-
સિંગલ- ન્યુક્લિયસ આરએનએ સિક્વન્સિંગ
સિંગલ સેલ કેપ્ચરિંગ અને વ્યક્તિગત લાઇબ્રેરી કન્સ્ટ્રક્શન ટેકનિકમાં એડવાન્સ હાઇ-થ્રુપુટ સિક્વન્સિંગ સાથે કોષ-દર-કોષના આધારે જનીન અભિવ્યક્તિ અભ્યાસને મંજૂરી આપે છે.તે જટિલ કોષોની વસ્તી પર ઊંડા અને સંપૂર્ણ સિસ્ટમ વિશ્લેષણને સક્ષમ કરે છે, જેમાં તે મોટાભાગે તમામ કોષોની સરેરાશ લઈને તેમની વિજાતીયતાને છુપાવવાનું ટાળે છે.
જો કે, કેટલાક કોષો સિંગલ-સેલ સસ્પેન્શન બનાવવા માટે યોગ્ય નથી, તેથી અન્ય નમૂના તૈયાર કરવાની પદ્ધતિઓ - પેશીઓમાંથી ન્યુક્લિયસ નિષ્કર્ષણની જરૂર છે, એટલે કે, ન્યુક્લિયસને પેશીઓ અથવા કોષમાંથી સીધું કાઢવામાં આવે છે અને સિંગલ-ન્યુક્લિયસ સસ્પેન્શનમાં તૈયાર કરવામાં આવે છે. સેલ સિક્વન્સિંગ.
BMK 10× જીનોમિક્સ ક્રોમિયમટીએમ આધારિત સિંગલ-સેલ આરએનએ સિક્વન્સિંગ સેવા પ્રદાન કરે છે.આ સેવાનો વ્યાપકપણે રોગ સંબંધિત અભ્યાસો, જેમ કે રોગપ્રતિકારક કોષોના વિભેદકતા, ગાંઠની વિષમતા, પેશીઓનો વિકાસ વગેરે પરના અભ્યાસમાં ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો છે.
અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ ચિપ: 10× જીનોમિક્સ
પ્લેટફોર્મ: ઈલુમિના નોવાસેક પ્લેટફોર્મ
-
છોડ/પ્રાણી સંપૂર્ણ જીનોમ સિક્વન્સિંગ
સંપૂર્ણ જિનોમ રિ-સિક્વન્સિંગ, જેને WGS તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે, સિંગલ ન્યુક્લિયોટાઇડ પોલીમોર્ફિઝમ (SNP), ઇન્સર્શન ડિલીશન (InDel), સ્ટ્રક્ચર વેરિએશન (SV), અને કોપી નંબર વેરિએશન (CNV) સહિત સમગ્ર જિનોમ પર સામાન્ય અને દુર્લભ બંને મ્યુટેશનને જાહેર કરવામાં સક્ષમ બનાવે છે. ).SVs એ SNPs કરતા ભિન્નતાના આધારનો મોટો હિસ્સો બનાવે છે અને જિનોમ પર વધુ અસર કરે છે, જે જીવંત સજીવો પર નોંધપાત્ર અસર કરે છે.લાંબા-વાંચન રિક્વન્સિંગ મોટા ટુકડાઓ અને જટિલ ભિન્નતાઓની વધુ ચોક્કસ ઓળખ માટે પરવાનગી આપે છે કારણ કે લાંબા વાંચન જટિલ પ્રદેશો જેમ કે ટેન્ડમ રિપીટ્સ, GC/AT-સમૃદ્ધ પ્રદેશો અને હાયપર-વેરિયેબલ પ્રદેશો પર રંગસૂત્રને પાર કરવાનું વધુ સરળ બનાવે છે.
પ્લેટફોર્મ: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 સ્પેશિયલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ
અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ વૈજ્ઞાનિક નવીનતામાં મોખરે છે, જે સંશોધકોને તેમના અવકાશી સંદર્ભને સાચવીને પેશીઓની અંદર જટિલ જનીન અભિવ્યક્તિની પેટર્ન શોધવા માટે સશક્તિકરણ કરે છે.વિવિધ પ્લેટફોર્મની વચ્ચે, BMKGene એ BMKManu S1000 સ્પેશિયલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ ચિપ વિકસાવી છે,ઉન્નત રીઝોલ્યુશન5µM, સબસેલ્યુલર શ્રેણી સુધી પહોંચે છે, અને સક્ષમ કરે છેમલ્ટી-લેવલ રિઝોલ્યુશન સેટિંગ્સ.S1000 ચિપ, આશરે 2 મિલિયન સ્પોટ્સ દર્શાવતી, અવકાશી બારકોડેડ કેપ્ચર પ્રોબ્સ સાથે લોડ થયેલ માળખા સાથે સ્તરવાળી માઇક્રોવેલ્સનો ઉપયોગ કરે છે.અવકાશી બારકોડ્સથી સમૃદ્ધ એક cDNA લાઇબ્રેરી S1000 ચિપમાંથી તૈયાર કરવામાં આવી છે અને ત્યારબાદ ઇલુમિના નોવાસેક પ્લેટફોર્મ પર ક્રમબદ્ધ છે.અવકાશી રીતે બારકોડેડ નમૂનાઓ અને UMIsનું સંયોજન જનરેટ થયેલ ડેટાની ચોકસાઈ અને વિશિષ્ટતાની ખાતરી કરે છે.BMKManu S1000 ચિપની વિશિષ્ટ વિશેષતા તેની વર્સેટિલિટીમાં રહેલી છે, જે મલ્ટિ-લેવલ રિઝોલ્યુશન સેટિંગ્સ ઓફર કરે છે જે વિવિધ પેશીઓ અને વિગતના સ્તરો સાથે બારીકાઈથી ટ્યુન કરી શકાય છે.આ અનુકૂલનક્ષમતા ન્યૂનતમ અવાજ સાથે ચોક્કસ અવકાશી ક્લસ્ટરિંગને સુનિશ્ચિત કરીને વિવિધ અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ અભ્યાસો માટે ઉત્કૃષ્ટ પસંદગી તરીકે ચિપને સ્થાન આપે છે.
BMKManu S1000 ચિપ અને અન્ય અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ તકનીકોનો ઉપયોગ કરીને, સંશોધકો કોશિકાઓના અવકાશી સંગઠન અને પેશીઓની અંદર થતી જટિલ પરમાણુ ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓની વધુ સારી સમજ મેળવી શકે છે, જે ક્ષેત્રોની વિશાળ શ્રેણીમાં જૈવિક પ્રક્રિયાઓ અંતર્ગત મિકેનિઝમ્સમાં અમૂલ્ય આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે. ઓન્કોલોજી, ન્યુરોસાયન્સ, ડેવલપમેન્ટલ બાયોલોજી, ઇમ્યુનોલોજી અને બોટનિકલ સ્ટડીઝ.
