બલી વિના) ઓળખવામાં સક્ષમ છે. સંદર્ભ જીનોમ સામે પૂર્ણ-લંબાઈના સિક્વન્સનું મેપિંગ કરીને, ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સને જાણીતા જનીનો, ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સ, કોડિંગ પ્રદેશો વગેરે દ્વારા ઑપ્ટિમાઇઝ કરી શકાય છે. આ કિસ્સામાં, વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગ વગેરે જેવા mRNA સ્ટ્રક્ચર્સની વધુ સચોટ ઓળખ પ્રાપ્ત કરી શકાય છે. NGS ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ ડેટા સાથે સંયુક્ત વિશ્લેષણ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ સ્તરે અભિવ્યક્તિમાં વધુ વ્યાપક એનોટેશન અને વધુ સચોટ જથ્થાત્મકતા સક્ષમ કરે છે, જે મોટાભાગે ડાઉનસ્ટ્રીમ ડિફરન્શિયલ એક્સપ્રેશન અને ફંક્શનલ વિશ્લેષણને લાભ આપે છે.
-
ટૂલકિટ્સ
BMKCloud એ જીનોમિક પ્રોગ્રામ્સ માટે વન-સ્ટોપ સોલ્યુશન પૂરું પાડતું એક અગ્રણી બાયોઇન્ફોર્મેટિક પ્લેટફોર્મ છે, જે તબીબી, કૃષિ, પર્યાવરણીય વગેરે સહિત વિવિધ ક્ષેત્રોના સંશોધકો દ્વારા વ્યાપકપણે વિશ્વસનીય છે. BMKCloud બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણ પ્લેટફોર્મ અને સાધનો, કમ્પ્યુટિંગ સંસાધનો, જાહેર ડેટાબેઝ, બાયોઇન્ફોર્મેટિક ઓનલાઇન અભ્યાસક્રમો વગેરે સહિત સંકલિત, વિશ્વસનીય અને કાર્યક્ષમ સેવાઓ પ્રદાન કરવા માટે પ્રતિબદ્ધ છે. BMKCloud પાસે વારંવાર ઉપયોગમાં લેવાતા વિવિધ બાયોઇન્ફોર્મેટિક સાધનો છે જેમાં જનીન એનોટેશન, ઉત્ક્રાંતિ આનુવંશિક સાધનો, ncRNA, ડેટા ગુણવત્તા નિયંત્રણ, એસેમ્બલી, સંરેખણ, ડેટા નિષ્કર્ષણ, પરિવર્તન, આંકડા, આકૃતિ જનરેટર, ક્રમ વિશ્લેષણ વગેરેનો સમાવેશ થાય છે.
-
નાના આરએનએ
નાના RNA એ ટૂંકા નોન-કોડિંગ RNA ના પ્રકાર છે જેની સરેરાશ લંબાઈ 18-30 nt છે, જેમાં miRNA, siRNA અને piRNAનો સમાવેશ થાય છે. આ નાના RNA વિવિધ જૈવિક પ્રક્રિયાઓ જેમ કે mRNA ડિગ્રેડેશન, ટ્રાન્સલેશન ઇન્હિબિશન, હેટરોક્રોમેટિન ફોર્મેશન વગેરેમાં મોટા પાયે સામેલ હોવાનું નોંધાયું છે. પ્રાણી/છોડ વિકાસ, રોગ, વાયરસ વગેરે પરના અભ્યાસોમાં સ્મોલRNA સિક્વન્સિંગ વિશ્લેષણનો વ્યાપકપણે ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો છે. નાના RNA સિક્વન્સિંગ વિશ્લેષણ પ્લેટફોર્મમાં પ્રમાણભૂત વિશ્લેષણ અને અદ્યતન ડેટા માઇનિંગનો સમાવેશ થાય છે. RNA-seq ડેટાના આધારે, પ્રમાણભૂત વિશ્લેષણ miRNA ઓળખ અને આગાહી, miRNA લક્ષ્ય જનીન આગાહી, ટીકા અને અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ પ્રાપ્ત કરી શકે છે. અદ્યતન વિશ્લેષણ કસ્ટમાઇઝ્ડ miRNA શોધ અને નિષ્કર્ષણ, વેન ડાયાગ્રામ જનરેશન, miRNA અને લક્ષ્ય જનીન નેટવર્ક બિલ્ડિંગને સક્ષમ કરે છે.
