条形 banner-03

Kayayyaki

Dakunan karatu na Illumina da aka riga aka yi

Fasahar jerin bayanai ta Illumina, wadda ta dogara ne akan Sequencing by Synthesis (SBS), wata sabuwar fasaha ce ta NGS da aka yarda da ita a duk duniya, wacce ke da alhakin samar da sama da kashi 90% na bayanan jerin bayanai na duniya. Ka'idar SBS ta ƙunshi ɗaukar hotunan masu ƙarewa masu haske yayin da ake ƙara kowane dNTP, sannan a raba su don ba da damar haɗa tushe na gaba. Tare da duk dNTP guda huɗu masu ɗaurewa masu juyawa waɗanda ke cikin kowane zagayen jerin bayanai, gasa ta halitta tana rage son zuciya a cikin tsarin haɗa bayanai. Wannan fasaha mai amfani tana tallafawa ɗakunan karatu guda ɗaya da na ƙarshe, suna ba da dama ga aikace-aikacen genomic iri-iri. Ikon sarrafa bayanai na Illumina da daidaiton sa sun sanya shi a matsayin ginshiƙi a cikin binciken genomics, suna ba masana kimiyya damar warware matsalolin kwayoyin halitta tare da cikakkun bayanai da inganci marasa misaltuwa.

Sabis ɗinmu na tsara ɗakin karatu da aka riga aka yi yana ba abokan ciniki damar shirya ɗakunan karatu na tsara littattafai daga tushe daban-daban (mRNA, cikakken genome, amplicon, ɗakunan karatu na 10x, da sauransu). Bayan haka, ana iya aika waɗannan ɗakunan karatu zuwa cibiyoyin tsara littattafai don kula da inganci da tsara su a dandamalin Illumina.


Cikakkun Bayanan Sabis

Sakamakon Gwaji

Siffofi

Dandamali:Illumina NovaSeq 6000 da NovaSeq X Plus

Yanayin jerawa:PE150 da PE250

Kula da inganci na ɗakunan karatu kafin a tsara su

Takaitaccen bayani QC da isarwa:isar da rahoton QC da bayanai marasa inganci a cikin tsarin fastq bayan cirewa da tace karatun Q30

 

 

Fa'idodin Sabis

Sauƙin amfani da ayyukan tsara ayyuka:Abokin ciniki zai iya zaɓar yin jerin gwano ta hanyar layi, ƙwayar kwarara, ko kuma ta hanyar adadin bayanan da ake buƙata (jerin layin ɓangare).

Kwarewa mai zurfi akan dandamalin jerin Illumina:tare da dubban ayyukan rufewa tare da nau'ikan halittu daban-daban. 

Isarwa na rahoton QC na jerin abubuwa:tare da ma'aunin inganci, daidaiton bayanai da kuma cikakken aikin aikin tsara jadawalin.

Tsarin jerin gwanon manya:tare da ɗan gajeren lokacin juyawa.

Sarrafa Inganci Mai Tsauri: muna aiwatar da ƙa'idodin QC masu tsauri don tabbatar da isar da sakamako mai inganci akai-akai.

 

 

Samfurin dandamali

Dandalin

Kwayar Gudawa

Yanayin jerawa

Naúrar

Kimanta fitarwa

NovaSeq X

10B (hanyoyi 8)

PE150

Hanya ɗaya tilo

Titin Bangare

375Gb / Layi

25B ( hanyoyi 8)

PE150

Hanya ɗaya tilo

Titin Bangare

1000 Gb/Lane

NovaSeq 6000

Tantanin kwararar SP (layuka 2)

PE250

Kwayar Gudawa

Hanya ɗaya tilo

Titin Bangare

325-400 M karanta / Lane

S4 Flow cell (layuka 4)

PE150

Kwayar Gudawa

Hanya ɗaya tilo

Titin Bangare

~800 Gb / Layi

Samfurin Bukatun

 

Adadin Bayanai (X)

Mayar da Hankali (qPCR/nM)

Ƙarar girma

Jerin Layi na Bangare

 

 

X ≤ 10 Gb

≥ 1 nM

≥ 25 μl

10 Gb < X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 25 μl

50 Gb < X ≤ 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 25 μl

X > 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 25 μl

Jerin Layi

Kowace Layi

≥ 1.5 nM / Wurin wanka na ɗakin karatu

≥ 25 μl / Wurin wanka na ɗakin karatu

Baya ga yawan taro da jimillar adadin, ana kuma buƙatar tsarin kololuwa mai dacewa.

Lura: Jerin layukan laburaren ƙananan bambance-bambance yana buƙatar PhiX ya shigo don tabbatar da ingantaccen kiran tushe.

Muna ba da shawarar a gabatar da ɗakunan karatu da aka riga aka haɗa a matsayin samfura. Idan kuna buƙatar BMKGENE don yin haɗa ɗakunan karatu, da fatan za a duba

buƙatun ɗakin karatu don jerin layi na ɓangare.

Girman Laburare (Taswirar kololuwa)

Babban kololuwar ya kamata ya kasance tsakanin 300-450 bp.
Ya kamata ɗakunan karatu su sami babban kololuwa guda ɗaya, babu gurɓataccen adaftar kuma babu dimers na primer.

Da fatan za a tuntuɓe mu idan samfuranku ba su cika buƙatun kayan farawa ba.

Tsarin Aikin Sabis

shirye-shiryen samfurin

Kula da ingancin ɗakin karatu

Jerin abubuwa

Jerin abubuwa

Nazarin bayanai

Kula da ingancin bayanai

Samfurin QC

Isar da aikin


  • Na baya:
  • Na gaba:

  • Rahoton QC na Laburare

    Ana bayar da rahoto kan ingancin ɗakin karatu kafin a tsara shi, a tantance adadin ɗakin karatu, da kuma raba shi.

     

    Rahoton Takaddun Shaida na Takaddun Shaida (QC)

     

    Tebur 1. Ƙididdiga kan bayanai na jeri.

    Lambar samfurin

    BMKID

    Karatun da ba a tantance ba

    Bayanan da ba a tantance ba (bp)

    Karanta mai tsabta (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6,861,036,000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4,415,360,100

    96.00

    98.95

    93.89

    37.08

    Siffa ta 1. Rarraba inganci a cikin kowane samfurin

    A9

    Hoto na 2. Rarraba abubuwan da ke ciki na asali

    A10

    Hoto na 3. Rarraba abubuwan da aka karanta a cikin bayanan jeri

    A11

     

    sami ƙiyasin farashi

    Rubuta saƙonka a nan ka aika mana da shi

    Aika mana da sakonka: