16S/18S/ITS एम्प्लिकॉन सीक्वेंसिंग-पैकबियो
सेवा सुविधाएँ
● सीक्वेंसिंग प्लेटफॉर्म: PacBio Revio
● अनुक्रमण मोड: सीसीएस (हाई-फाई रीड्स)
● हाई-फाई एसएमआरटी बेल लाइब्रेरी तैयार करने से पहले लक्षित क्षेत्र का प्रवर्धन और उसके बाद एम्प्लिकॉन का टैंडम लिंकिंग।
सेवा के लाभ
●उच्च वर्गीकरण संबंधी संकल्प: Tहान शॉर्ट-एम्प्लिकॉन अनुक्रमण,इससे प्रजाति स्तर पर उच्च OTU वर्गीकरण दरें संभव हो पाती हैं।
●अत्यधिक सटीक बेस कॉलिंग: पैकबियो सीसीएस मोड सीक्वेंसिंग (हाई-फाई रीड्स)।
●अलगाव-मुक्तपर्यावरण नमूनों में सूक्ष्मजीवों की संरचना की त्वरित पहचान।
●व्यापक रूप से लागूविविध सूक्ष्मजीव समुदाय अध्ययन।
●व्यापक जैवसूचना विश्लेषण: डेटाबेस, एनोटेशन, OTU/ASV के संदर्भ में विविध विश्लेषणों के साथ नवीनतम QIIME2 पैकेज (सूक्ष्मजीव पारिस्थितिकी में मात्रात्मक अंतर्दृष्टि)।
●व्यापक विशेषज्ञताप्रतिवर्ष हजारों एम्प्लिकॉन सीक्वेंसिंग परियोजनाओं के संचालन के साथ, बीएमकेजीन एक दशक से अधिक का अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टीम, व्यापक सामग्री और उत्कृष्ट बिक्रीोत्तर सहायता प्रदान करता है।
सेवा विनिर्देश
| पुस्तकालय | अनुक्रमण रणनीति | डेटा की अनुशंसा की गई |
| एम्प्लिकॉन | पैकबियो रेवियो | 10/30/50 के टैग (सीसीएस) |
नमूना आवश्यकताएँ
| सांद्रता (एनजी/µएल) | कुल मात्रा (µg) | आयतन (µL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
अनुशंसित नमूना वितरण
नमूनों को 3-4 घंटे के लिए तरल नाइट्रोजन में जमा दें और दीर्घकालिक संरक्षण के लिए तरल नाइट्रोजन या -80 डिग्री सेल्सियस तापमान पर संग्रहित करें। नमूनों को ड्राई आइस के साथ भेजना आवश्यक है।
सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री पश्चात सेवाएं
इसमें निम्नलिखित विश्लेषण शामिल है:
● कच्चे डेटा की गुणवत्ता नियंत्रण
●OTU क्लस्टरिंग/डी-नॉइज़ (ASV)
●OTU एनोटेशन
●अल्फा विविधता विश्लेषण: शैनन, सिम्पसन और एसीई सहित कई सूचकांक।
●बीटा विविधता विश्लेषण
● अंतर-समूह विश्लेषण
● सहसंबंध विश्लेषण: पर्यावरणीय कारकों और बाहरी संरचना एवं विविधता के बीच
●16S कार्यात्मक जीन भविष्यवाणी
वर्गीकरण वितरण का हिस्टोग्राम
समुदाय वितरण का फाइलोजेनेटिक वृक्ष
अल्फा विविधता विश्लेषण: एसीई
अनुक्रमणिका
बीटा विविधता विश्लेषण: पीसीओए
अंतरसमूह विश्लेषण: एनोवा
बीएमकेजीन की एम्प्लिकॉन सीक्वेंसिंग सेवाओं द्वारा सुगम बनाई गई प्रगति का पता लगाने के लिए, पैकबियो के साथ प्रकाशनों के एक क्यूरेटेड संग्रह का उपयोग करें।
गाओ, एक्स. और वांग, एच. (2023) 'अल्पाइन घास के मैदान पर दो विकास चरणों के साथ अल्पाइन मेरिनो भेड़ में विभिन्न फेनोलॉजी (रीग्रीन बनाम घास) के अनुकूलन के दौरान रूमेन बैक्टीरियल प्रोफाइल और कार्यों का तुलनात्मक विश्लेषण', किण्वन, 9(1), पृ. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
ली, एस. एट अल. (2023) 'कल्चरॉमिक्स-आधारित मेटाजेनोमिक्स और उच्च-रिज़ॉल्यूशन विश्लेषण का उपयोग करके रेगिस्तानी मिट्टी में माइक्रोबियल डार्क मैटर को कैप्चर करना', एनपीजे बायोफिल्म्स और माइक्रोबायोम्स 2023 9:1, 9(1), पृ. 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
मु, एल. एट अल. (2022) 'अल्फाल्फा, चावल के भूसे और गेहूं के चोकर से तैयार मिश्रित साइलेज की किण्वन विशेषताओं, जीवाणु विविधता और एरोबिक स्थिरता पर वसा अम्ल लवणों के प्रभाव', जर्नल ऑफ द साइंस ऑफ फूड एंड एग्रीकल्चर, 102(4), पृ. 1475–1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
यांग, जे. एट अल. (2023) 'वयस्क ज़ेब्राफ़िश में ऑक्साज़ोलोन-प्रेरित आंतों के ऑक्सीडेटिव तनाव में सोनचस ब्रैचियोटस डीसी से अर्क के एंटीऑक्सीडेंट प्रभावों में ऑक्सीडेटिव तनाव बायोमार्कर और आंत माइक्रोबायोटा के बीच बातचीत', एंटीऑक्सीडेंट्स 2023, वॉल्यूम 12, पृष्ठ 192, 12(1), पृ. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