-
NGS-WGS (ઇલ્યુમિના/BGI)
NGS-WGS એ એક સંપૂર્ણ જીનોમ રી-સિક્વન્સિંગ વિશ્લેષણ પ્લેટફોર્મ છે, જે બાયોમાર્કર ટેક્નોલોજીમાં સમૃદ્ધ અનુભવના આધારે વિકસાવવામાં આવ્યું છે. આ ઉપયોગમાં સરળ પ્લેટફોર્મ ફક્ત થોડા મૂળભૂત પરિમાણો સેટ કરીને સંકલિત વિશ્લેષણ વર્કફ્લોને ઝડપી સબમિટ કરવાની મંજૂરી આપે છે, જે ઇલુમિના પ્લેટફોર્મ અને BGI સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મ બંનેમાંથી જનરેટ થયેલા DNA સિક્વન્સિંગ ડેટા માટે યોગ્ય છે. આ પ્લેટફોર્મ ઉચ્ચ પ્રદર્શન કમ્પ્યુટિંગ સર્વર પર તૈનાત છે, જે ખૂબ જ મર્યાદિત સમયમાં અત્યંત કાર્યક્ષમ ડેટા વિશ્લેષણને સશક્ત બનાવે છે. વ્યક્તિગત ડેટા માઇનિંગ પ્રમાણભૂત વિશ્લેષણના આધારે ઉપલબ્ધ છે, જેમાં પરિવર્તિત જનીન ક્વેરી, PCR પ્રાઇમર ડિઝાઇન વગેરેનો સમાવેશ થાય છે.
-
mRNA(સંદર્ભ)
ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ એ જીનોમિક આનુવંશિક માહિતી અને જૈવિક કાર્યના પ્રોટીઓમ વચ્ચેની કડી છે. ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ લેવલ રેગ્યુલેશન એ સજીવોનો સૌથી મહત્વપૂર્ણ અને સૌથી વધુ અભ્યાસ કરાયેલ નિયમન મોડ છે. ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ કોઈપણ સમયે અથવા કોઈપણ સ્થિતિમાં ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમને સિક્વન્સ કરી શકે છે, એક જ ન્યુક્લિયોટાઇડ માટે સચોટ રિઝોલ્યુશન સાથે. તે ગતિશીલ રીતે જનીન ટ્રાન્સક્રિપ્શનના સ્તરને પ્રતિબિંબિત કરી શકે છે, એક સાથે દુર્લભ અને સામાન્ય ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સને ઓળખી શકે છે અને તેનું પ્રમાણ નક્કી કરી શકે છે, અને નમૂના-વિશિષ્ટ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સની માળખાકીય માહિતી પ્રદાન કરી શકે છે.
હાલમાં, ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ ટેકનોલોજીનો વ્યાપકપણે કૃષિશાસ્ત્ર, દવા અને અન્ય સંશોધન ક્ષેત્રોમાં ઉપયોગ થાય છે, જેમાં પ્રાણી અને વનસ્પતિ વિકાસ નિયમન, પર્યાવરણીય અનુકૂલન, રોગપ્રતિકારક ક્રિયાપ્રતિક્રિયા, જનીન સ્થાનિકીકરણ, પ્રજાતિઓ આનુવંશિક ઉત્ક્રાંતિ અને ગાંઠ અને આનુવંશિક રોગ શોધનો સમાવેશ થાય છે.
-
મેટાજેનોમિક્સ (NGS)
આ વિશ્લેષણ પ્લેટફોર્મ વર્ષોના અનુભવના આધારે શોટગન મેટાજેનોમિક ડેટા વિશ્લેષણ માટે રચાયેલ છે. તેમાં ડેટા પ્રોસેસિંગ, પ્રજાતિ-સ્તર અભ્યાસ, જનીન કાર્ય-સ્તર અભ્યાસ, મેટાજેનોમ બિનિંગ, વગેરે સહિત સામાન્ય રીતે જરૂરી વિવિધ મેટાજેનોમિક્સ વિશ્લેષણ ધરાવતું સંકલિત વર્કફ્લો શામેલ છે. વધુમાં, કસ્ટમાઇઝ્ડ ડેટા માઇનિંગ ટૂલ્સ પ્રમાણભૂત વિશ્લેષણ વર્કફ્લો પર ઉપલબ્ધ છે, જેમાં જનીન અને પ્રજાતિ ક્વેરી, પેરામીટર સેટિંગ, વ્યક્તિગત આકૃતિ જનરેટિંગ વગેરેનો સમાવેશ થાય છે.
