●Dandamali:Illumina NovaSeq 6000 da NovaSeq X Plus
●Yanayin jerawa:PE150 da PE250
●Kula da inganci na ɗakunan karatu kafin a tsara su
●Takaitaccen bayani QC da isarwa:isar da rahoton QC da bayanai marasa inganci a cikin tsarin fastq bayan cirewa da tace karatun Q30
●Sauƙin amfani da ayyukan tsara ayyuka:Abokin ciniki zai iya zaɓar yin jerin gwano ta hanyar layi, ƙwayar kwarara, ko kuma ta hanyar adadin bayanan da ake buƙata (jerin layin ɓangare).
●Kwarewa mai zurfi akan dandamalin jerin Illumina:tare da dubban ayyukan rufewa tare da nau'ikan halittu daban-daban.
●Isarwa na rahoton QC na jerin abubuwa:tare da ma'aunin inganci, daidaiton bayanai da kuma cikakken aikin aikin tsara jadawalin.
●Tsarin jerin gwanon manya:tare da ɗan gajeren lokacin juyawa.
●Sarrafa Inganci Mai Tsauri: muna aiwatar da ƙa'idodin QC masu tsauri don tabbatar da isar da sakamako mai inganci akai-akai.
| Dandalin | Kwayar Gudawa | Yanayin jerawa | Naúrar | Kimanta fitarwa |
| NovaSeq X | 10B (hanyoyi 8) | PE150 | Hanya ɗaya tilo Titin Bangare | 375Gb / Layi |
| 25B ( hanyoyi 8) | PE150 | Hanya ɗaya tilo Titin Bangare | 1000 Gb/Lane | |
| NovaSeq 6000 | Tantanin kwararar SP (layuka 2) | PE250 | Kwayar Gudawa Hanya ɗaya tilo Titin Bangare | 325-400 M karanta / Lane |
| S4 Flow cell (layuka 4) | PE150 | Kwayar Gudawa Hanya ɗaya tilo Titin Bangare | ~800 Gb / Layi |
| Adadin Bayanai (X) | Mayar da Hankali (qPCR/nM) | Ƙarar girma | |
| Jerin Layi na Bangare
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Jerin Layi | Kowace Layi | ≥ 1.5 nM / Wurin wanka na ɗakin karatu | ≥ 25 μl / Wurin wanka na ɗakin karatu |
Baya ga yawan taro da jimillar adadin, ana kuma buƙatar tsarin kololuwa mai dacewa.
Lura: Jerin layukan laburaren ƙananan bambance-bambance yana buƙatar PhiX ya shigo don tabbatar da ingantaccen kiran tushe.
Muna ba da shawarar a gabatar da ɗakunan karatu da aka riga aka haɗa a matsayin samfura. Idan kuna buƙatar BMKGENE don yin haɗa ɗakunan karatu, da fatan za a duba
buƙatun ɗakin karatu don jerin layi na ɓangare.
Babban kololuwar ya kamata ya kasance tsakanin 300-450 bp.
Ya kamata ɗakunan karatu su sami babban kololuwa guda ɗaya, babu gurɓataccen adaftar kuma babu dimers na primer.
Ana bayar da rahoto kan ingancin ɗakin karatu kafin a tsara shi, a tantance adadin ɗakin karatu, da kuma raba shi.
Tebur 1. Ƙididdiga kan bayanai na jeri.
| Lambar samfurin | BMKID | Karatun da ba a tantance ba | Bayanan da ba a tantance ba (bp) | Karanta mai tsabta (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Siffa ta 1. Rarraba inganci a cikin kowane samfurin
Hoto na 2. Rarraba abubuwan da ke ciki na asali
Hoto na 3. Rarraba abubuwan da aka karanta a cikin bayanan jeri