ઘટાડેલ પ્રતિનિધિત્વ બાયસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગ (RRBS)
ઘટાડેલ પ્રતિનિધિત્વ બાયસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગ (RRBS) MspI ક્લીવેજ દ્વારા CpG ટાપુ-સમૃદ્ધ પ્રદેશોના સંવર્ધન પર આધાર રાખે છે અને ત્યારબાદ 200-500/600 bps ટુકડાઓનું કદ પસંદ કરવામાં આવે છે. પરિણામે, ફક્ત CpG ટાપુઓની નજીકના પ્રદેશોને જ સિક્વન્સ કરવામાં આવે છે, જ્યારે દૂરના CpG ટાપુઓ ધરાવતા પ્રદેશોને વિશ્લેષણમાંથી બાકાત રાખવામાં આવે છે. બાયસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગ સાથે જોડાયેલી આ પ્રક્રિયા, DNA મેથિલેશનના ઉચ્ચ-રીઝોલ્યુશન શોધને મંજૂરી આપે છે, અને સિક્વન્સિંગ અભિગમ, PE150, ખાસ કરીને મધ્યને બદલે ઇન્સર્ટ્સના છેડા પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરે છે, જે મેથિલેશન પ્રોફાઇલિંગની કાર્યક્ષમતામાં વધારો કરે છે.
આ તકનીક ડીએનએ મેથિલેશન સંશોધનમાં હોલ જીનોમ બાયસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગ (WGBS) ના ખર્ચ-અસરકારક અને કાર્યક્ષમ વિકલ્પ તરીકે ઉભરી આવી છે. જ્યારે WGBS સિંગલ બેઝ રિઝોલ્યુશન પર સમગ્ર જીનોમની તપાસ કરીને વ્યાપક આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે, ત્યારે તેની ઊંચી કિંમત મર્યાદિત પરિબળ બની શકે છે, જે RRBS વ્યૂહાત્મક રીતે જીનોમના પ્રતિનિધિ ભાગનું પસંદગીયુક્ત વિશ્લેષણ કરીને આ પડકારને ઘટાડે છે. આ પદ્ધતિ એક અમૂલ્ય સાધન છે જે ખર્ચ-અસરકારક DNA મેથિલેશન સંશોધનને સક્ષમ બનાવે છે અને એપિજેનેટિક મિકેનિઝમ્સના જ્ઞાનને આગળ ધપાવે છે.
સેવા સુવિધાઓ
● ઇલુમિના નોવાસેક પર સિક્વન્સિંગ.
● સંદર્ભ જીનોમની જરૂર છે.
● લેમ્બડા ડીએનએનો ઉપયોગ બાયસલ્ફાઇટ રૂપાંતર કાર્યક્ષમતાનું નિરીક્ષણ કરવા માટે થાય છે.
● MspI પાચન કાર્યક્ષમતાનું પણ નિરીક્ષણ કરવામાં આવે છે.
● છોડના નમૂનાઓ માટે ડબલ એન્ઝાઇમ પાચન.
સેવાના ફાયદા
●WGBS માટે ખર્ચ-અસરકારક અને કાર્યક્ષમ વિકલ્પ: તે ઓછા ખર્ચે અને ઓછી નમૂના આવશ્યકતાઓ સાથે વિશ્લેષણ હાથ ધરવા સક્ષમ બનાવે છે.
●સંપૂર્ણ પ્લેટફોર્મ:અમે સેમ્પલ પ્રોસેસિંગ, લાઇબ્રેરી બાંધકામ અને સિક્વન્સિંગથી લઈને બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ વિશ્લેષણ સુધીની વન-સ્ટોપ ઉત્તમ સેવા પ્રદાન કરીએ છીએ.