-
એલએનસીઆરએનએ
લાંબા નોન-કોડિંગ RNA (lncRNA) એ 200 nt કરતા વધુ લંબાઈવાળા ટ્રાન્સક્રિપ્ટનો એક પ્રકાર છે, જે પ્રોટીનને કોડ કરવામાં અસમર્થ છે. સંચિત પુરાવા સૂચવે છે કે મોટાભાગના lncRNA કાર્યરત હોવાની શક્યતા ખૂબ જ છે. હાઇ-થ્રુપુટ સિક્વન્સિંગ ટેકનોલોજી અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણ સાધનો અમને lncRNA સિક્વન્સ અને પોઝિશનિંગ માહિતીને વધુ કાર્યક્ષમ રીતે જાહેર કરવા અને મહત્વપૂર્ણ નિયમનકારી કાર્યો સાથે lncRNA શોધવા માટે દોરી જવા માટે સશક્ત બનાવે છે. BMKCloud અમારા ગ્રાહકોને ઝડપી, વિશ્વસનીય અને લવચીક lncRNA વિશ્લેષણ પ્રાપ્ત કરવા માટે lncRNA સિક્વન્સિંગ વિશ્લેષણ પ્લેટફોર્મ પ્રદાન કરવામાં ગર્વ અનુભવે છે.
-
જીડબ્લ્યુએએસ
જીનોમ-વાઇડ એસોસિએશન સ્ટડી (GWAS) નો ઉદ્દેશ્ય ચોક્કસ લક્ષણો (ફેનોટાઇપ) સાથે સંકળાયેલા આનુવંશિક પ્રકારો (જીનોટાઇપ) ઓળખવાનો છે. GWA અભ્યાસો મોટી સંખ્યામાં વ્યક્તિઓના સંપૂર્ણ જીનોમને પાર કરીને આનુવંશિક માર્કર્સની તપાસ કરે છે અને વસ્તી સ્તરે આંકડાકીય વિશ્લેષણ દ્વારા જીનોટાઇપ-ફેનોટાઇપ જોડાણોની આગાહી કરે છે. સંપૂર્ણ-જીનોમ રિસિક્વન્સિંગ સંભવિત રીતે બધા આનુવંશિક પ્રકારો શોધી શકે છે. ફેનોટાઇપિક ડેટા સાથે જોડીને, GWAS ને ફેનોટાઇપ સંબંધિત SNPs, QTLs અને ઉમેદવાર જનીનો ઓળખવા માટે પ્રક્રિયા કરી શકાય છે, જે આધુનિક પ્રાણી/છોડ સંવર્ધનને મજબૂત રીતે સમર્થન આપે છે. SLAF એક સ્વ-વિકસિત સરળ જીનોમ સિક્વન્સિંગ વ્યૂહરચના છે, જે જીનોમ-વાઇડ વિતરિત માર્કર્સ, SNP શોધે છે. આ SNPs, મોલેક્યુલર આનુવંશિક માર્કર્સ તરીકે, લક્ષિત લક્ષણો સાથે સંકળાયેલા જટિલ લક્ષણોને ઓળખવા માટે પ્રક્રિયા કરી શકાય છે. તે આનુવંશિક ભિન્નતા સાથે સંકળાયેલા જટિલ લક્ષણોને ઓળખવામાં એક ખર્ચ-અસરકારક વ્યૂહરચના છે.
-
નેનોપોર પૂર્ણ-લંબાઈ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ
સજીવોમાં જટિલ અને ચલ વૈકલ્પિક આઇસોફોર્મ્સ જનીન અભિવ્યક્તિ અને પ્રોટીન વિવિધતાને નિયંત્રિત કરવા માટે મહત્વપૂર્ણ આનુવંશિક પદ્ધતિઓ છે. ટ્રાન્સક્રિપ્ટ માળખાઓની સચોટ ઓળખ એ જનીન અભિવ્યક્તિ નિયમન પેટર્નના ઊંડાણપૂર્વક અભ્યાસ માટેનો આધાર છે. નેનોપોર સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મે ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક અભ્યાસને સફળતાપૂર્વક આઇસોફોર્મ-સ્તર પર લાવ્યો છે. આ વિશ્લેષણ પ્લેટફોર્મ સંદર્ભ જીનોમના આધારે નેનોપોર પ્લેટફોર્મ પર જનરેટ થયેલા RNA-Seq ડેટાનું વિશ્લેષણ કરવા માટે રચાયેલ છે, જે જનીન સ્તર અને ટ્રાન્સક્રિપ્ટ સ્તર બંનેમાં ગુણાત્મક અને માત્રાત્મક વિશ્લેષણ પ્રાપ્ત કરે છે.
-
વર્તુળ-આરએનએ
પરિપત્ર RNA (circRNA) એ એક પ્રકારનો નોન-કોડિંગ RNA છે, જે તાજેતરમાં વિકાસ, પર્યાવરણીય પ્રતિકાર વગેરેમાં સામેલ નિયમનકારી નેટવર્ક્સમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવતો જોવા મળ્યો છે. રેખીય RNA અણુઓ, જેમ કે mRNA, lncRNA થી અલગ, circRNA ના 3′ અને 5′ છેડા એક ગોળાકાર માળખું બનાવવા માટે એકસાથે જોડાય છે, જે તેમને એક્સોન્યુક્લીઝના પાચનથી બચાવે છે અને મોટાભાગના રેખીય RNA કરતાં વધુ સ્થિર હોય છે. CircRNA જનીન અભિવ્યક્તિને નિયંત્રિત કરવામાં વિવિધ કાર્યો ધરાવે છે તેવું જાણવા મળ્યું છે. CircRNA ceRNA તરીકે કાર્ય કરી શકે છે, જે miRNA ને સ્પર્ધાત્મક રીતે જોડે છે, જેને miRNA સ્પોન્જ તરીકે ઓળખવામાં આવે છે. CircRNA સિક્વન્સિંગ વિશ્લેષણ પ્લેટફોર્મ circRNA માળખું અને અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ, લક્ષ્ય આગાહી અને અન્ય પ્રકારના RNA અણુઓ સાથે સંયુક્ત વિશ્લેષણને સશક્ત બનાવે છે.
-
બીએસએ
બલ્ક્ડ સેગ્રેગન્ટ એનાલિસિસ પ્લેટફોર્મમાં એક-પગલાના માનક વિશ્લેષણ અને કસ્ટમાઇઝ્ડ પેરામીટર સેટિંગ સાથે અદ્યતન વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે. BSA એ ફેનોટાઇપ સાથે સંકળાયેલ આનુવંશિક માર્કર્સને ઝડપથી ઓળખવા માટે ઉપયોગમાં લેવાતી તકનીક છે. BSA ના મુખ્ય કાર્યપ્રવાહમાં શામેલ છે: 1. અત્યંત વિરોધી ફેનોટાઇપ્સ ધરાવતા વ્યક્તિઓના બે જૂથો પસંદ કરવા; 2. બે જથ્થાબંધ DNA બનાવવા માટે તમામ વ્યક્તિઓના DNA, RNA અથવા SLAF-seq (બાયોમાર્કર દ્વારા વિકસિત) ને એકત્રિત કરવું; 3. સંદર્ભ જીનોમ સામે અથવા વચ્ચેના વિભેદક ક્રમ ઓળખવા, 4. ED અને SNP-ઇન્ડેક્સ અલ્ગોરિધમ દ્વારા ઉમેદવાર સાથે જોડાયેલા પ્રદેશોની આગાહી કરવી; 5. ઉમેદવાર પ્રદેશોમાં જનીનો પર કાર્યાત્મક વિશ્લેષણ અને સંવર્ધન, વગેરે. આનુવંશિક માર્કર સ્ક્રીનીંગ અને પ્રાઇમર ડિઝાઇન સહિત ડેટામાં વધુ અદ્યતન ખાણકામ પણ ઉપલબ્ધ છે.
-
એમ્પ્લીકોન (૧૬એસ/૧૮એસ/આઇટીએસ)
એમ્પ્લીકોન (16S/18S/ITS) પ્લેટફોર્મ માઇક્રોબાયલ ડાયવર્સિટી પ્રોજેક્ટ વિશ્લેષણમાં વર્ષોના અનુભવ સાથે વિકસાવવામાં આવ્યું છે, જેમાં પ્રમાણિત મૂળભૂત વિશ્લેષણ અને વ્યક્તિગત વિશ્લેષણ શામેલ છે: મૂળભૂત વિશ્લેષણ વર્તમાન માઇક્રોબાયલ સંશોધનની મુખ્ય પ્રવાહ વિશ્લેષણ સામગ્રીને આવરી લે છે, વિશ્લેષણ સામગ્રી સમૃદ્ધ અને વ્યાપક છે, અને વિશ્લેષણ પરિણામો પ્રોજેક્ટ રિપોર્ટ્સના સ્વરૂપમાં રજૂ કરવામાં આવે છે; વ્યક્તિગત વિશ્લેષણની સામગ્રી વૈવિધ્યસભર છે. વ્યક્તિગત જરૂરિયાતોને પૂર્ણ કરવા માટે, નમૂનાઓ પસંદ કરી શકાય છે અને મૂળભૂત વિશ્લેષણ અહેવાલ અને સંશોધન હેતુ અનુસાર પરિમાણો લવચીક રીતે સેટ કરી શકાય છે. વિન્ડોઝ ઓપરેટિંગ સિસ્ટમ, સરળ અને ઝડપી.