પ્લેટફોર્મ: BMKManu S1000 ચિપ અને Illumina NovaSeq
-
10x જીનોમિક્સ વિઝિયમ સ્પેશિયલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ
અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ એ એક અદ્યતન તકનીક છે જે સંશોધકોને તેમના અવકાશી સંદર્ભને સાચવીને પેશીઓની અંદર જનીન અભિવ્યક્તિ પેટર્નની તપાસ કરવાની મંજૂરી આપે છે.આ ડોમેનમાં એક શક્તિશાળી પ્લેટફોર્મ 10x જીનોમિક્સ વિઝિયમ છે જે ઇલુમિના સિક્વન્સિંગ સાથે જોડાયેલું છે.10X વિઝિયમનો સિદ્ધાંત નિયુક્ત કેપ્ચર વિસ્તાર સાથે વિશિષ્ટ ચિપ પર રહેલો છે જ્યાં પેશી વિભાગો મૂકવામાં આવે છે.આ કેપ્ચર એરિયામાં બારકોડેડ સ્પોટ્સ હોય છે, જે પ્રત્યેક પેશીની અંદર એક અનન્ય અવકાશી સ્થાનને અનુરૂપ હોય છે.રિવર્સ ટ્રાંસ્ક્રિપ્શન પ્રક્રિયા દરમિયાન પેશીઓમાંથી કબજે કરેલા આરએનએ પરમાણુઓને પછી અનન્ય પરમાણુ ઓળખકર્તા (UMIs) સાથે લેબલ કરવામાં આવે છે.આ બારકોડેડ સ્પોટ્સ અને UMIs ચોક્કસ અવકાશી મેપિંગ અને જનીન અભિવ્યક્તિનું પ્રમાણીકરણ સિંગલ-સેલ રિઝોલ્યુશન પર સક્ષમ કરે છે.અવકાશી રીતે બારકોડેડ નમૂનાઓ અને UMIsનું સંયોજન જનરેટ થયેલ ડેટાની ચોકસાઈ અને વિશિષ્ટતાની ખાતરી કરે છે.આ અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ ટેકનોલોજીનો ઉપયોગ કરીને, સંશોધકો કોશિકાઓના અવકાશી સંગઠન અને પેશીઓની અંદર થતી જટિલ પરમાણુ ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓની ઊંડી સમજ મેળવી શકે છે, ઓન્કોલોજી, ન્યુરોસાયન્સ, ડેવલપમેન્ટલ બાયોલોજી, ઇમ્યુનોલોજી સહિત બહુવિધ ક્ષેત્રોમાં જૈવિક પ્રક્રિયાઓ અંતર્ગત મિકેનિઝમ્સમાં અમૂલ્ય આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે. , અને બોટનિકલ અભ્યાસ.
પ્લેટફોર્મ: 10X જીનોમિક્સ વિઝિયમ અને ઈલુમિના નોવાસેક
-
પૂર્ણ-લંબાઈ mRNA સિક્વન્સિંગ-નેનોપોર
જ્યારે NGS-આધારિત mRNA સિક્વન્સિંગ જનીન અભિવ્યક્તિ પરિમાણ માટે બહુમુખી સાધન તરીકે સેવા આપે છે, ત્યારે ટૂંકા વાંચન પર તેની નિર્ભરતા જટિલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક વિશ્લેષણમાં તેની અસરકારકતાને પ્રતિબંધિત કરે છે.નેનોપોર સિક્વન્સિંગ, બીજી તરફ, લાંબી-વાંચવાની તકનીકનો ઉપયોગ કરે છે, જે પૂર્ણ-લંબાઈના mRNA ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટ્સના ક્રમને સક્ષમ કરે છે.આ અભિગમ વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગ, જનીન ફ્યુઝન, પોલી-એડીનીલેશન અને mRNA આઇસોફોર્મ્સના પરિમાણના વ્યાપક અન્વેષણની સુવિધા આપે છે.
નેનોપોર સિક્વન્સિંગ નેનોપોર સિંગલ-મોલેક્યુલ રીઅલ-ટાઇમ ઇલેક્ટ્રિકલ સિગ્નલો પર આધાર રાખે છે.મોટર પ્રોટીન દ્વારા માર્ગદર્શિત, ડબલ-સ્ટ્રેન્ડેડ ડીએનએ બાયોફિલ્મમાં જડિત નેનોપોર પ્રોટીન સાથે જોડાય છે, જ્યારે તે વોલ્ટેજ તફાવત હેઠળ નેનોપોર ચેનલમાંથી પસાર થાય છે ત્યારે અનવાઈન્ડ થાય છે.ડીએનએ સ્ટ્રૅન્ડ પર વિવિધ પાયા દ્વારા પેદા થતા વિશિષ્ટ વિદ્યુત સંકેતોને વાસ્તવિક સમયમાં શોધી અને વર્ગીકૃત કરવામાં આવે છે, જે ચોક્કસ અને સતત ન્યુક્લિયોટાઇડ સિક્વન્સિંગની સુવિધા આપે છે.આ નવીન અભિગમ ટૂંકી-વાંચવાની મર્યાદાઓને દૂર કરે છે અને જટિલ જીનોમિક વિશ્લેષણ માટે ગતિશીલ પ્લેટફોર્મ પૂરું પાડે છે, જેમાં જટિલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક અભ્યાસનો સમાવેશ થાય છે.
પ્લેટફોર્મ: નેનોપોર પ્રોમેથિઓન P48
-
પૂર્ણ-લંબાઈની mRNA સિક્વન્સિંગ -PacBio
જ્યારે NGS-આધારિત mRNA સિક્વન્સિંગ એ જનીન અભિવ્યક્તિનું પ્રમાણ નક્કી કરવા માટે બહુમુખી સાધન છે, ટૂંકા વાંચન પર તેની નિર્ભરતા જટિલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક વિશ્લેષણમાં તેના ઉપયોગને પ્રતિબંધિત કરે છે.બીજી બાજુ, PacBio સિક્વન્સિંગ (Iso-Seq), લાંબા સમયથી વાંચેલી ટેક્નોલોજીનો ઉપયોગ કરે છે, જે પૂર્ણ-લંબાઈના mRNA ટ્રાન્સક્રિપ્ટના ક્રમને સક્ષમ કરે છે.આ અભિગમ વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગ, જનીન ફ્યુઝન અને પોલી-એડીનિલેશનના વ્યાપક અન્વેષણની સુવિધા આપે છે, જો કે તે જનીન અભિવ્યક્તિ પરિમાણ માટે પ્રાથમિક પસંદગી નથી, જે જરૂરી ડેટાની ઊંચી માત્રાને કારણે છે.
PacBio સિક્વન્સિંગ ટેક્નોલોજી સિંગલ-મોલેક્યુલ, રીઅલ-ટાઇમ (SMRT) સિક્વન્સિંગ પર આધાર રાખે છે, જે પૂર્ણ-લંબાઈના mRNA ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટને કૅપ્ચર કરવામાં એક અલગ ફાયદો પ્રદાન કરે છે.આ નવીન અભિગમમાં શૂન્ય-મોડ વેવગાઇડ્સ (ZMWs), માઇક્રોફેબ્રિકેટેડ કૂવાઓનો ઉપયોગ શામેલ છે જે ક્રમ દરમિયાન DNA પોલિમરેઝ પ્રવૃત્તિનું વાસ્તવિક-સમય અવલોકન સક્ષમ કરે છે.આ ZMW ની અંદર, PacBio નું DNA પોલિમરેઝ DNA ના પૂરક સ્ટ્રૅન્ડનું સંશ્લેષણ કરે છે, લાંબા વાંચન ઉત્પન્ન કરે છે જે mRNA ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટ્સની સંપૂર્ણતાને ફેલાવે છે.સર્ક્યુલર કન્સેન્સસ સિક્વન્સિંગ (CCS) મોડમાં PacBio ઑપરેશન એક જ પરમાણુને વારંવાર સિક્વન્સ કરીને ચોકસાઈ વધારે છે.જનરેટ કરેલ HiFi રીડ્સ NGS સાથે સરખાવી શકાય તેવી ચોકસાઈ ધરાવે છે, જે જટિલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક લક્ષણોના વ્યાપક અને વિશ્વસનીય વિશ્લેષણમાં આગળ ફાળો આપે છે.પ્લેટફોર્મ: PacBio સિક્વલ II
-
યુકેરીયોટિક mRNA સિક્વન્સિંગ-ઇલ્યુમિના
mRNA સિક્વન્સિંગ ચોક્કસ પરિસ્થિતિઓ હેઠળ કોષોની અંદર તમામ mRNA ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સની વ્યાપક પ્રોફાઇલિંગને સશક્ત બનાવે છે.આ અદ્યતન ટેકનોલોજી એક શક્તિશાળી સાધન તરીકે કામ કરે છે, જે જટિલ જનીન અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલ્સ, જનીન બંધારણો અને વિવિધ જૈવિક પ્રક્રિયાઓ સાથે સંકળાયેલ મોલેક્યુલર મિકેનિઝમ્સનું અનાવરણ કરે છે.મૂળભૂત સંશોધન, ક્લિનિકલ ડાયગ્નોસ્ટિક્સ અને ડ્રગ ડેવલપમેન્ટમાં વ્યાપકપણે અપનાવવામાં આવેલ, mRNA સિક્વન્સિંગ સેલ્યુલર ડાયનેમિક્સ અને આનુવંશિક નિયમનની જટિલતાઓમાં આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે.
