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PacBio-पूर्ण-लंबाई प्रतिलेख (गैर-संदर्भ)
एम्प्लिकॉन (16S/18S/ITS) प्लेटफॉर्म को माइक्रोबियल विविधता परियोजना विश्लेषण में वर्षों के अनुभव के साथ विकसित किया गया है, जिसमें मानकीकृत बुनियादी विश्लेषण और व्यक्तिगत विश्लेषण शामिल हैं: बुनियादी विश्लेषण वर्तमान माइक्रोबियल अनुसंधान की मुख्यधारा विश्लेषण सामग्री को कवर करता है, विश्लेषण सामग्री समृद्ध और व्यापक है, और विश्लेषण के परिणाम परियोजना रिपोर्ट के रूप में प्रस्तुत किए जाते हैं;व्यक्तिगत विश्लेषण की सामग्री विविध है।नमूने का चयन किया जा सकता है और व्यक्तिगत आवश्यकताओं को महसूस करने के लिए, बुनियादी विश्लेषण रिपोर्ट और अनुसंधान उद्देश्य के अनुसार मापदंडों को लचीले ढंग से सेट किया जा सकता है।विंडोज ऑपरेटिंग सिस्टम, सरल और तेज।
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PacBio-पूर्ण-लंबाई प्रतिलेख (गैर-संदर्भ)
पैसिफिक बायोसाइंसेज (PacBio) आइसोफॉर्म अनुक्रमण डेटा को इनपुट के रूप में लेते हुए, यह ऐप पूर्ण-लंबाई प्रतिलेख अनुक्रम (असेंबली के बिना) की पहचान करने में सक्षम है।संदर्भ जीनोम के विरुद्ध पूर्ण-लंबाई अनुक्रमों का मानचित्रण करके, ज्ञात जीनों, प्रतिलेखों, कोडिंग क्षेत्रों आदि द्वारा प्रतिलेखों को अनुकूलित किया जा सकता है। इस मामले में, वैकल्पिक स्प्लिसिंग आदि जैसे एमआरएनए संरचनाओं की अधिक सटीक पहचान प्राप्त की जा सकती है।एनजीएस ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण डेटा के साथ संयुक्त विश्लेषण ट्रांसक्रिप्ट स्तर पर अभिव्यक्ति में अधिक व्यापक एनोटेशन और अधिक सटीक मात्रा का ठहराव सक्षम करता है, जो बड़े पैमाने पर डाउनस्ट्रीम अंतर अभिव्यक्ति और कार्यात्मक विश्लेषण को लाभान्वित करता है।
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उपकरणकिटें
बीएमकेक्लाउड जीनोमिक कार्यक्रमों के लिए वन-स्टॉप समाधान प्रदान करने वाला एक प्रमुख जैव सूचनात्मक मंच है, जिस पर चिकित्सा, कृषि, पर्यावरण आदि सहित विभिन्न क्षेत्रों में शोधकर्ताओं द्वारा व्यापक रूप से भरोसा किया जाता है। बीएमकेक्लाउड जैव सूचनात्मक विश्लेषण प्लेटफॉर्म और उपकरणों सहित एकीकृत, विश्वसनीय और कुशल सेवाएं प्रदान करने के लिए प्रतिबद्ध है। , कंप्यूटिंग संसाधन, सार्वजनिक डेटाबेस, जैव सूचनात्मक ऑनलाइन पाठ्यक्रम, आदि। बीएमकेक्लाउड में जीन एनोटेशन, विकासवादी आनुवंशिक उपकरण, एनसीआरएनए, डेटा गुणवत्ता नियंत्रण, असेंबली, संरेखण, डेटा निष्कर्षण, उत्परिवर्तन, सांख्यिकी, आंकड़ा जनरेटर, अनुक्रम सहित विभिन्न अक्सर उपयोग किए जाने वाले जैव सूचनात्मक उपकरण हैं। विश्लेषण, आदि
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छोटा आरएनए
