सर्क आरएनए अनुक्रमण-इलुमिना
विशेषताएँ
● rRNA का अपघटन और उसके बाद दिशात्मक लाइब्रेरी का निर्माण, जिससे स्ट्रैंड-विशिष्ट अनुक्रमण डेटा प्राप्त होता है।
● बायोइन्फॉर्मेटिक वर्कफ़्लो सर्क RNA की भविष्यवाणी और अभिव्यक्ति मात्रा निर्धारण को सक्षम बनाता है।
सेवा के लाभ
●व्यापक विशेषज्ञताहमने विविध प्रकार के नमूनों सहित 20,000 से अधिक नमूनों का प्रसंस्करण किया है, हम प्रत्येक परियोजना में विशेषज्ञता का खजाना लेकर आते हैं।
●कठोर गुणवत्ता नियंत्रणहम नमूना तैयार करने से लेकर लाइब्रेरी तैयार करने, अनुक्रमण और जैवसूचना विज्ञान तक, सभी चरणों में मुख्य नियंत्रण बिंदुओं को लागू करते हैं। हमारी सावधानीपूर्वक निगरानी से लगातार उच्च गुणवत्ता वाले परिणाम सुनिश्चित होते हैं।
●अधिक व्यापक आरएनए लाइब्रेरी:हम अपनी प्री-लाइब्रेरी तैयारी में लीनियर आरएनए डिप्लीशन के बजाय आरआरएनए डिप्लीशन का उपयोग करते हैं, यह सुनिश्चित करते हुए कि अनुक्रमण डेटा में न केवल सर्कुलर आरएनए बल्कि एमआरएनए और एलएनसीआरएनए भी शामिल हैं, जिससे इन डेटासेट का संयुक्त विश्लेषण संभव हो पाता है।
●प्रतिस्पर्धी अंतर्जात आरएनए (ceRNA) नेटवर्क का वैकल्पिक विश्लेषणकोशिकीय नियामक तंत्रों के बारे में गहन जानकारी प्रदान करना।
● बिक्री के बाद सहायताहम समझते हैं कि उपस्थित रहना कितना महत्वपूर्ण है, इसीलिए हमारी प्रतिबद्धता परियोजना पूर्ण होने के बाद भी 3 महीने की बिक्रीोत्तर सेवा अवधि तक विस्तारित है। इस दौरान, हम परियोजना का फॉलो-अप, समस्या निवारण सहायता और परिणामों से संबंधित किसी भी प्रश्न के समाधान के लिए प्रश्नोत्तर सत्र प्रदान करते हैं।
नमूना संबंधी आवश्यकताएँ और वितरण
| पुस्तकालय | प्लैटफ़ॉर्म | अनुशंसित डेटा | डेटा क्यूसी |
| rRNA रहित दिशात्मक पुस्तकालय | इलुमिना PE150 | 16-20 जीबी | Q30≥85% |
नमूना आवश्यकताएँ:
न्यूक्लियोटाइड:
| सांद्रता (एनजी/एमएल) | मात्रा (मिग्रा) | पवित्रता | अखंडता |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 जेल पर प्रोटीन या डीएनए की संदूषण की मात्रा बहुत कम या न के बराबर दिखाई दी। | आरआईएन≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; सीमित या कोई आधारभूत उन्नयन नहीं |
● पौधे:
जड़, तना या पंखुड़ी: 450 मिलीग्राम
पत्ती या बीज: 300 मिलीग्राम
फल: 1.2 ग्राम
● पशु:
हृदय या आंत: 450 मिलीग्राम
आंतरिक अंग या मस्तिष्क: 240 मिलीग्राम
मांसपेशी: 600 मिलीग्राम
हड्डियाँ, बाल या त्वचा: 1.5 ग्राम
● आर्थ्रोपोड्स:
कीड़े-मकोड़े: 9 ग्राम
क्रस्टेशिया: 450 मिलीग्राम
● संपूर्ण रक्त:2 ट्यूब
● कोशिकाएँ: 106 कोशिकाओं
● सीरम और प्लाज्मा: 6 मिलीलीटर
अनुशंसित नमूना वितरण
कंटेनर: 2 मिलीलीटर सेंट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन फॉयल का उपयोग करने की सलाह नहीं दी जाती है)
नमूना लेबलिंग: समूह + प्रतिकृति जैसे A1, A2, A3; B1, B2, B3।
शिपमेंट:
1. ड्राई आइस: नमूनों को बैग में पैक करके ड्राई आइस में दबा देना चाहिए।
2. आरएनएस्टेबल ट्यूब: आरएनए के नमूनों को आरएनए स्थिरीकरण ट्यूब (जैसे, आरएनएस्टेबल®) में सुखाया जा सकता है और कमरे के तापमान पर भेजा जा सकता है।
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिजाइन
नमूना वितरण
आरएनए निष्कर्षण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री पश्चात सेवाएं
बायोइनफॉरमैटिक्स
- डेटा क्यूसी
- जीनोम संरेखण
- सर्क आरएनए पहचान
- सर्क आरएनए अभिव्यक्ति
- विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण
सर्क RNA भविष्यवाणी: गुणसूत्रीय वितरण
अलग-अलग रूप से व्यक्त होने वाले सर्कुलर आरएनए – ज्वालामुखी प्लॉट
भिन्न रूप से व्यक्त होने वाले सर्कुलर आरएनए – पदानुक्रमित क्लस्टरिंग
सर्क RNA के मेजबान जीनों का कार्यात्मक संवर्धन
बीएमकेजीन की सर्क आरएनए अनुक्रमण सेवाओं द्वारा सुगम बनाए गए अनुसंधान संबंधी प्रगति का पता लगाने के लिए प्रकाशनों के एक सुनियोजित संग्रह का उपयोग करें।
वांग, एक्स. एट अल. (2021) 'सीपीएसएफ4 हेपेटोसेल्यूलर कार्सिनोमा में सर्क आरएनए गठन और माइक्रोआरएनए मध्यस्थ जीन साइलेंसिंग को नियंत्रित करता है',ओंकोजीन2021 40:25, 40(25), पृ. 4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
ज़िया, के. एट अल. (2023) 'एक्स ओओ-उत्तरदायी ट्रांसक्रिप्टोम चावल में OsARAB की अभिव्यक्ति को विनियमित करके रोग प्रतिरोधक क्षमता में गोलाकार RNA133 की भूमिका को प्रकट करता है',पादप रोग विज्ञान अनुसंधान, 5(1), पृ. 1–14. doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
वाई, एच. एट अल. (2023) 'सीपीएसएफ3 हेपेटोसेल्यूलर कार्सिनोमा में गोलाकार और रैखिक प्रतिलेखों के संतुलन को नियंत्रित करता है'। doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
झांग, वाई. एट अल. (2023) 'लिवर प्रत्यारोपण से पहले और बाद में सिरोसिस कार्डियोमायोपैथी में सर्क आरएनए का व्यापक मूल्यांकन'अंतर्राष्ट्रीय इम्यूनोफार्माकोलॉजी, 114, पृ. 109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
