16S/18S/ITS एम्प्लिकॉन सीक्वेंसिंग-पैकबायो
सेवा सुविधाएँ
● अनुक्रमण प्लेटफ़ॉर्म: पैकबायो रेवियो
● अनुक्रमण मोड: CCS (HiFi रीड्स)
● हाईफाई SMRT बेल लाइब्रेरी तैयार करने से पहले एम्प्लीकॉन्स के टेंडम लिंकिंग के बाद लक्ष्य क्षेत्र का प्रवर्धन
सेवा लाभ
●उच्च वर्गीकरण संकल्प: टीहान लघु-एम्प्लिकॉन अनुक्रमण,प्रजातियों के स्तर पर उच्च OTU वर्गीकरण दर को सक्षम करना।
●अत्यधिक सटीक बेस कॉलिंग: PacBio CCS मोड अनुक्रमण (HiFi रीड्स)।
●अलगाव-मुक्त: पर्यावरण नमूनों में सूक्ष्मजीवी संरचना की तीव्र पहचान।
●व्यापक रूप से लागू: विविध सूक्ष्मजीव समुदाय अध्ययन।
●व्यापक जैव सूचना विश्लेषण: नवीनतम QIIME2 पैकेज (माइक्रोबियल पारिस्थितिकी में मात्रात्मक अंतर्दृष्टि) डेटाबेस, एनोटेशन, OTU/ASV के संदर्भ में विविध विश्लेषणों के साथ।
●व्यापक विशेषज्ञता: प्रतिवर्ष हजारों एम्प्लिकॉन अनुक्रमण परियोजनाओं के साथ, BMKGENE एक दशक से अधिक का अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टीम, व्यापक सामग्री और उत्कृष्ट बिक्री के बाद का समर्थन लाता है।
सेवा विनिर्देश
| पुस्तकालय | अनुक्रमण रणनीति | अनुशंसित डेटा |
| एम्प्लिकॉन | पैकबायो रेवियो | 10/30/50 K टैग (CCS) |
नमूना आवश्यकताएँ
| सांद्रता (एनजी/µL) | कुल मात्रा (µg) | आयतन (µL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
अनुशंसित नमूना वितरण
नमूनों को तरल नाइट्रोजन में 3-4 घंटे के लिए जमाएँ और तरल नाइट्रोजन या -80 डिग्री पर लंबे समय तक सुरक्षित रखें। नमूनों को सूखी बर्फ के साथ भेजना अनिवार्य है।
सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री के बाद की सेवाएं
इसमें निम्नलिखित विश्लेषण शामिल है:
●कच्चे डेटा की गुणवत्ता नियंत्रण
●OTU क्लस्टरिंग/डी-शोर (ASV)
●OTU एनोटेशन
●अल्फा विविधता विश्लेषण: शैनन, सिम्पसन और एसीई सहित कई सूचकांक।
●बीटा विविधता विश्लेषण
●अंतर-समूह विश्लेषण
●सहसंबंध विश्लेषण: पर्यावरणीय कारकों और OUT संरचना और विविधता के बीच
●16S कार्यात्मक जीन भविष्यवाणी
वर्गीकरण वितरण का हिस्टोग्राम
सामुदायिक वितरण फ़ाइलोजेनेटिक वृक्ष
अल्फा विविधता विश्लेषण: ACE
अनुक्रमणिका
बीटा विविधता विश्लेषण: PCoA
अंतर-समूह विश्लेषण: ANOVA
प्रकाशनों के एक संग्रह के माध्यम से पैकबायो के साथ BMKGene की एम्प्लिकॉन अनुक्रमण सेवाओं द्वारा सुगम की गई प्रगति का अन्वेषण करें।
गाओ, एक्स. और वांग, एच. (2023) 'अल्पाइन घास के मैदान पर दो बढ़ते चरणों के साथ अल्पाइन मेरिनो भेड़ में विभिन्न फेनोलॉजी (रीग्रीन बनाम ग्रासी) के अनुकूलन के दौरान रुमेन बैक्टीरियल प्रोफाइल और कार्यों का तुलनात्मक विश्लेषण', किण्वन, 9(1), पृष्ठ 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
ली, एस. एट अल. (2023) 'कल्चरोमिक्स-आधारित मेटाजीनोमिक्स और उच्च-रिज़ॉल्यूशन विश्लेषण का उपयोग करके रेगिस्तानी मिट्टी में माइक्रोबियल डार्क मैटर को कैप्चर करना', एनपीजे बायोफिल्म्स एंड माइक्रोबायोम्स 2023 9:1, 9(1), पृष्ठ 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
म्यू, एल. एट अल. (2022) 'अल्फाल्फा, चावल के भूसे और गेहूं के चोकर से तैयार मिश्रित साइलेज की किण्वन विशेषताओं, जीवाणु विविधता और एरोबिक स्थिरता पर फैटी एसिड लवण का प्रभाव', जर्नल ऑफ द साइंस ऑफ फूड एंड एग्रीकल्चर, 102(4), पृ. 1475–1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
यांग, जे. एट अल. (2023) 'वयस्क ज़ेब्राफ़िश में ऑक्साज़ोलोन-प्रेरित आंतों के ऑक्सीडेटिव तनाव में सोनचस ब्रैकियोटस डीसी के अर्क के एंटीऑक्सीडेंट प्रभावों में ऑक्सीडेटिव तनाव बायोमार्कर और आंत माइक्रोबायोटा के बीच बातचीत', एंटीऑक्सीडेंट्स 2023, वॉल्यूम 12, पृष्ठ 192, 12(1), पृष्ठ 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
