BMKCloud Log in
条形banner-03

Nā huahana

ʻO Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)

Hāʻawi ʻo ChIP-Seq i ka genome-wide profiling o nā pahuhopu DNA no ka hoʻololi ʻana i ka histone, nā kumu transcription, a me nā protein e pili ana i ka DNA.Hoʻohui ia i ke koho ʻana o ka chromatin immuno-precipitation (ChIP) e hoʻihoʻi i nā paʻakikī protein-DNA kikoʻī, me ka mana o ka sequencing hanauna hou (NGS) no ke kaʻina hana kiʻekiʻe o ka DNA i hoʻihoʻi ʻia.Hoʻohui ʻia, no ka loaʻa ʻana o nā paʻina protein-DNA mai nā cell ola, hiki ke hoʻohālikelike ʻia nā wahi paʻa i nā ʻano cell like ʻole a me nā ʻiʻo, a i ʻole ma lalo o nā kūlana like ʻole.Loaʻa nā noi mai ka hoʻoponopono transcriptional i nā ala hoʻomohala i nā mīkini maʻi a ma waho.

Papahana: Illumina NovaSeq Platform


Nā kikoʻī lawelawe

Bioinformatics

Nā hopena hōʻike

Pono lawelawe

● Papahana: Illumina NovaSeq Platform, PE150

● ʻAno waihona: 100-500bp hoʻokomo i ka waihona DNA (ma muli o ka puʻunaue kiʻekiʻe)

● Hoʻolālā kaʻina hana: Paired-End 150 bp

● Manaʻo i ka hoʻopuka ʻikepili: 6 Gb ʻikepili maka/lapana.

Nā Koina Laʻana

Ka nui DNA: ≥ 70 ng, ka piko nui o 100 a 500 bp

Ka nui laʻana: ≥ 10 μl

OD260/280 = 1.8 a i 2.0 me ka hoʻohaʻahaʻa ʻole a i ʻole ka RNA contamination

Kaʻina hana hoʻokolohua

图片1

Holo Hana Hana

hāʻawi laʻana

Hāʻawi laʻana

Hoʻomākaukau hale waihona puke

Kūkulu hale waihona puke

Ke kaʻina ʻana

Ke kaʻina ʻana

ʻIkepili ʻikepili

ʻIkepili ʻikepili

Mahope o ke kuai ana

Nā lawelawe ma hope o ke kūʻai aku


  • Mua:
  • Aʻe:

  • 表观-01

    1. Puʻunaue hoʻonui kiʻekiʻe

    官网图1

     

    2. MA kahi o ka piko okoa

    官网图2

     

    3.KEGG hōʻike

    官网图3

     

    4. Hoʻohui GO

    官网图4

    kiʻi i kahi ʻōlelo

    E kākau i kāu leka ma aneʻi a hoʻouna mai iā mākou

    E hoʻouna i kāu leka iā mākou: