આખા જીનોમ બાયસલ્ફેટ સિક્વન્સિંગ (WGBS)
આ ટેકનિક, જે ડીએનએના બાયસલ્ફાઇટ ટ્રીટમેન્ટ પર આધારિત છે જે અનમિથિલેટેડ સાયટોસાઇન્સને યુરેસિલ (C થી U) માં રૂપાંતરિત કરે છે, જ્યારે મિથિલેટેડ સાયટોસાઇન્સને યથાવત રાખે છે, તે ડીએનએ મિથિલેશનના ઊંડાણપૂર્વકના સંશોધન માટે ગોલ્ડ-સ્ટાન્ડર્ડ પદ્ધતિ તરીકે ઊભું છે, ખાસ કરીને સાયટોસાઇન (5-mC) માં પાંચમું સ્થાન, જે જનીન અભિવ્યક્તિ અને સેલ્યુલર પ્રવૃત્તિનું મુખ્ય નિયમનકાર છે.
આ ટેકનિક સિંગલ-બેઝ રિઝોલ્યુશન પ્રદાન કરે છે, જે સંશોધકોને મિથાઈલોમની વ્યાપક તપાસ કરવાની અને નમૂનાઓમાં અસામાન્ય મિથાઈલેશન પેટર્ન શોધવાની મંજૂરી આપે છે. WGBS નો ઉપયોગ કરીને, વૈજ્ઞાનિકો જીનોમ-વ્યાપી મિથાઈલેશન લેન્ડસ્કેપ્સમાં અજોડ આંતરદૃષ્ટિ મેળવી શકે છે, જે વિવિધ જૈવિક પ્રક્રિયાઓ અને રોગોના અંતર્ગત એપિજેનેટિક મિકેનિઝમ્સની સૂક્ષ્મ સમજ પૂરી પાડે છે.
સેવા સુવિધાઓ
● ઇલુમિના નોવાસેક પર સિક્વન્સિંગ.
● સંદર્ભ જીનોમની જરૂર છે.
● બાયસલ્ફાઇટ રૂપાંતર કાર્યક્ષમતાનું નિરીક્ષણ કરવા માટે લેમ્બડા ડીએનએ ઉમેરવામાં આવે છે.
સેવાના ફાયદા
●ડીએનએ મેથિલેશન સંશોધન માટે સુવર્ણ માનક: આ પરિપક્વ ટેકનોલોજી ઉચ્ચ ચોકસાઈ અને સારી પ્રજનનક્ષમતા ધરાવે છે.
●વ્યાપક કવરેજ અને સિંગલ-બેઝ રિઝોલ્યુશન:મિથાઈલેશન સાઇટ્સની શોધ જીનોમ-વ્યાપી સ્તરે છે.
●સંપૂર્ણ પ્લેટફોર્મ:અમે નમૂના પ્રક્રિયા, પુસ્તકાલય નિર્માણ, સિક્વન્સિંગથી લઈને બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ વિશ્લેષણ સુધીની વન-સ્ટોપ સેવા પ્રદાન કરીએ છીએ.
●વ્યાપક કુશળતા: અમારી પાસે વિવિધ પ્રજાતિઓમાં પૂર્ણ થયેલા પ્રોજેક્ટ્સનો વ્યાપક સ્પેક્ટ્રમ છે. BMKGENE એક દાયકાથી વધુનો અનુભવ, ઉચ્ચ કુશળ વિશ્લેષણ ટીમ, વ્યાપક સામગ્રી અને ઉત્તમ પોસ્ટ-સેલ્સ સપોર્ટ લાવે છે.
●ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ વિશ્લેષણ સાથે જોડાવાની શક્યતા: RNA-seq જેવા અન્ય ઓમિક્સ ડેટા સાથે WGBS ના સંકલિત વિશ્લેષણને મંજૂરી આપવી.
નમૂના સ્પષ્ટીકરણો
| પુસ્તકાલય | સિક્વન્સિંગ સ્ટ્રેટેજી | ભલામણ કરેલ ડેટા આઉટપુટ | ગુણવત્તા નિયંત્રણ |
| બાયસલ્ફાઇટની સારવાર | ઇલુમિના PE150 | ૩૦ ગણી ઊંડાઈ | Q30 ≥ 85% બાયસલ્ફાઇટ રૂપાંતર > 99% |
નમૂના આવશ્યકતાઓ
| સાંદ્રતા (ng/µL) | કુલ રકમ (µg) | વધારાની જરૂરિયાતો | |
| જીનોમિક ડીએનએ | ≥ ૫ | ≥ ૪૦૦ નંગ | મર્યાદિત અધોગતિ અથવા દૂષણ |
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
નમૂના વિતરણ
ડીએનએ નિષ્કર્ષણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
ક્રમ
ડેટા વિશ્લેષણ
ડેટા ડિલિવરી
આ સેવામાં નીચેના વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે:
● કાચો ક્રમ ગુણવત્તા નિયંત્રણ;
● સંદર્ભ જીનોમ પર મેપિંગ;
● 5mC મિથાઈલેટેડ બેઝની શોધ;
● મિથાઈલેશન વિતરણ અને ટીકાનું વિશ્લેષણ;
● ડિફરન્શિયલી મેથિલેટેડ રિજિયન્સ (DMRs) નું વિશ્લેષણ;
● DMR સાથે સંકળાયેલ જનીનોનું કાર્યાત્મક એનોટેશન.
5mC મિથાઈલેશન શોધ: મિથાઈલેટેડ સાઇટ્સના પ્રકારો
મિથાઈલેશન નકશો. 5mC મિથાઈલેશન જીનોમ-વ્યાપી વિતરણ
ઉચ્ચ મિથાઈલેટેડ પ્રદેશોની ટીકા
વિભેદક રીતે મેથિલેટેડ પ્રદેશો: સંકળાયેલ જનીનો
વિભેદક રીતે મિથાઈલેટેડ પ્રદેશો: સંકળાયેલ જનીનોનું ટીકાકરણ (જીન ઓન્ટોલોજી)
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા BMKGene ની સમગ્ર જીનોમ બાયસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગ સેવાઓ દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલી સંશોધન પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો.
ફેન, વાય. એટ અલ. (2020) 'સમગ્ર જીનોમ બાયસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગનો ઉપયોગ કરીને ઘેટાંના હાડપિંજરના સ્નાયુ વિકાસ દરમિયાન ડીએનએ મેથિલેશન પ્રોફાઇલ્સનું વિશ્લેષણ',બીએમસી જીનોમિક્સ, 21(1), પૃષ્ઠ 1-15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
ઝાઓ, એક્સ. એટ અલ. (2022) 'વિનાઇલ ક્લોરાઇડના સંપર્કમાં આવતા કામદારોમાં નોવેલ ડીઓક્સિરીબોન્યુક્લિક એસિડ મિથાઈલેશન ખલેલ',વિષવિજ્ઞાન અને ઔદ્યોગિક આરોગ્ય, 38(7), પૃષ્ઠ 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
ઝુઓ, જે. એટ અલ. (2020) 'ટામેટા ફળના પાકમાં જીનોમ મેથિલેશન, નોન-કોડિંગ આરએનએ, એમઆરએનએ અને મેટાબોલાઇટ્સના સ્તર વચ્ચેના સંબંધો',ધ પ્લાન્ટ જર્નલ, 103(3), પાના. 980-994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