●વ્યાપક કુશળતા: અમને વિવિધ પ્રજાતિઓમાં સફળતા મળી છે. BMKGENE એક દાયકાથી વધુનો અનુભવ, ઉચ્ચ કુશળ વિશ્લેષણ ટીમ, વ્યાપક સામગ્રી અને ઉત્તમ પોસ્ટ-સેલ્સ સપોર્ટ લાવે છે.
સેવા સ્પષ્ટીકરણો
| પુસ્તકાલય | સિક્વન્સિંગ સ્ટ્રેટેજી | ભલામણ કરેલ ડેટા આઉટપુટ | ગુણવત્તા નિયંત્રણ |
| MspI પાચન અને બાયસલ્ફાઇટ પ્રક્રિયા કરેલ લાઇબ્રેરી | ઇલુમિના PE150 | 8 જીબી | Q30 ≥ 85% બાયસલ્ફાઇટ રૂપાંતર > 99% MspI કટીંગ કાર્યક્ષમતા > 95% |
નમૂના આવશ્યકતાઓ
| સાંદ્રતા (ng/µL) | કુલ રકમ (µg) |
| |
| જીનોમિક ડીએનએ | ≥ ૩૦ | ≥ ૧ | મર્યાદિત અધોગતિ અથવા દૂષણ |
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
નમૂના વિતરણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
ક્રમ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
BI વિશ્લેષણમાં શામેલ છે:
● કાચો ક્રમ ગુણવત્તા નિયંત્રણ;
● સંદર્ભ જીનોમ પર મેપિંગ;
● 5mC મિથાઈલેટેડ બેઝની શોધ અને મોટિફ ઓળખ;
● મિથાઈલેશન વિતરણ અને નમૂના સરખામણીનું વિશ્લેષણ;
● ડિફરન્શિયલી મેથિલેટેડ રિજિયન્સ (DMRs) નું વિશ્લેષણ;
● DMR સાથે સંકળાયેલ જનીનોનું કાર્યાત્મક એનોટેશન.
ગુણવત્તા નિયંત્રણ: પાચન કાર્યક્ષમતા (જીનોમ મેપિંગમાં)
ગુણવત્તા નિયંત્રણ: બાયસલ્ફાઇટ રૂપાંતર (મેથિલેશન માહિતી નિષ્કર્ષણમાં)
મિથાઈલેશન નકશો: 5mC મિથાઈલેશન જીનોમ-વ્યાપી વિતરણ
નમૂના સરખામણી: મુખ્ય ઘટક વિશ્લેષણ
ડિફરન્શિયલી મેથિલેટેડ રિજિયન્સ (DMRs) વિશ્લેષણ: હીટમેપ
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા BMKGene ની સમગ્ર જીનોમ બાયસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગ સેવાઓ દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલી સંશોધન પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો.
લી, ઝેડ. એટ અલ. (2022) 'CRISPR સક્રિયકરણ અને પેરાક્રિન પરિબળો દ્વારા લેડિગ જેવા કોષોમાં હાઇ-ફિડેલિટી રિપ્રોગ્રામિંગ',પીએનએએસ નેક્સસ, 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
ટિયાન, એચ. એટ અલ. (2023) 'ચાઇનીઝ મોનોઝાયગોટિક જોડિયાઓમાં શરીરની રચનાનું જીનોમ-વાઇડ ડીએનએ મેથિલેશન વિશ્લેષણ',યુરોપિયન જર્નલ ઓફ ક્લિનિકલ ઇન્વેસ્ટિગેશન, 53(11), પૃષ્ઠ. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
વુ, વાય. એટ અલ. (2022) 'ડીએનએ મેથિલેશન અને કમર-થી-હિપ રેશિયો: ચાઇનીઝ મોનોઝાયગોટિક ટ્વિન્સમાં એપિજેનોમ-વ્યાપી એસોસિએશન અભ્યાસ',જર્નલ ઓફ એન્ડોક્રિનોલોજિકલ ઇન્વેસ્ટિગેશન, 45(12), પાના. 2365–2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.
