16S/18S/ITS एम्प्लिकॉन अनुक्रमण-एनजीएस
सेवा सुविधाएँ
● अनुक्रमण प्लेटफ़ॉर्म: इल्लुमिना नोवासेक.
● अन्य प्रवर्धन लक्ष्यों के अलावा 16एस, 18एस और आईटीएस के लघु क्षेत्रों का प्रवर्धन।
● एम्प्लीकॉन के लचीले विकल्प।
● एकाधिक प्रवर्धन लक्ष्यों के साथ पिछला परियोजना अनुभव।
सेवा लाभ
●अलगाव-मुक्त:पर्यावरणीय नमूनों में सूक्ष्मजीवी संरचना की त्वरित पहचान।
●उच्च संकल्प: पर्यावरण नमूनों में कम प्रचुर मात्रा में घटकों में।
●व्यापक रूप से लागू: विविध सूक्ष्मजीव समुदाय अध्ययन।
●व्यापक जैव सूचना विश्लेषण: नवीनतम QIIME2 पैकेज (माइक्रोबियल पारिस्थितिकी में मात्रात्मक अंतर्दृष्टि) डेटाबेस, एनोटेशन, OTU/ASV के संदर्भ में विविध विश्लेषणों के साथ।
●व्यापक विशेषज्ञता: प्रतिवर्ष 150 हजार एम्प्लिकॉन अनुक्रमण परियोजनाओं के साथ, BMKGENE एक दशक से अधिक का अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टीम, व्यापक सामग्री और उत्कृष्ट बिक्री के बाद का समर्थन लाता है।
सेवा विनिर्देश
| पुस्तकालय | अनुक्रमण रणनीति | अनुशंसित डेटा |
| एम्प्लिकॉन | इल्लुमिना PE250 | 50/100/300K टैग (पढ़ें जोड़े) |
सेवा आवश्यकताएँ
| सांद्रता (एनजी/µL) | कुल राशि (एनजी) | आयतन (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● मिट्टी/कीचड़: 1-2 ग्राम
● आंत्र सामग्री-पशु: 0.5-2 ग्राम
● आंत्र सामग्री-कीट: 0.1-0.25 ग्राम
● पौधे की सतह (समृद्ध तलछट): 0.1-0.5 ग्राम
● किण्वन शोरबा समृद्ध तलछट): 0.1-0.5 ग्राम
● मल (बड़े जानवर): 0.5-2 ग्राम
● मल (चूहे का): 3-5 दाने
● फुफ्फुसीय एल्वियोलर लेवेज द्रव: फिल्टर पेपर
● योनि स्वैब: 5-6 स्वैब
● त्वचा/जननांग स्वैब/लार/मौखिक कोमल ऊतक/ग्रसनी स्वैब/गुदा स्वैब: 2-3 स्वैब
● सतही सूक्ष्मजीव: फिल्टर पेपर
● जल निकाय/वायु/बायोफिल्म: फिल्टर पेपर
● एंडोफाइट्स: 1-2 ग्राम
● दंत पट्टिका: 0.5-1 ग्राम
सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री के बाद की सेवाएं
इसमें निम्नलिखित विश्लेषण शामिल है:
- कच्चे डेटा की गुणवत्ता नियंत्रण
- OTU क्लस्टरिंग / डी-शोर (ASV)
- OTU एनोटेशन
- अल्फा विविधता विश्लेषण: शैनन, सिम्पसन और एसीई सहित कई सूचकांक।
- बीटा विविधता विश्लेषण
- अंतर-समूह विश्लेषण
- सहसंबंध विश्लेषण: पर्यावरणीय कारकों और OUT संरचना और विविधता के बीच
- 16S कार्यात्मक जीन भविष्यवाणी
वर्गीकरण वितरण का हिस्टोग्राम
टैक्सोनोमिक बहुतायत क्लस्टरिंग हीट मैप
अल्फा विविधता विश्लेषण: विरलन वक्र
बीटा विविधता विश्लेषण: एनएमडीएस
अंतर-समूह विश्लेषण: LEFSE बायोमार्कर की खोज
प्रकाशनों के एक संग्रह के माध्यम से इल्लुमिना के साथ BMKGene की एम्प्लिकॉन अनुक्रमण सेवाओं द्वारा सुगम की गई प्रगति का अन्वेषण करें।
डोंग, सी. एट अल. (2022) 'यूकोमिया उल्मोइड्स में राइज़ोस्फीयर मिट्टी और छाल माइक्रोबायोटा की असेंबली, कोर माइक्रोबायोटा और कार्य', फ्रंटियर्स इन माइक्रोबायोलॉजी, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL.
ली, वाई. एट अल. (2023) 'चूहों में गार्डनेरेला वेजिनेलिस-प्रेरित बैक्टीरियल वेजिनोसिस के उपचार के लिए सिंथेटिक बैक्टीरियल कंसोर्टिया प्रत्यारोपण', माइक्रोबायोम, 11(1), पृष्ठ 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
यांग, जे., फू, वाई. और लियू, एच. (2022) 'भूमि-आधारित बंद बायोरेजेनरेटिव जीवन समर्थन प्रयोग "लूनर पैलेस 365" के दौरान एकत्रित वायु धूल के माइक्रोबायोम', पर्यावरण माइक्रोबायोम, 17(1), पृ. 1–20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
यिन, एस. एट अल. (2022) 'नाइट्रोजन परिवर्तन से संबंधित कार्यात्मक जीनों की फीडस्टॉक-निर्भर बहुतायत ने खाद बनाने में नाइट्रोजन की हानि को नियंत्रित किया', बायोरिसोर्स टेक्नोलॉजी, 361, पृष्ठ 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