छोटे आरएनए लघु गैर-कोडिंग आरएनए के प्रकार होते हैं जिनकी औसत लंबाई 18-30 एनटी होती है, जिसमें miRNA, siRNA और piRNA शामिल हैं।इन छोटे आरएनए को व्यापक रूप से विभिन्न जैविक प्रक्रियाओं जैसे एमआरएनए गिरावट, अनुवाद अवरोध, हेटरोक्रोमैटिन गठन इत्यादि में शामिल होने की सूचना दी गई है। पशु/पौधे विकास, बीमारी, वायरस इत्यादि पर अध्ययन में स्मॉलआरएनए अनुक्रमण विश्लेषण व्यापक रूप से लागू किया गया है। छोटा आरएनए अनुक्रमण विश्लेषण मंच में मानक विश्लेषण और उन्नत डेटा खनन शामिल हैं।RNA-seq डेटा के आधार पर, मानक विश्लेषण miRNA पहचान और भविष्यवाणी, miRNA लक्ष्य जीन भविष्यवाणी, एनोटेशन और अभिव्यक्ति विश्लेषण प्राप्त कर सकता है।उन्नत विश्लेषण अनुकूलित miRNA खोज और निष्कर्षण, वेन आरेख पीढ़ी, miRNA और लक्ष्य जीन नेटवर्क निर्माण को सक्षम बनाता है।
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एनजीएस-डब्ल्यूजीएस (इलुमिना/बीजीआई)
एनजीएस-डब्ल्यूजीएस एक संपूर्ण जीनोम री-सीक्वेंसिंग विश्लेषण प्लेटफॉर्म है, जिसे बायोमार्कर टेक्नोलॉजीज में समृद्ध अनुभव के आधार पर विकसित किया गया है।यह उपयोग में आसान प्लेटफॉर्म केवल कुछ बुनियादी पैरामीटर सेट करके एक एकीकृत विश्लेषण कार्यप्रवाह प्रस्तुत करने की अनुमति देता है, जो इलुमिना प्लेटफॉर्म और बीजीआई अनुक्रमण प्लेटफॉर्म दोनों से उत्पन्न डीएनए अनुक्रमण डेटा के लिए फिट बैठता है।यह प्लेटफॉर्म उच्च प्रदर्शन कंप्यूटिंग सर्वर पर तैनात है, जो बहुत ही सीमित समय में अत्यधिक कुशल डेटा विश्लेषण को सशक्त बनाता है।वैयक्तिकृत डेटा माइनिंग मानक विश्लेषण के आधार पर उपलब्ध है, जिसमें उत्परिवर्तित जीन क्वेरी, पीसीआर प्राइमर डिज़ाइन आदि शामिल हैं।
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एमआरएनए (संदर्भ)
ट्रांसक्रिप्टोम जीनोमिक आनुवंशिक जानकारी और जैविक क्रिया के प्रोटिओम के बीच की कड़ी है।ट्रांसक्रिप्शनल लेवल रेगुलेशन जीवों का सबसे महत्वपूर्ण और सबसे व्यापक रूप से अध्ययन किया जाने वाला रेगुलेशन मोड है।ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण किसी भी समय या किसी भी स्थिति में, एक एकल न्यूक्लियोटाइड के लिए सटीक संकल्प के साथ प्रतिलेख को अनुक्रमित कर सकता है। यह गतिशील रूप से जीन प्रतिलेखन के स्तर को प्रतिबिंबित कर सकता है, साथ ही दुर्लभ और सामान्य प्रतिलेखों की पहचान और मात्रा निर्धारित कर सकता है, और संरचनात्मक जानकारी प्रदान कर सकता है नमूना विशिष्ट टेप।
वर्तमान में, ट्रांसक्रिपटॉम अनुक्रमण तकनीक का व्यापक रूप से कृषि विज्ञान, चिकित्सा और अन्य अनुसंधान क्षेत्रों में उपयोग किया गया है, जिसमें पशु और पौधों के विकास विनियमन, पर्यावरण अनुकूलन, प्रतिरक्षा संपर्क, जीन स्थानीयकरण, प्रजातियों के आनुवंशिक विकास और ट्यूमर और आनुवंशिक रोग का पता लगाना शामिल है।
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मेटागेनॉमिक्स (एनजीएस)
यह विश्लेषण मंच वर्षों के अनुभव के आधार पर शॉटगन मेटागेनोमिक डेटा विश्लेषण के लिए डिज़ाइन किया गया है।इसमें डेटा प्रोसेसिंग, प्रजाति-स्तर के अध्ययन, जीन फ़ंक्शन-स्तरीय अध्ययन, मेटागेनोम बिनिंग आदि सहित सामान्य रूप से आवश्यक मेटागेनॉमिक्स विश्लेषण के विभिन्न एकीकृत वर्कफ़्लो शामिल हैं। इसके अलावा, अनुकूलित डेटा माइनिंग टूल मानक विश्लेषण वर्कफ़्लो पर उपलब्ध हैं, जिसमें जीन और प्रजाति क्वेरी शामिल हैं। , पैरामीटर सेटिंग, व्यक्तिगत आंकड़ा उत्पन्न करना, आदि।
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एलएनसीआरएनए
लंबे गैर-कोडिंग आरएनए (lncRNA) एक प्रकार के टेप हैं जिनकी लंबाई 200 एनटी से अधिक होती है, जो प्रोटीन को कोड करने में असमर्थ होते हैं।संचयी साक्ष्य बताते हैं कि अधिकांश lncRNAs के क्रियाशील होने की बहुत संभावना है।उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण प्रौद्योगिकियां और जैव सूचनात्मक विश्लेषण उपकरण हमें lncRNA अनुक्रम और स्थिति जानकारी को अधिक कुशलता से प्रकट करने और महत्वपूर्ण नियामक कार्यों के साथ lncRNAs की खोज करने के लिए प्रेरित करते हैं।BMKCloud को हमारे ग्राहकों को तेज़, विश्वसनीय और लचीला lncRNA विश्लेषण प्राप्त करने के लिए lncRNA अनुक्रमण विश्लेषण मंच प्रदान करने पर गर्व है।
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जीडब्ल्यूएएस
जीनोम-वाइड एसोसिएशन स्टडी (GWAS) का उद्देश्य विशिष्ट लक्षणों (फेनोटाइप) से जुड़े आनुवंशिक वेरिएंट (जीनोटाइप) की पहचान करना है।जीडब्ल्यूए अध्ययन आनुवंशिक मार्करों की जांच करता है जो बड़ी संख्या में व्यक्तियों के पूरे जीनोम को पार करते हैं और जनसंख्या स्तर पर सांख्यिकीय विश्लेषण द्वारा जीनोटाइप-फेनोटाइप संघों की भविष्यवाणी करते हैं।संपूर्ण-जीनोम पुनरुत्पादन संभावित रूप से सभी आनुवंशिक रूपों की खोज कर सकता है।फेनोटाइपिक डेटा के साथ युग्मन, जीडब्ल्यूएएस को फेनोटाइप से संबंधित एसएनपी, क्यूटीएल और उम्मीदवार जीन की पहचान करने के लिए संसाधित किया जा सकता है, जो आधुनिक पशु / पौधों के प्रजनन का दृढ़ता से समर्थन करता है।SLAF एक स्व-विकसित सरलीकृत जीनोम अनुक्रमण रणनीति है, जो जीनोम-वाइड वितरित मार्कर, SNP की खोज करती है।आणविक आनुवंशिक मार्कर के रूप में इन एसएनपी को लक्षित लक्षणों के साथ संबद्ध अध्ययन के लिए संसाधित किया जा सकता है।आनुवंशिक विविधताओं से जुड़े जटिल लक्षणों की पहचान करने में यह एक लागत प्रभावी रणनीति है।
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नैनोपोर फुल-लेंथ ट्रांसक्रिपटॉमिक्स
जीवों में जटिल और परिवर्तनशील वैकल्पिक आइसोफॉर्म जीन अभिव्यक्ति और प्रोटीन विविधता को विनियमित करने के लिए महत्वपूर्ण आनुवंशिक तंत्र हैं।प्रतिलेख संरचनाओं की सटीक पहचान जीन अभिव्यक्ति विनियमन पैटर्न के गहन अध्ययन का आधार है।नैनोपोर सीक्वेंसिंग प्लेटफॉर्म ने ट्रांसक्रिपटामिक अध्ययन को आइसोफॉर्म-स्तर पर सफलतापूर्वक लाया है।यह विश्लेषण मंच संदर्भ जीनोम के आधार पर नैनोपोर प्लेटफॉर्म पर उत्पन्न आरएनए-सीक्यू डेटा का विश्लेषण करने के लिए डिज़ाइन किया गया है, जो जीन स्तर और टेप स्तर दोनों में गुणात्मक और मात्रात्मक विश्लेषण प्राप्त करता है।
