BMKCloud Log in
条形बैनर-03

उत्पादों

16एस/18एस/आईटीएस एम्प्लिकॉन सीक्वेंसिंग-पैकबायो

16एस और 18एस आरआरएनए पर सबयूनिट जिसमें अत्यधिक संरक्षित और हाइपर-वेरिएबल दोनों क्षेत्र शामिल हैं, प्रोकैरियोटिक और यूकेरियोटिक जीवों की पहचान के लिए एक आदर्श आणविक फिंगरप्रिंट है।अनुक्रमण का लाभ उठाते हुए, इन एम्प्लीकॉन्स को संरक्षित भागों के आधार पर लक्षित किया जा सकता है और माइक्रोबियल विविधता विश्लेषण, वर्गीकरण, फाइलोजेनी आदि को कवर करने वाले अध्ययनों में योगदान देने वाले माइक्रोबियल पहचान के लिए हाइपर-वेरिएबल क्षेत्रों को पूरी तरह से चित्रित किया जा सकता है। एकल-अणु वास्तविक समय (एसएमआरटी) ) PacBio प्लेटफ़ॉर्म की अनुक्रमण अत्यधिक सटीक लंबी रीडिंग प्राप्त करने में सक्षम बनाता है, जो पूर्ण-लंबाई एम्प्लिकॉन (लगभग 1.5 Kb) को कवर कर सकता है।आनुवंशिक क्षेत्र के व्यापक दृष्टिकोण ने बैक्टीरिया या कवक समुदाय में प्रजातियों के एनोटेशन में संकल्प को काफी बढ़ाया है।

प्लैटफ़ॉर्म:पैकबियो सीक्वल II


सेवा विवरण

डेमो परिणाम

मामले का अध्ययन

सेवा लाभ

1

● लॉन्ग-रीड्स से 16S/18S/ITS के पूर्ण-लंबाई अनुक्रम का पता चलता है

● PacBio CCS मोड अनुक्रमण के साथ अत्यधिक सटीक आधार कॉलिंग

● ओटीयू/एएसवी एनोटेशन में प्रजाति-स्तरीय रिज़ॉल्यूशन

● नवीनतम QIIME2 डेटाबेस, एनोटेशन, OTU/ASV के संदर्भ में विविध विश्लेषणों के साथ प्रवाह का विश्लेषण कर रहा है।

● विविध माइक्रोबियल समुदाय अध्ययनों पर लागू

● बीएमके के पास मिट्टी, पानी, गैस, कीचड़, मल, आंत, त्वचा, किण्वन शोरबा, कीड़े, पौधे आदि को कवर करने वाले प्रति वर्ष 100,000 से अधिक नमूनों का व्यापक अनुभव है।

● BMKCloud ने 45 वैयक्तिकृत विश्लेषण टूल युक्त डेटा व्याख्या की सुविधा प्रदान की

सेवा विशिष्टताएँ

अनुक्रमणप्लैटफ़ॉर्म

पुस्तकालय

अनुशंसित डेटा

बदलाव का समय

पैकबियो सीक्वल II

SMRT-घंटी

5K/10K/20K टैग

44 कार्य दिवस

जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण करता है

● कच्चा डेटा गुणवत्ता नियंत्रण

● ओटीयू क्लस्टरिंग/डी-शोर (एएसवी)

● ओटीयू एनोटेशन

● अल्फ़ा विविधता

● बीटा विविधता

● अंतर-समूह विश्लेषण

● प्रायोगिक कारकों के विरुद्ध एसोसिएशन विश्लेषण

● फ़ंक्शन जीन भविष्यवाणी

16sपैकबियो

नमूना आवश्यकताएँ और वितरण

नमूना आवश्यकताएँ:

के लिएडीएनए अर्क:

नमूना प्रकार

मात्रा

एकाग्रता

पवित्रता

डीएनए अर्क

> 1 μg

> 20 एनजी/μl

ओडी260/280= 1.6-2.5

पर्यावरणीय नमूनों के लिए:

नमूना प्रकार

अनुशंसित नमूनाकरण प्रक्रिया

मिट्टी

नमूना राशि: लगभग.5 ग्राम;शेष सूखे पदार्थ को सतह से हटाने की जरूरत है;बड़े टुकड़ों को पीसें और 2 मिमी फिल्टर से गुजारें;आरक्षण के लिए बाँझ ईपी-ट्यूब या साइरोट्यूब में विभाज्य नमूने।

मल

नमूना राशि: लगभग.5 ग्राम;आरक्षण के लिए बाँझ ईपी-ट्यूब या क्रायोट्यूब में नमूने एकत्र करें और उन्हें अलग करें।

आंत्र सामग्री

नमूनों को सड़न रोकने वाली स्थिति में संसाधित करने की आवश्यकता है।एकत्रित ऊतक को पीबीएस से धोएं;पीबीएस को सेंट्रीफ्यूज करें और अवक्षेपक को ईपी-ट्यूबों में इकट्ठा करें।

कीचड़

नमूना राशि: लगभग.5 ग्राम;आरक्षण के लिए बाँझ ईपी-ट्यूब या क्रायोट्यूब में कीचड़ का नमूना एकत्र करें और उसे अलग करें

जल निकाय

सीमित मात्रा में माइक्रोबियल वाले नमूने के लिए, जैसे नल का पानी, कुएं का पानी, आदि, कम से कम 1 एल पानी इकट्ठा करें और झिल्ली पर माइक्रोबियल को समृद्ध करने के लिए 0.22 माइक्रोन फिल्टर से गुजारें।झिल्ली को बाँझ ट्यूब में संग्रहित करें।

त्वचा

त्वचा की सतह को स्टेराइल कॉटन स्वाब या सर्जिकल ब्लेड से सावधानीपूर्वक खुरचें और इसे स्टेराइल ट्यूब में रखें।

अनुशंसित नमूना वितरण

नमूनों को तरल नाइट्रोजन में 3-4 घंटे के लिए फ्रीज करें और दीर्घकालिक आरक्षण के लिए तरल नाइट्रोजन या -80 डिग्री में संग्रहित करें।सूखी बर्फ के साथ नमूना शिपिंग आवश्यक है।

सेवा कार्य प्रवाह

नमूना वितरण

नमूना वितरण

पुस्तकालय की तैयारी

पुस्तकालय निर्माण

अनुक्रमण

अनुक्रमण

डेटा विश्लेषण

डेटा विश्लेषण

बिक्री के बाद सेवाएँ

बिक्री के बाद की सेवाएँ


  • पहले का:
  • अगला:

  • 1.V3+V4(इलुमिना)-आधारित माइक्रोबियल समुदाय प्रोफाइलिंग बनाम पूर्ण-लंबाई (PacBio)-आधारित प्रोफाइलिंग की एनोटेशन दर।
    (आँकड़ों के लिए यादृच्छिक रूप से चुनी गई 30 परियोजनाओं का डेटा लागू किया गया था)

    3

    2. विभिन्न नमूना प्रकारों में प्रजाति-स्तर पर पूर्ण-लंबाई एम्प्लिकॉन अनुक्रमण की एनोटेशन दर

    4

    3.प्रजाति वितरण

    5
    4.फाइलोजेनेटिक वृक्ष

    6

    बीएमके मामला

    आर्सेनिक के संपर्क से आंतों की बाधा को नुकसान पहुंचता है और इसके परिणामस्वरूप आंत-यकृत अक्ष सक्रिय हो जाता है, जिससे बत्तखों में यकृत में सूजन और पाइरोप्टोसिस हो जाता है।

    प्रकाशित:संपूर्ण पर्यावरण का विज्ञान,2021

    अनुक्रमण रणनीति:

    नमूने: नियंत्रण बनाम 8 मिलीग्राम/किग्रा एटीओ उजागर समूह
    अनुक्रमण डेटा उपज: कुल 102,583 कच्चे सीसीएस अनुक्रम
    नियंत्रण: 54,518 ± 747 प्रभावी सीसीएस
    एटीओ-एक्सपोज़्ड: 45,050 ± 1675 प्रभावी सीसीएस

    मुख्य परिणाम

    अल्फा विविधता:एटीओ एक्सपोज़र ने बत्तखों में आंतों की माइक्रोबियल समृद्धि और विविधता को महत्वपूर्ण रूप से बदल दिया।

    मेटास्टेट्स विश्लेषण:
    फ़ाइलम स्तर में: 2 जीवाणु फ़ाइला केवल नियंत्रण समूहों में पाए जाते हैं
    जीनस स्तर पर: 6 जेनेरा सापेक्ष बहुतायत में काफी भिन्न पाए गए
    प्रजातियों के स्तर में: कुल मिलाकर 36 प्रजातियों की पहचान की गई, जिनमें से 6 प्रजातियों की सापेक्ष बहुतायत में काफी भिन्नता थी

    संदर्भ

    थिंगहोम, एलबी, एट अल।"टाइप 2 मधुमेह वाले और बिना टाइप 2 मधुमेह वाले मोटे व्यक्तियों में अलग-अलग आंत माइक्रोबियल कार्यात्मक क्षमता और संरचना दिखाई देती है।"सेल होस्ट और माइक्रोब26.2(2019).

    एक कहावत कहना

    अपना संदेश यहां लिखें और हमें भेजें

    अपना संदेश हमें भेजें: