16S/18S/ITS एम्प्लिकॉन सीक्वेंसिंग-NGS
सेवा सुविधाएँ
● सीक्वेंसिंग प्लेटफॉर्म: इलुमिना नोवासेक।
● अन्य प्रवर्धन लक्ष्यों के अलावा, 16S, 18S और ITS के छोटे क्षेत्रों का प्रवर्धन।
● एम्प्लिकॉन के लचीले विकल्प।
● कई प्रवर्धन लक्ष्यों के साथ पूर्व परियोजना अनुभव।
सेवा के लाभ
●अलगाव-मुक्त:पर्यावरण नमूनों में सूक्ष्मजीवों की संरचना की त्वरित पहचान।
●उच्च संकल्प: पर्यावरण के नमूनों में कम मात्रा में पाए जाने वाले घटकों में।
●व्यापक रूप से लागूविविध सूक्ष्मजीव समुदाय अध्ययन।
●व्यापक जैवसूचना विश्लेषण: डेटाबेस, एनोटेशन, OTU/ASV के संदर्भ में विविध विश्लेषणों के साथ नवीनतम QIIME2 पैकेज (सूक्ष्मजीव पारिस्थितिकी में मात्रात्मक अंतर्दृष्टि)।
●व्यापक विशेषज्ञताप्रतिवर्ष 150 हजार एम्प्लिकॉन सीक्वेंसिंग परियोजनाओं के संचालन के साथ, बीएमकेजीन एक दशक से अधिक का अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टीम, व्यापक सामग्री और उत्कृष्ट बिक्रीोत्तर सहायता प्रदान करता है।
सेवा विनिर्देश
| पुस्तकालय | अनुक्रमण रणनीति | डेटा की अनुशंसा की गई |
| एम्प्लिकॉन | इलुमिना PE250 | 50/100/300K टैग (पढ़ने के जोड़े) |
सेवा आवश्यकताएँ
| सांद्रता (एनजी/µएल) | कुल राशि (एनजी) | आयतन (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● मिट्टी/कीचड़: 1-2 ग्राम
● पशु की आंतों में पाई जाने वाली मात्रा: 0.5-2 ग्राम
● आंतों की सामग्री-कीट: 0.1-0.25 ग्राम
● पौधे की सतह (समृद्ध तलछट): 0.1-0.5 ग्राम
● किण्वन घोल में समृद्ध तलछट): 0.1-0.5 ग्राम
● मल (बड़े जानवरों का): 0.5-2 ग्राम
● चूहे का मल: 3-5 दाने
● फुफ्फुसीय एल्वियोलर लैवेज द्रव: फ़िल्टर पेपर
● योनि स्वाब: 5-6 स्वाब
● त्वचा/जननांग स्वाब/लार/मुंह के कोमल ऊतक/ग्रसनी स्वाब/मलाशय स्वाब: 2-3 स्वाब
● सतह पर मौजूद सूक्ष्मजीव: फ़िल्टर पेपर
● जल निकाय/वायु/जैविक परत: फ़िल्टर पेपर
● एंडोफाइट्स: 1-2 ग्राम
● दांतों पर जमी प्लाक: 0.5-1 ग्राम
सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री पश्चात सेवाएं
इसमें निम्नलिखित विश्लेषण शामिल है:
- कच्चे डेटा की गुणवत्ता नियंत्रण
- OTU क्लस्टरिंग / डी-नॉइज़ (ASV)
- ओटीयू एनोटेशन
- अल्फा विविधता विश्लेषण: शैनन, सिम्पसन और एसीई सहित कई सूचकांक।
- बीटा विविधता विश्लेषण
- अंतर-समूह विश्लेषण
- सहसंबंध विश्लेषण: पर्यावरणीय कारकों और बाहरी संरचना एवं विविधता के बीच
- 16S कार्यात्मक जीन भविष्यवाणी
वर्गीकरण वितरण का हिस्टोग्राम
वर्गीकरण संबंधी प्रचुरता क्लस्टरिंग हीट मैप
अल्फा विविधता विश्लेषण: विरलीकरण वक्र
बीटा विविधता विश्लेषण: एनएमडीएस
अंतरसमूह विश्लेषण: एलईएफएसई बायोमार्कर की खोज
बीएमकेजीन की इलुमिना के साथ एम्प्लिकॉन सीक्वेंसिंग सेवाओं द्वारा सुगम बनाई गई प्रगति का पता लगाने के लिए प्रकाशनों का एक क्यूरेटेड संग्रह देखें।
डोंग, सी. एट अल. (2022) 'यूकोमिया उल्मोइड्स में राइजोस्फीयर मिट्टी और छाल माइक्रोबायोटा की असेंबली, कोर माइक्रोबायोटा और फ़ंक्शन', फ्रंटियर्स इन माइक्रोबायोलॉजी, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL.
ली, वाई. एट अल. (2023) 'चूहों में गार्डनेरेला वैजिनैलिस-प्रेरित बैक्टीरियल वैजिनोसिस के उपचार के लिए सिंथेटिक बैक्टीरियल कंसोर्टिया प्रत्यारोपण', माइक्रोबायोम, 11(1), पृ. 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
यांग, जे., फू, वाई. और लियू, एच. (2022) 'ग्राउंड-बेस्ड क्लोज्ड बायोरिजेनरेटिव लाइफ सपोर्ट एक्सपेरिमेंट "लूनर पैलेस 365" के दौरान एकत्रित वायु धूल के माइक्रोबायोम', एनवायरनमेंटल माइक्रोबायोम्स, 17(1), पृ. 1–20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
यिन, एस. एट अल. (2022) 'फीडस्टॉक-निर्भर नाइट्रोजन परिवर्तन से संबंधित कार्यात्मक जीन की प्रचुरता कंपोस्टिंग में नाइट्रोजन हानि को नियंत्रित करती है', बायोसोर्स टेक्नोलॉजी, 361, पृ. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