પ્લેટફોર્મ: Illumina NovaSeq X
-
બિન-સંદર્ભ આધારિત mRNA સિક્વન્સિંગ-ઇલ્યુમિના
mRNA સિક્વન્સિંગ ચોક્કસ પરિસ્થિતિઓ હેઠળ કોષોની અંદર તમામ mRNA ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સની વ્યાપક પ્રોફાઇલિંગને સશક્ત બનાવે છે.આ અદ્યતન ટેકનોલોજી એક શક્તિશાળી સાધન તરીકે કામ કરે છે, જે જટિલ જનીન અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલ્સ, જનીન બંધારણો અને વિવિધ જૈવિક પ્રક્રિયાઓ સાથે સંકળાયેલ મોલેક્યુલર મિકેનિઝમ્સનું અનાવરણ કરે છે.મૂળભૂત સંશોધન, ક્લિનિકલ ડાયગ્નોસ્ટિક્સ અને ડ્રગ ડેવલપમેન્ટમાં વ્યાપકપણે અપનાવવામાં આવેલ, mRNA સિક્વન્સિંગ સેલ્યુલર ડાયનેમિક્સ અને આનુવંશિક નિયમનની જટિલતાઓમાં આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે.
પ્લેટફોર્મ: Illumina NovaSeq X
-
લાંબી નોન-કોડિંગ સિક્વન્સિંગ-ઇલ્યુમિના
લાંબા નોન-કોડિંગ RNAs (lncRNAs) એ 200 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ કરતાં લાંબા RNAs છે જે ન્યૂનતમ કોડિંગ સંભવિત ધરાવે છે અને બિન-કોડિંગ RNA ની અંદર મુખ્ય ઘટકો છે.ન્યુક્લિયસ અને સાયટોપ્લાઝમમાં જોવા મળે છે, આ આરએનએ એપિજેનેટિક, ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ અને પોસ્ટ-ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ રેગ્યુલેશનમાં નિર્ણાયક ભૂમિકા ભજવે છે, જે સેલ્યુલર અને મોલેક્યુલર પ્રક્રિયાઓને આકાર આપવામાં તેમના મહત્વને રેખાંકિત કરે છે.LncRNA સિક્વન્સિંગ એ સેલ ડિફરન્સિએશન, ઑન્ટોજેનેસિસ અને માનવ રોગોમાં એક શક્તિશાળી સાધન છે.
પ્લેટફોર્મ: Illumina NovaSeq
-
નાના આરએનએ સિક્વન્સિંગ-ઇલ્યુમિના
નાના આરએનએ (sRNA) પરમાણુઓ, સામાન્ય રીતે 200 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સથી ઓછા લંબાઈમાં, માઇક્રોઆરએનએ (miRNAs), નાના દખલ કરનારા RNAs (siRNAs), અને piwi-interacting RNAs (piRNAs) નો સમાવેશ થાય છે.આ પૈકી, miRNAs, લગભગ 20-24 ન્યુક્લિયોટાઇડ લાંબા, વિવિધ સેલ્યુલર પ્રક્રિયાઓમાં તેમની મુખ્ય નિયમનકારી ભૂમિકાઓ માટે ખાસ કરીને નોંધપાત્ર છે.ટીશ્યુ-વિશિષ્ટ અને સ્ટેજ-વિશિષ્ટ અભિવ્યક્તિ પેટર્ન સાથે, miRNAs વિવિધ જાતિઓમાં ઉચ્ચ સંરક્ષણ દર્શાવે છે.
પ્લેટફોર્મ: Illumina NovaSeq
-
circRNA સિક્વન્સિંગ-ઇલ્યુમિના
સર્ક્યુલર આરએનએ સિક્વન્સિંગ (circRNA-seq) એ પરિપત્ર આરએનએની પ્રોફાઇલ અને વિશ્લેષણ કરવાનો છે, જે આરએનએ પરમાણુઓનો એક વર્ગ છે જે બિન-પ્રમાણિક સ્પ્લિસિંગ ઘટનાઓને કારણે બંધ લૂપ્સ બનાવે છે, આ આરએનએને વધેલી સ્થિરતા પ્રદાન કરે છે.જ્યારે કેટલાક circRNA ને માઇક્રોઆરએનએ સ્પંજ તરીકે કામ કરતા દર્શાવવામાં આવ્યા છે, માઇક્રોઆરએનએને અલગ કરે છે અને તેમને તેમના લક્ષ્ય mRNA ને નિયમન કરતા અટકાવે છે, અન્ય circRNA પ્રોટીન સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરી શકે છે, જનીન અભિવ્યક્તિને મોડ્યુલેટ કરી શકે છે અથવા સેલ્યુલર પ્રક્રિયાઓમાં ભૂમિકા ભજવી શકે છે.circRNA અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ આ પરમાણુઓની નિયમનકારી ભૂમિકાઓ અને વિવિધ સેલ્યુલર પ્રક્રિયાઓ, વિકાસના તબક્કાઓ અને રોગની પરિસ્થિતિઓમાં તેમના મહત્વની આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે, જે જનીન અભિવ્યક્તિના સંદર્ભમાં RNA નિયમનની જટિલતાની ઊંડી સમજણમાં ફાળો આપે છે.
-
સંપૂર્ણ ટ્રાન્સક્રિપ્ટમ સિક્વન્સિંગ - ઇલુમિના
સંપૂર્ણ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ વિવિધ આરએનએ પરમાણુઓની રૂપરેખા કરવા માટે એક વ્યાપક અભિગમ પ્રદાન કરે છે, જેમાં કોડિંગ (mRNA) અને નોન-કોડિંગ RNAs (lncRNA, circRNA અને miRNA) બંનેનો સમાવેશ થાય છે.આ ટેકનિક આપેલ ક્ષણે ચોક્કસ કોષોના સંપૂર્ણ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમને કેપ્ચર કરે છે, જે સેલ્યુલર પ્રક્રિયાઓની સર્વગ્રાહી સમજણ માટે પરવાનગી આપે છે."ટોટલ આરએનએ સિક્વન્સિંગ" તરીકે પણ ઓળખાય છે, તેનો ઉદ્દેશ ટ્રાન્સક્રિપ્ટમ સ્તરે જટિલ નિયમનકારી નેટવર્કને અનાવરણ કરવાનો છે, જે સ્પર્ધાત્મક અંતર્જાત RNA (ceRNA) અને સંયુક્ત RNA વિશ્લેષણ જેવા ઊંડાણપૂર્વક વિશ્લેષણને સક્ષમ કરે છે.આ કાર્યાત્મક પાત્રાલેખન તરફના પ્રારંભિક પગલાને ચિહ્નિત કરે છે, ખાસ કરીને circRNA-miRNA-mRNA-આધારિત ceRNA ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ સાથે સંકળાયેલા નિયમનકારી નેટવર્કને ઉકેલવામાં.
